MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS5005 chromosome

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007297	ACATT	2	10	16491	16500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007297	TCGTG	2	10	18111	18120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007297	GTTAA	2	10	19007	19016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007297	GGGAG	2	10	19526	19535	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007297	AGGGA	2	10	21737	21746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007297	GCTTA	2	10	22103	22112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007297	TCGTG	2	10	24112	24121	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007297	GTTAA	2	10	25008	25017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007297	GGGAG	2	10	25527	25536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007297	AGGGA	2	10	27738	27747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007297	GCTTA	2	10	28104	28113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007297	TTCTT	2	10	29907	29916	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007297	CTTTT	2	10	30013	30022	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007297	TATAA	2	10	32451	32460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007297	ATTTT	2	10	61206	61215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007297	AAATA	2	10	62473	62482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007297	TATAT	2	10	62558	62567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007297	AAGGA	2	10	70390	70399	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007297	GTTTC	2	10	77658	77667	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007297	TCGTG	2	10	80918	80927	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007297	GTTAA	2	10	81814	81823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007297	GGGAG	2	10	82333	82342	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007297	AGGGA	2	10	84544	84553	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007297	GCTTA	2	10	84910	84919	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007297	ATTAT	2	10	85200	85209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007297	TATAT	2	10	85283	85292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007297	AGAAA	2	10	110525	110534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007297	TTTAG	2	10	110794	110803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007297	TTAAG	2	10	115547	115556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007297	ATGAT	2	10	117319	117328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007297	TAGTG	2	10	128911	128920	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007297	TTGGC	2	10	134449	134458	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007297	CTTAA	2	10	134648	134657	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007297	AAGCT	2	10	153916	153925	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007297	AAGCA	2	10	153963	153972	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007297	CTTTT	2	10	155128	155137	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007297	ATTAT	2	10	155459	155468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007297	CGTCA	2	10	160271	160280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007297	AACAA	2	10	162010	162019	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007297	AAAAG	2	10	176498	176507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007297	TCTAA	2	10	190739	190748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007297	TTAAA	2	10	195521	195530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007297	TAAGA	2	10	207469	207478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007297	GTAAA	2	10	210611	210620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007297	CTTTT	2	10	219730	219739	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007297	GTTCA	2	10	227827	227836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007297	TCATT	2	10	257409	257418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007297	TTGTA	2	10	264032	264041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007297	TCGTG	2	10	266037	266046	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007297	GTTAA	2	10	266933	266942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007297	GGGAG	2	10	267452	267461	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007297	AGGGA	2	10	269663	269672	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007297	TTATC	2	10	271139	271148	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007297	GTTAT	2	10	280852	280861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007297	TAGCA	2	10	280996	281005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007297	ATTAT	2	10	285436	285445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007297	ATTAT	2	10	285573	285582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007297	TGTGT	2	10	298825	298834	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007297	AAAAG	2	10	307221	307230	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007297	TGCTA	2	10	319769	319778	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007297	CAGGG	2	10	319789	319798	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007297	TAAAA	2	10	325435	325444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007297	ACAAG	2	10	343157	343166	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007297	TTGAT	2	10	349889	349898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007297	AGTAG	2	10	353693	353702	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007297	TGAAA	2	10	358870	358879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007297	TATCA	2	10	361949	361958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007297	TAAGA	2	10	363620	363629	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007297	TGAGA	2	10	366047	366056	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007297	TTGAT	2	10	366070	366079	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007297	TTTAT	2	10	375633	375642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007297	AAATC	2	10	379388	379397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007297	AGAAA	2	10	382501	382510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007297	AAGGA	2	10	391174	391183	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007297	ACTCT	2	10	393419	393428	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007297	AAGTA	2	10	394124	394133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007297	AGAGT	2	10	394211	394220	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007297	AAAGC	2	10	399702	399711	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007297	AGCTT	2	10	424361	424370	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007297	TTTTC	2	10	424405	424414	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007297	TTATT	2	10	457545	457554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007297	GTTAT	2	10	479912	479921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007297	TTTCC	2	10	481479	481488	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007297	AGAAA	2	10	481617	481626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007297	TTAGT	2	10	486032	486041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007297	TATAA	2	10	487062	487071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007297	CTTTT	2	10	496352	496361	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007297	ATGGG	2	10	499758	499767	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007297	TTTAG	2	10	499801	499810	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007297	TAGAA	2	10	501500	501509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007297	TAAAA	2	10	502107	502116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007297	TTTCC	2	10	507874	507883	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_007297	AAAAG	2	10	507884	507893	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007297	TTAAT	2	10	512031	512040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007297	TGATC	2	10	515394	515403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007297	AGCTG	2	10	516603	516612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007297	GAATT	2	10	516688	516697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007297	ATAAA	2	10	517982	517991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007297	TTTTG	2	10	520851	520860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007297	AAGCC	2	10	521838	521847	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007297	TGTTT	2	10	522800	522809	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007297	TGATA	2	10	531470	531479	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007297	ACGTA	2	10	541143	541152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007297	TAAAT	2	10	541799	541808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007297	AGGAA	2	10	542001	542010	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007297	AAAAG	2	10	568421	568430	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007297	ATAAA	2	10	572257	572266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007297	GAATA	2	10	575613	575622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007297	ATAGA	2	10	584736	584745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007297	AGCAC	2	10	591367	591376	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007297	TATAA	2	10	592452	592461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007297	AGCAT	2	10	601132	601141	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007297	GAAAG	2	10	604385	604394	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007297	ATTTA	2	10	638066	638075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007297	AAAGA	2	10	641148	641157	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007297	TCTTT	2	10	641202	641211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007297	AAATA	2	10	641229	641238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007297	TTCGG	2	10	652313	652322	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007297	AAAAG	2	10	654210	654219	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007297	CACTT	2	10	655345	655354	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007297	TTTTA	2	10	673249	673258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007297	ATGTT	2	10	678140	678149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007297	TTTTA	2	10	678266	678275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007297	AAAGG	2	10	701926	701935	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007297	ATTGA	2	10	701953	701962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007297	ATGTT	2	10	707098	707107	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007297	TCTTA	2	10	708786	708795	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007297	AGAAT	2	10	717925	717934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007297	CTAAT	2	10	719461	719470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007297	CATCT	2	10	721830	721839	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007297	ATAAA	2	10	723848	723857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007297	GGAAA	2	10	739771	739780	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007297	TAAGG	2	10	753060	753069	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007297	CACCT	2	10	755283	755292	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_007297	ATGAT	2	10	765468	765477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007297	TAGAA	2	10	772944	772953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007297	ATTTA	2	10	773306	773315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007297	AACAA	4	20	782308	782327	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007297	ATAAA	2	10	785120	785129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007297	AAATA	2	10	792173	792182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007297	TAAAA	2	10	796998	797007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007297	AATGT	2	10	797668	797677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007297	TTGAA	2	10	803480	803489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007297	AATAA	2	10	813707	813716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007297	TCAAA	2	10	833155	833164	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007297	CAAAA	2	10	864158	864167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007297	TAAGA	2	10	870114	870123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007297	CTTGT	2	10	877266	877275	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_007297	CTTTT	2	10	1836358	1836367	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.