MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007384	GTT	2	6	1580415	1580420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_007384	TAA	2	6	1580461	1580466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_007384	CG	3	6	1580471	1580476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_007384	GCG	2	6	1580495	1580500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_007384	GCA	2	6	1580538	1580543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_007384	CAAA	2	8	1580556	1580563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_007384	A	7	7	1580561	1580567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_007384	GC	3	6	1580605	1580610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_007384	TCA	2	6	1580621	1580626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_007384	ATA	2	6	1580729	1580734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_007384	TCA	2	6	1580750	1580755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_007384	CGTTG	2	10	1580805	1580814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_007384	TCAA	2	8	1580819	1580826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_007384	TCT	2	6	1580852	1580857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_007384	GCCA	2	8	1580858	1580865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_007384	GAA	2	6	1580910	1580915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_007384	ATC	2	6	1580924	1580929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_007384	CAC	2	6	1580961	1580966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_007384	CACC	2	8	1581111	1581118	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6020	NC_007384	CGC	2	6	1581119	1581124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_007384	TTC	2	6	1581136	1581141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_007384	TAA	2	6	1581151	1581156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_007384	CAA	2	6	1581205	1581210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_007384	AGCGT	2	10	1581317	1581326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6025	NC_007384	CATC	2	8	1581402	1581409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_007384	CGG	2	6	1581414	1581419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_007384	TGC	2	6	1581428	1581433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_007384	GCG	2	6	1581456	1581461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_007384	GCCT	2	8	1581477	1581484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_007384	GCG	2	6	1581618	1581623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_007384	ATC	2	6	1581635	1581640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_007384	GTT	2	6	1581738	1581743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_007384	GTG	2	6	1581760	1581765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_007384	GCG	2	6	1581875	1581880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_007384	TCA	2	6	1581965	1581970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_007384	AT	3	6	1581986	1581991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_007384	CGGC	2	8	1582010	1582017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_007384	TGC	2	6	1582035	1582040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_007384	CAT	2	6	1582056	1582061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_007384	GCGG	2	8	1582109	1582116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_007384	CCA	2	6	1582142	1582147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_007384	TGC	2	6	1582153	1582158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_007384	GCTG	2	8	1582165	1582172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_007384	AGC	2	6	1582217	1582222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_007384	CAC	2	6	1582257	1582262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_007384	TCA	2	6	1582289	1582294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_007384	CGC	2	6	1582311	1582316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_007384	CG	5	10	1582326	1582335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_007384	GTG	2	6	1582367	1582372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_007384	CGG	2	6	1582384	1582389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_007384	TGC	2	6	1582404	1582409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_007384	CGC	2	6	1582467	1582472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_007384	GCC	3	9	1582473	1582481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_007384	CGC	2	6	1582605	1582610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_007384	TGC	2	6	1582645	1582650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_007384	CGC	2	6	1582702	1582707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_007384	GAA	2	6	1582755	1582760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_007384	TCA	2	6	1582901	1582906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_007384	GC	3	6	1583596	1583601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_007384	TGT	2	6	1584112	1584117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_007384	GCG	2	6	1584127	1584132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_007384	CGC	2	6	1584139	1584144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_007384	GTC	2	6	1585267	1585272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_007384	A	6	6	1585280	1585285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_007384	CTC	2	6	1586251	1586256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_007384	GCC	2	6	1587194	1587199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_007384	AT	3	6	1590913	1590918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_007384	TAA	2	6	1590929	1590934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_007384	GCA	2	6	1590999	1591004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_007384	TGC	2	6	1591029	1591034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_007384	ATA	2	6	1591054	1591059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_007384	AAACA	2	10	1592174	1592183	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6073	NC_007384	ATG	2	6	1592187	1592192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_007384	ATT	2	6	1592193	1592198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_007384	TAC	2	6	1592217	1592222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_007384	GTG	2	6	1592276	1592281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_007384	AGGG	2	8	1593476	1593483	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_007384	A	6	6	1593528	1593533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_007384	TCAA	2	8	1593580	1593587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6080	NC_007384	GCG	2	6	1593862	1593867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_007384	TA	3	6	1594673	1594678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_007384	CTT	2	6	1597142	1597147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_007384	GC	3	6	1597156	1597161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_007384	CAG	2	6	1597367	1597372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_007384	TAA	2	6	1598134	1598139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_007384	T	6	6	1598870	1598875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_007384	GA	3	6	1598939	1598944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_007384	A	8	8	1599025	1599032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_007384	T	7	7	1600591	1600597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_007384	A	6	6	1600638	1600643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_007384	TAA	2	6	1600721	1600726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_007384	A	6	6	1600795	1600800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_007384	T	6	6	1600813	1600818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_007384	CACTG	2	10	1600819	1600828	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6095	NC_007384	GT	3	6	1600945	1600950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_007384	ATT	2	6	1600959	1600964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_007384	GAAT	2	8	1601020	1601027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_007384	A	7	7	1601044	1601050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_007384	TGA	2	6	1601091	1601096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_007384	CAT	2	6	1601113	1601118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_007384	AAAG	2	8	1601149	1601156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_007384	A	6	6	1607599	1607604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_007384	GCC	2	6	1607605	1607610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_007384	TAT	2	6	1607611	1607616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_007384	ACA	2	6	1607637	1607642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_007384	TTA	2	6	1608150	1608155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_007384	TAAT	2	8	1608417	1608424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_007384	TGA	2	6	1608440	1608445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_007384	TTA	2	6	1608475	1608480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_007384	AAT	2	6	1608482	1608487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_007384	CAA	2	6	1608569	1608574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_007384	ATA	2	6	1608586	1608591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_007384	GCA	2	6	1608638	1608643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_007384	TGT	2	6	1608673	1608678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_007384	CGCCA	2	10	1608723	1608732	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6116	NC_007384	AGA	2	6	1608733	1608738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_007384	TC	3	6	1608803	1608808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_007384	TTGA	2	8	1608809	1608816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_007384	AAT	2	6	1608850	1608855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_007384	T	8	8	1608921	1608928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_007384	ACA	2	6	1608941	1608946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_007384	TTA	2	6	1608965	1608970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_007384	CAT	2	6	1609008	1609013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_007384	ATGG	2	8	1610079	1610086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_007384	CCAT	2	8	1610098	1610105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_007384	T	6	6	1611193	1611198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_007384	CTC	2	6	1613998	1614003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_007384	ATA	2	6	1614092	1614097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_007384	ATAA	2	8	1614109	1614116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_007384	CT	3	6	1615196	1615201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6132	NC_007384	CA	3	6	1615257	1615262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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