MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007384	AT	3	6	1252238	1252243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_007384	TAA	2	6	1252276	1252281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_007384	CGGG	2	8	1252310	1252317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_007384	TTCTA	2	10	1252389	1252398	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4505	NC_007384	T	7	7	1252399	1252405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_007384	CTG	2	6	1252427	1252432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_007384	CGT	2	6	1252439	1252444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_007384	CAG	2	6	1252487	1252492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_007384	CTG	2	6	1252535	1252540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_007384	TA	3	6	1252558	1252563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_007384	ATT	2	6	1252586	1252591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_007384	CT	3	6	1253018	1253023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_007384	GGT	2	6	1253088	1253093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_007384	AAT	2	6	1253104	1253109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_007384	CAAA	2	8	1253178	1253185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_007384	TCG	2	6	1253196	1253201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_007384	TGTGG	2	10	1253203	1253212	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_007384	AGC	2	6	1253221	1253226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_007384	GAA	2	6	1253275	1253280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_007384	TGA	2	6	1253310	1253315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_007384	CTGA	2	8	1253356	1253363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_007384	A	7	7	1253469	1253475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_007384	G	8	8	1253490	1253497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_007384	CCTGA	2	10	1254803	1254812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4525	NC_007384	CCA	2	6	1254837	1254842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_007384	C	6	6	1254858	1254863	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4527	NC_007384	GAC	2	6	1254872	1254877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_007384	CTGG	2	8	1254901	1254908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_007384	GTG	2	6	1254947	1254952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_007384	CGG	2	6	1255025	1255030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_007384	A	6	6	1255037	1255042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_007384	GAA	2	6	1255172	1255177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_007384	GCG	2	6	1255280	1255285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_007384	TTA	2	6	1255332	1255337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_007384	TTA	2	6	1255366	1255371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_007384	CTG	2	6	1255394	1255399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_007384	CAG	2	6	1255414	1255419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_007384	CGC	2	6	1255432	1255437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_007384	TCAG	2	8	1255512	1255519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_007384	TGA	2	6	1255578	1255583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_007384	CAA	3	9	1255649	1255657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_007384	CAC	2	6	1255683	1255688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_007384	AAAT	2	8	1255724	1255731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_007384	A	6	6	1255743	1255748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_007384	ATTC	2	8	1256349	1256356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_007384	CCA	2	6	1256363	1256368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_007384	GCA	2	6	1256373	1256378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_007384	GTT	2	6	1256444	1256449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_007384	CTTAC	2	10	1258003	1258012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4550	NC_007384	ATG	2	6	1258022	1258027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_007384	CAGG	2	8	1258058	1258065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_007384	TCT	2	6	1258129	1258134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_007384	ATG	2	6	1258169	1258174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_007384	G	6	6	1258965	1258970	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_007384	T	6	6	1258971	1258976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_007384	GTT	2	6	1258977	1258982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_007384	TTG	2	6	1260529	1260534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_007384	CT	3	6	1260541	1260546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_007384	T	7	7	1260605	1260611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_007384	TTA	2	6	1260624	1260629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_007384	CAG	2	6	1260687	1260692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_007384	A	6	6	1260751	1260756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_007384	AAT	2	6	1260768	1260773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_007384	ATT	3	9	1260805	1260813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_007384	TTG	2	6	1263226	1263231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_007384	TCT	2	6	1263253	1263258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_007384	A	8	8	1263265	1263272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_007384	CATC	2	8	1263274	1263281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_007384	GTT	2	6	1263301	1263306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_007384	ACGCTT	2	12	1263402	1263413	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_007384	TTG	2	6	1263416	1263421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_007384	ACTCGA	2	12	1263422	1263433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_007384	TTCAA	2	10	1263506	1263515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4574	NC_007384	GAC	2	6	1263539	1263544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_007384	CAGGCT	2	12	1263554	1263565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_007384	CGGT	2	8	1265348	1265355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_007384	TA	3	6	1265378	1265383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_007384	CTGA	2	8	1267816	1267823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4579	NC_007384	T	6	6	1267882	1267887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_007384	TGT	2	6	1267891	1267896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_007384	TCCT	2	8	1268239	1268246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_007384	ACA	2	6	1268593	1268598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_007384	TTA	2	6	1268647	1268652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_007384	CAGA	2	8	1268676	1268683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4585	NC_007384	TGA	2	6	1268692	1268697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_007384	TGC	2	6	1269500	1269505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_007384	GGCGCA	2	12	1269539	1269550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_007384	CAA	2	6	1269586	1269591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_007384	TGA	2	6	1269605	1269610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_007384	TCA	2	6	1269612	1269617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_007384	TAAAT	2	10	1269842	1269851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_007384	CTG	2	6	1269855	1269860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_007384	CTC	2	6	1269976	1269981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_007384	A	6	6	1270005	1270010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_007384	TCA	2	6	1270904	1270909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_007384	TCTG	2	8	1270918	1270925	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_007384	TAA	2	6	1270949	1270954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_007384	TTG	2	6	1271002	1271007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_007384	AGGA	2	8	1271355	1271362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_007384	TTTA	2	8	1271437	1271444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_007384	T	8	8	1271552	1271559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_007384	GTT	2	6	1271573	1271578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_007384	TTGA	2	8	1271648	1271655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_007384	GAT	2	6	1271717	1271722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_007384	AGAGT	2	10	1271727	1271736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_007384	A	6	6	1271766	1271771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_007384	GA	3	6	1271775	1271780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_007384	CGG	2	6	1273493	1273498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_007384	T	6	6	1273501	1273506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_007384	A	6	6	1273569	1273574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_007384	ATG	2	6	1274394	1274399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_007384	GCA	2	6	1274402	1274407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_007384	GC	3	6	1274467	1274472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_007384	TGC	2	6	1274554	1274559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_007384	TGA	2	6	1274561	1274566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_007384	TGGC	2	8	1274570	1274577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_007384	GGC	2	6	1274597	1274602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_007384	T	6	6	1274648	1274653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_007384	TGC	2	6	1274724	1274729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4621	NC_007384	CCT	2	6	1274799	1274804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_007384	GTG	2	6	1274822	1274827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_007384	TCGT	2	8	1275502	1275509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_007384	ATC	2	6	1275526	1275531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_007384	TGA	2	6	1275578	1275583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_007384	CAC	2	6	1275605	1275610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_007384	CAA	2	6	1275617	1275622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_007384	TCC	2	6	1275690	1275695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_007384	CTGC	2	8	1275699	1275706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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