MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007384	GAA	2	6	2809810	2809815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_007384	TCA	2	6	2810604	2810609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_007384	TCTG	2	8	2810618	2810625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11004	NC_007384	TAA	2	6	2810649	2810654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_007384	TTG	2	6	2810702	2810707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_007384	AGGA	2	8	2811055	2811062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_007384	AGC	2	6	2811089	2811094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_007384	TTG	2	6	2811109	2811114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_007384	AAC	2	6	2811125	2811130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_007384	AGG	2	6	2811189	2811194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_007384	GCT	2	6	2811204	2811209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_007384	GGA	2	6	2811221	2811226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_007384	ACT	2	6	2811293	2811298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_007384	TGG	2	6	2811303	2811308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_007384	CCG	2	6	2811543	2811548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_007384	GTG	2	6	2812759	2812764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_007384	AAC	2	6	2812780	2812785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_007384	TTTG	2	8	2812880	2812887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_007384	ATTTCT	2	12	2812978	2812989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11020	NC_007384	T	6	6	2813064	2813069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_007384	AAC	2	6	2813787	2813792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_007384	TCTT	2	8	2813849	2813856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11023	NC_007384	GAT	2	6	2813898	2813903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_007384	ATG	2	6	2815661	2815666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_007384	TTATTG	2	12	2815682	2815693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_007384	ATT	3	9	2815694	2815702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_007384	TGT	2	6	2815718	2815723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_007384	AAAG	2	8	2815752	2815759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_007384	ATT	2	6	2815785	2815790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_007384	TAA	2	6	2815792	2815797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_007384	TGG	2	6	2815802	2815807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_007384	TATTT	2	10	2816121	2816130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_007384	TTA	2	6	2816210	2816215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_007384	GTT	2	6	2816291	2816296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_007384	TATTTT	2	12	2816346	2816357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_007384	GTG	2	6	2816417	2816422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11038	NC_007384	TTC	2	6	2816541	2816546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_007384	TAT	2	6	2816603	2816608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_007384	A	6	6	2816670	2816675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_007384	TCT	2	6	2816696	2816701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_007384	AAT	2	6	2816708	2816713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_007384	ATT	2	6	2816725	2816730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_007384	GCT	2	6	2816766	2816771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_007384	ATT	2	6	2816776	2816781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_007384	AT	3	6	2816784	2816789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_007384	TAGA	2	8	2816816	2816823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_007384	CAAT	2	8	2816842	2816849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11049	NC_007384	ATT	2	6	2816872	2816877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_007384	AAT	2	6	2816878	2816883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_007384	ATC	2	6	2816904	2816909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_007384	ACTA	2	8	2816947	2816954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11053	NC_007384	CA	3	6	2816963	2816968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_007384	CAAT	2	8	2816992	2816999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_007384	AT	3	6	2817008	2817013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_007384	ATC	2	6	2817027	2817032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_007384	TCA	2	6	2817035	2817040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_007384	ATG	2	6	2817150	2817155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_007384	GTT	2	6	2817185	2817190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_007384	GGT	2	6	2817211	2817216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_007384	GAT	2	6	2817322	2817327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_007384	CA	3	6	2817364	2817369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_007384	CAG	2	6	2817389	2817394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_007384	AGC	2	6	2817445	2817450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_007384	AGGA	2	8	2817483	2817490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_007384	CTG	2	6	2817498	2817503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_007384	GCC	2	6	2817506	2817511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_007384	GTT	2	6	2817521	2817526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_007384	TGC	2	6	2817541	2817546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_007384	CTC	2	6	2817608	2817613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11071	NC_007384	AAG	2	6	2817615	2817620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_007384	A	6	6	2817640	2817645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_007384	AAT	2	6	2818623	2818628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_007384	GA	3	6	2818672	2818677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_007384	AC	3	6	2818711	2818716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11077	NC_007384	T	6	6	2818798	2818803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_007384	T	6	6	2818818	2818823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_007384	AG	3	6	2818829	2818834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_007384	GTGTA	2	10	2818914	2818923	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_007384	AAAC	2	8	2818934	2818941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11082	NC_007384	CTGG	2	8	2818991	2818998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_007384	A	6	6	2819072	2819077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_007384	GC	3	6	2819660	2819665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11085	NC_007384	C	6	6	2819672	2819677	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11086	NC_007384	GCCG	2	8	2819678	2819685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11089	NC_007384	ATA	2	6	2819840	2819845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_007384	TTG	2	6	2819881	2819886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_007384	CATT	2	8	2819904	2819911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11092	NC_007384	TAAT	2	8	2819928	2819935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_007384	GAT	2	6	2820863	2820868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11095	NC_007384	TGC	2	6	2821009	2821014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_007384	CTT	2	6	2821039	2821044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_007384	AATTT	2	10	2821675	2821684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_007384	A	6	6	2821727	2821732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_007384	TAAT	2	8	2821752	2821759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_007384	TTA	2	6	2821782	2821787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_007384	TC	3	6	2824104	2824109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11102	NC_007384	G	6	6	2825317	2825322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_007384	A	6	6	2825323	2825328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_007384	CGC	2	6	2825411	2825416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11107	NC_007384	ATT	2	6	2825571	2825576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11109	NC_007384	ATT	2	6	2825676	2825681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_007384	CAG	2	6	2825733	2825738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_007384	T	6	6	2825795	2825800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_007384	ATT	2	6	2825829	2825834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_007384	GTT	2	6	2825845	2825850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_007384	T	6	6	2825849	2825854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_007384	ACG	2	6	2825882	2825887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_007384	ATA	2	6	2825977	2825982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_007384	ATTT	2	8	2825990	2825997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_007384	GCC	2	6	2826063	2826068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11119	NC_007384	CGC	2	6	2826207	2826212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11120	NC_007384	GTTC	2	8	2826249	2826256	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11121	NC_007384	TC	4	8	2826268	2826275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_007384	TTTG	2	8	2826295	2826302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_007384	GCA	2	6	2826310	2826315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_007384	CGG	2	6	2827732	2827737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_007384	CAG	2	6	2827842	2827847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_007384	GTC	2	6	2827854	2827859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_007384	AGA	2	6	2827860	2827865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_007384	CAG	2	6	2828292	2828297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11130	NC_007384	CT	3	6	2828449	2828454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11131	NC_007384	GAA	2	6	2828455	2828460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11161	NC_007384	CATT	2	8	2832766	2832773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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