MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007181	CATAAA	2	12	28053	28064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007181	TTTCTC	2	12	68512	68523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007181	GTTCAT	2	12	72503	72514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007181	TAAAAC	2	12	85083	85094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007181	ATAAAT	2	12	109633	109644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007181	TATATT	2	12	109888	109899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007181	ATATTT	2	12	130110	130121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007181	AAATAT	2	12	135314	135325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007181	AAAGTA	2	12	138227	138238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007181	GGATGA	2	12	185409	185420	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007181	TTTTAA	2	12	263527	263538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007181	TTTGTT	2	12	288176	288187	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007181	AAACAA	2	12	298612	298623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007181	TAAAAT	2	12	342939	342950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007181	TAACTT	2	12	348530	348541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007181	TTACAC	2	12	381794	381805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007181	TGGAGG	2	12	384340	384351	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007181	AAATTA	2	12	384867	384878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007181	TTCTAG	2	12	387602	387613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007181	GAAACA	2	12	404826	404837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007181	CCAACT	2	12	410634	410645	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007181	CAGCTG	2	12	411262	411273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007181	CTTTTC	2	12	413060	413071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007181	AAGACC	2	12	413813	413824	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007181	ATGTTA	2	12	425429	425440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007181	GAGAAA	3	18	425813	425830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007181	GAATAA	2	12	430207	430218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007181	AGCGCT	2	12	505782	505793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007181	AAATAT	2	12	518249	518260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007181	TTTTAT	2	12	579553	579564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007181	ACGCTT	2	12	579882	579893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007181	ATAACG	2	12	582013	582024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007181	AACTCA	2	12	593957	593968	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007181	ATAAGG	2	12	594322	594333	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007181	ACTCTG	2	12	597857	597868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007181	ATGTGA	2	12	627773	627784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007181	TATTCT	2	12	694668	694679	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007181	CATTAA	2	12	701027	701038	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007181	TAAAAT	2	12	714652	714663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007181	ATTTTT	2	12	805820	805831	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007181	TTTCGA	2	12	805955	805966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007181	TTAAAT	2	12	839662	839673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007181	TTAATT	2	12	858150	858161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007181	TGTCTA	2	12	890052	890063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007181	TTTAGT	2	12	906218	906229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007181	ATTAAA	2	12	907472	907483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007181	AAAATA	2	12	929248	929259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007181	TTATAT	2	12	944812	944823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007181	TATATT	2	12	954374	954385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007181	AGAATA	2	12	956737	956748	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007181	CTTTCA	2	12	963692	963703	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007181	ATAATT	2	12	983962	983973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007181	TATCGA	2	12	999766	999777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007181	ATTTTT	2	12	1007397	1007408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007181	TTTTTA	2	12	1009714	1009725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007181	TACAAC	2	12	1046645	1046656	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007181	AAATTA	2	12	1051826	1051837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007181	TAAAAA	2	12	1072327	1072338	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007181	TAATTT	2	12	1080040	1080051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007181	CTTTTT	2	12	1080329	1080340	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007181	GATCAG	2	12	1127825	1127836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007181	TTAAAA	2	12	1188574	1188585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007181	TAAAAA	2	12	1200040	1200051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007181	ATTAAA	2	12	1226689	1226700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007181	ATCTAA	2	12	1226887	1226898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007181	AAAATT	2	12	1227502	1227513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007181	ATTTTT	2	12	1263817	1263828	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007181	TATTTT	2	12	1268258	1268269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007181	GAAAAT	2	12	1268315	1268326	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007181	TACTAT	2	12	1276003	1276014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007181	CTCCTT	2	12	1422668	1422679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007181	TATAAT	2	12	1438348	1438359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007181	AAAGAA	2	12	1443341	1443352	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007181	AGTATA	2	12	1461980	1461991	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007181	AATATT	2	12	1471043	1471054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007181	TTATAA	2	12	1510678	1510689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007181	TTTAAA	2	12	1514983	1514994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007181	AAATTT	2	12	1537334	1537345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007181	TATTAA	2	12	1551019	1551030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007181	CTTTTT	2	12	1553470	1553481	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007181	TAACAT	2	12	1562459	1562470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007181	TGAAAT	2	12	1562564	1562575	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007181	ATTATA	2	12	1605878	1605889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007181	GAAAAA	2	12	1616417	1616428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007181	TTCATA	2	12	1618724	1618735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007181	ACTCAA	2	12	1641809	1641820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007181	TAGTTT	2	12	1650727	1650738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007181	TTAGTT	2	12	1651084	1651095	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007181	TAGTTT	2	12	1651743	1651754	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007181	TAGTTT	2	12	1652528	1652539	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007181	TTAGTT	2	12	1653069	1653080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007181	TATTTT	2	12	1653163	1653174	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007181	TCATAC	2	12	1653995	1654006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007181	TAGTTT	2	12	1654388	1654399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007181	AAAGAA	2	12	1654776	1654787	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007181	TAAAAC	2	12	1655027	1655038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007181	TTTAGT	2	12	1657542	1657553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007181	TAGTTT	2	12	1657783	1657794	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007181	TTTTAG	2	12	1658018	1658029	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007181	TAGTTT	2	12	1658203	1658214	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007181	AAACTA	2	12	1671217	1671228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007181	AAACTA	2	12	1671688	1671699	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007181	AAACTA	2	12	1672170	1672181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007181	AGCAAC	2	12	1672785	1672796	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007181	AAACTA	2	12	1673191	1673202	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007181	CTTTTT	2	12	1673812	1673823	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007181	AAACTA	2	12	1674618	1674629	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007181	AAACTA	2	12	1674920	1674931	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007181	AAACTA	2	12	1674981	1674992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007181	AAACTA	2	12	1675040	1675051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007181	AAACTA	2	12	1675099	1675110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007181	AAACTA	2	12	1675158	1675169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007181	AAACTA	2	12	1675217	1675228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007181	AAAGGG	2	12	1685331	1685342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007181	AAACAT	2	12	1694951	1694962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007181	GAATAT	2	12	1699852	1699863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007181	TTAAGA	2	12	1706679	1706690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007181	TTATAA	2	12	1727864	1727875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007181	TTATAA	2	12	1727882	1727893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007181	ATTAAT	2	12	1727923	1727934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007181	TCTATA	2	12	1731027	1731038	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007181	AAACAT	2	12	1744525	1744536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007181	GTAGGG	2	12	1754865	1754876	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007181	CCTTTA	2	12	1763605	1763616	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007181	ACTCAT	2	12	1769210	1769221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007181	TTATAA	2	12	1773783	1773794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007181	AAATAT	2	12	1774482	1774493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007181	ACTAAT	2	12	1802509	1802520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_007181	CCTTAT	2	12	1802744	1802755	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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131	NC_007181	AAATTG	2	12	1811040	1811051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007181	GCTGAT	2	12	1813336	1813347	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007181	AGGTTA	2	12	1822706	1822717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.