MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007350	TTAGAA	2	12	15587	15598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007350	TATACT	2	12	26236	26247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007350	AATGTA	2	12	28060	28071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007350	TAATTA	2	12	60197	60208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007350	ATAGAT	2	12	84004	84015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007350	TAAATA	2	12	91333	91344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007350	AATACA	2	12	105058	105069	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007350	AAAGTT	2	12	106876	106887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007350	TTTTAT	2	12	135514	135525	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007350	AATGTT	2	12	136790	136801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007350	GATACA	2	12	151046	151057	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007350	CTATTT	2	12	168912	168923	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007350	TGAAAA	2	12	172284	172295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007350	TCTTTT	2	12	202614	202625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007350	AAATAA	2	12	305221	305232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007350	TTTATA	2	12	323632	323643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007350	GTTAAA	2	12	329280	329291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007350	ATACCG	2	12	350233	350244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007350	CTTATT	2	12	359686	359697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007350	AAAATT	2	12	386905	386916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007350	TTTAAA	2	12	410063	410074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007350	AATGAT	2	12	472321	472332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007350	AGCTAA	2	12	497040	497051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007350	AGCTAA	2	12	497105	497116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007350	ATATAA	2	12	509928	509939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007350	GCTCAT	2	12	514737	514748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007350	TCAAAG	2	12	536661	536672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007350	TAACTT	2	12	536826	536837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007350	AGTTAA	2	12	538308	538319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007350	TAAATA	2	12	542668	542679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007350	GCTTTT	2	12	560416	560427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007350	ATAAGT	2	12	579829	579840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007350	TTATGC	2	12	583559	583570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007350	AAATGC	2	12	593985	593996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007350	TGAAAT	2	12	607245	607256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007350	CATGAT	2	12	608064	608075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007350	TAAGCA	2	12	620492	620503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007350	ATATTT	2	12	623040	623051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007350	GTTTTA	2	12	637192	637203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007350	TTGAAT	2	12	647153	647164	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007350	TGAAAA	2	12	654664	654675	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007350	ACTTAT	2	12	659827	659838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007350	TATTGT	2	12	711190	711201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007350	GATAAT	2	12	727391	727402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007350	AATATA	2	12	736631	736642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007350	GATATT	2	12	739889	739900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007350	TAGGCG	2	12	746957	746968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007350	AACGAT	2	12	761862	761873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007350	GACTTT	2	12	766328	766339	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007350	TTTATA	2	12	796411	796422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007350	AGTGTA	2	12	824129	824140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007350	ATTTAA	2	12	836665	836676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007350	TAGGCG	2	12	844950	844961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007350	CCGAGA	2	12	846685	846696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007350	CCGAGA	2	12	847040	847051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007350	AATTTG	2	12	875547	875558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007350	ATCAAT	2	12	882477	882488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007350	TTGAAA	2	12	884001	884012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007350	TGATAG	2	12	894732	894743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007350	ATAAAG	2	12	931955	931966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007350	TATTAA	2	12	958427	958438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007350	TAGGCG	2	12	963046	963057	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007350	AGGTGT	2	12	966903	966914	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007350	AATAAA	2	12	981985	981996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007350	CTCTAC	2	12	986055	986066	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007350	GTTAAT	2	12	1003615	1003626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007350	TTTTTA	2	12	1004610	1004621	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007350	TTATAC	2	12	1017320	1017331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007350	TTTAAA	2	12	1032888	1032899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007350	TATTAA	2	12	1048478	1048489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007350	GGAAAA	2	12	1075867	1075878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007350	AATAAA	2	12	1112827	1112838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007350	ATAAAT	2	12	1120188	1120199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007350	GATATA	2	12	1125854	1125865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007350	TAAATC	2	12	1128736	1128747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007350	AATTTC	2	12	1136234	1136245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007350	TAAATA	2	12	1137665	1137676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007350	TATTTT	2	12	1139182	1139193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007350	TAAATT	2	12	1154275	1154286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007350	TTTGTA	2	12	1157673	1157684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007350	ATTTTT	2	12	1168993	1169004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007350	AAGTCA	2	12	1223684	1223695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007350	ACAATT	2	12	1277250	1277261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007350	TTGTAT	2	12	1287172	1287183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007350	AGAAAG	2	12	1287336	1287347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007350	GCAGTA	2	12	1317030	1317041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007350	CTTTTT	2	12	1317418	1317429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007350	ATTTTT	2	12	1320158	1320169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007350	TATAAT	2	12	1345238	1345249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007350	TTAGAA	2	12	1376266	1376277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007350	AAATAT	2	12	1404745	1404756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007350	ATTGAT	2	12	1426888	1426899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007350	TATAAT	2	12	1439774	1439785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007350	TTATCT	2	12	1447461	1447472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007350	TATCAT	2	12	1454691	1454702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007350	ATATAG	2	12	1455220	1455231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007350	CTCTTT	2	12	1482766	1482777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007350	ACATTT	2	12	1534439	1534450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007350	TTTATA	2	12	1572558	1572569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007350	ATAAAT	2	12	1577001	1577012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007350	TTTTGT	2	12	1579232	1579243	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007350	AAAATT	2	12	1584668	1584679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007350	TATTTA	2	12	1614612	1614623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007350	TTTTAT	2	12	1673572	1673583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007350	ATTTCA	2	12	1694965	1694976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007350	AATTGA	2	12	1722656	1722667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007350	ATATTT	2	12	1726382	1726393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007350	ATTTTT	2	12	1746649	1746660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007350	TGAGAC	2	12	1760201	1760212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007350	GTCCCA	2	12	1760223	1760234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007350	TTTTTA	2	12	1766872	1766883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007350	TATTAA	2	12	1774270	1774281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007350	TATTTA	2	12	1778377	1778388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007350	TTAAAT	2	12	1780666	1780677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007350	TGTTAA	2	12	1795160	1795171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007350	AAATAT	2	12	1807000	1807011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007350	AATATT	2	12	1817960	1817971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007350	ATTAAA	2	12	1862276	1862287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007350	TATAAA	2	12	1871211	1871222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007350	TTTAAT	2	12	1873664	1873675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007350	TTTGAC	2	12	1877017	1877028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007350	ATTAAA	2	12	1945644	1945655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007350	TGTAGT	2	12	1945800	1945811	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007350	AATAAG	2	12	1953192	1953203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007350	TACTTA	2	12	1953470	1953481	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007350	ATTTTA	2	12	1954673	1954684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007350	TTTTCA	2	12	1960935	1960946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007350	TTAAAA	2	12	1961845	1961856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007350	TTTTAT	2	12	1991857	1991868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007350	AATCAA	2	12	1992084	1992095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_007350	AAGTTT	2	12	1995268	1995279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_007350	TTAACT	2	12	2078260	2078271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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154	NC_007350	CGCCTA	2	12	2308150	2308161	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.