MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007297	AGTGTA	2	12	21850	21861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007297	ACTAAT	2	12	21878	21889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007297	AGTGTA	2	12	27851	27862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007297	ACTAAT	2	12	27879	27890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007297	TATTTT	2	12	64722	64733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007297	AGTGTA	2	12	84657	84668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007297	ACTAAT	2	12	84685	84696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007297	TTCGGG	2	12	85627	85638	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007297	ATAAAA	2	12	112784	112795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007297	AGATAA	2	12	134823	134834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007297	CTTTAT	2	12	160508	160519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007297	CTCTTT	2	12	162372	162383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007297	TGACAC	2	12	189235	189246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007297	CAGTTC	2	12	193874	193885	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007297	TTTAAA	2	12	195723	195734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007297	AGTGTA	2	12	269776	269787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007297	ACTAAT	2	12	269804	269815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007297	TTAAAA	2	12	291535	291546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007297	TTTAAT	2	12	308612	308623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007297	TTTTAG	2	12	321281	321292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007297	AAGACC	2	12	336424	336435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007297	GCTTTG	2	12	350083	350094	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007297	ATTTAA	2	12	371237	371248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007297	GTTAAA	2	12	396574	396585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007297	AGAAAT	2	12	405782	405793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007297	ATTTTA	2	12	437067	437078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007297	GAGTAA	2	12	442856	442867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007297	AGGACT	2	12	463895	463906	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007297	TAAAAA	2	12	483304	483315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007297	AAAAGA	2	12	483487	483498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007297	CCTTGT	2	12	559609	559620	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007297	TAAATA	2	12	673545	673556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007297	AGGTAA	2	12	684345	684356	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007297	TTCGGG	2	12	719418	719429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007297	GAAAAA	2	12	773227	773238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007297	TTATCA	2	12	807241	807252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007297	TTAAAA	2	12	847843	847854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007297	TAACAA	2	12	900210	900221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007297	TTTAAA	2	12	962082	962093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007297	TTGTTT	2	12	1029459	1029470	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007297	ATATGA	2	12	1063018	1063029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007297	AGTCTT	2	12	1079065	1079076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007297	TCTTTT	2	12	1106333	1106344	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007297	CCTTGG	2	12	1138335	1138346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007297	AAATTT	2	12	1176248	1176259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007297	TGACTT	2	12	1194878	1194889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007297	ATGATA	2	12	1201385	1201396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007297	TAGAAT	2	12	1211229	1211240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007297	AGCAGA	2	12	1239905	1239916	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007297	TCCTTC	2	12	1280818	1280829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007297	TATTAG	2	12	1286294	1286305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007297	TACACT	2	12	1286323	1286334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007297	GAAAAA	2	12	1291762	1291773	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007297	CAATTC	2	12	1310851	1310862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007297	TATTTT	2	12	1311925	1311936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007297	AATACC	2	12	1320943	1320954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007297	CTTTTC	2	12	1371317	1371328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007297	ATATTT	2	12	1413742	1413753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007297	GGTTTT	2	12	1413904	1413915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007297	AACAAT	2	12	1434329	1434340	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007297	ATTCCA	2	12	1463172	1463183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007297	CTAGTC	2	12	1514420	1514431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007297	AATATT	2	12	1532928	1532939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007297	TATCAC	2	12	1543418	1543429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007297	TTTGCT	2	12	1548673	1548684	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007297	TAACAA	2	12	1563946	1563957	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007297	TTTTTC	2	12	1566332	1566343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007297	AGAAAA	2	12	1569027	1569038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007297	TATTAG	2	12	1575357	1575368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007297	TACACT	2	12	1575386	1575397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007297	GTTAAA	2	12	1590522	1590533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007297	TTTTAT	2	12	1602714	1602725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007297	ATGTTT	2	12	1602920	1602931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007297	TTTTCA	2	12	1622224	1622235	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007297	TTAATA	2	12	1755465	1755476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007297	ATTTTA	2	12	1765889	1765900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007297	TTTTCA	2	12	1773083	1773094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007297	TAAAAA	2	12	1785063	1785074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007297	AATTTA	3	18	1796534	1796551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007297	GAAAAA	2	12	1834284	1834295	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.