MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 7826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007181	TAAA	2	8	554485	554492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_007181	TTTA	2	8	557871	557878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_007181	ATC	2	6	559342	559347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_007181	TCA	2	6	559373	559378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_007181	A	6	6	560720	560725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_007181	TAGAT	2	10	560732	560741	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_007181	AT	3	6	562529	562534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_007181	ATT	2	6	563474	563479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_007181	TA	3	6	563498	563503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_007181	GCC	3	9	563515	563523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_007181	ACC	2	6	563540	563545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_007181	CTT	2	6	563561	563566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_007181	CGG	2	6	563609	563614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_007181	TAAT	2	8	563621	563628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_007181	ATA	2	6	565008	565013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_007181	AATA	3	12	565026	565037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_007181	TA	4	8	567125	567132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_007181	TAA	2	6	567139	567144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_007181	AAC	2	6	567145	567150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_007181	TA	3	6	567185	567190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_007181	T	6	6	569649	569654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_007181	T	7	7	571194	571200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_007181	CTT	2	6	571267	571272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_007181	ACA	2	6	571290	571295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_007181	TC	3	6	571360	571365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_007181	CTC	2	6	572698	572703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_007181	TAA	2	6	573233	573238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_007181	CAC	2	6	574236	574241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_007181	ATGT	2	8	574265	574272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_007181	TAA	2	6	574282	574287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_007181	TTATA	2	10	579361	579370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_007181	GA	3	6	579373	579378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_007181	C	6	6	579397	579402	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1534	NC_007181	TAT	2	6	579441	579446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_007181	TAC	2	6	579450	579455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_007181	ACT	2	6	579494	579499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_007181	TTTA	2	8	579530	579537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_007181	TTTTAT	2	12	579553	579564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_007181	AAT	2	6	579568	579573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_007181	ATTTT	2	10	579584	579593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_007181	AT	3	6	579597	579602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_007181	A	6	6	579649	579654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_007181	GTA	2	6	579673	579678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_007181	CCGG	2	8	579747	579754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_007181	TAC	2	6	579767	579772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_007181	CAC	2	6	579823	579828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_007181	CAG	2	6	579862	579867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_007181	ACGCTT	2	12	579882	579893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_007181	ACT	2	6	580039	580044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_007181	TAC	2	6	580060	580065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_007181	GAA	2	6	581818	581823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_007181	TCT	2	6	581867	581872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_007181	GTT	2	6	581893	581898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_007181	ACC	2	6	581921	581926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_007181	TGCCC	2	10	581941	581950	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1556	NC_007181	CGT	2	6	581993	581998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_007181	GGT	2	6	582002	582007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_007181	ATAACG	2	12	582013	582024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1559	NC_007181	TACTC	2	10	582146	582155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_007181	ACC	2	6	582214	582219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_007181	GGA	2	6	582252	582257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_007181	CTCC	2	8	582448	582455	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1563	NC_007181	C	6	6	582532	582537	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1564	NC_007181	GTTA	2	8	582603	582610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_007181	ACA	2	6	582648	582653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_007181	ACTTA	2	10	582654	582663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1567	NC_007181	CAT	2	6	582778	582783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_007181	TTC	2	6	583976	583981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_007181	AGT	2	6	584010	584015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_007181	TAG	2	6	584016	584021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_007181	ATT	2	6	584049	584054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_007181	TAT	2	6	584065	584070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_007181	ATGAA	2	10	584072	584081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_007181	AATC	2	8	584124	584131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_007181	ATT	2	6	584132	584137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_007181	TTTG	2	8	584204	584211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_007181	TGT	2	6	584216	584221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_007181	AT	3	6	584232	584237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_007181	TAA	2	6	584579	584584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_007181	TA	3	6	584611	584616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_007181	TATCT	2	10	584650	584659	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1582	NC_007181	TAT	2	6	586117	586122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_007181	TCC	2	6	586140	586145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_007181	AGG	2	6	586158	586163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_007181	CCT	2	6	586183	586188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_007181	TAG	2	6	586198	586203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_007181	CTT	2	6	586773	586778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_007181	AT	4	8	587042	587049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_007181	TAC	2	6	587087	587092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_007181	ACT	2	6	587105	587110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1593	NC_007181	AAG	2	6	588472	588477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_007181	TAC	2	6	588495	588500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_007181	TAA	2	6	590187	590192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_007181	CTTC	2	8	590219	590226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_007181	TC	3	6	590225	590230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_007181	AT	3	6	590257	590262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_007181	TCTT	2	8	590289	590296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_007181	GA	3	6	590333	590338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_007181	AGTG	2	8	590377	590384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_007181	AAT	2	6	590414	590419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_007181	CTA	2	6	590544	590549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_007181	GAAT	2	8	590594	590601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_007181	GCA	2	6	590743	590748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_007181	GAG	3	9	590776	590784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_007181	CTTT	2	8	591249	591256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_007181	TAC	2	6	591262	591267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_007181	TAA	2	6	591307	591312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_007181	TGC	2	6	593686	593691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_007181	TTA	2	6	593697	593702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_007181	AT	3	6	593741	593746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_007181	TTTG	2	8	593758	593765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_007181	TTA	2	6	593767	593772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_007181	AGA	2	6	593786	593791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_007181	AATC	2	8	593827	593834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_007181	TGA	2	6	593872	593877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_007181	ATT	2	6	593902	593907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1622	NC_007181	AGA	2	6	594088	594093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_007181	AAT	2	6	594094	594099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_007181	AAAT	2	8	594111	594118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_007181	TA	3	6	594163	594168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_007181	ATTT	2	8	594175	594182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_007181	TAA	2	6	594186	594191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_007181	TTTAA	2	10	594228	594237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_007181	TA	3	6	594281	594286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_007181	ATAAGG	2	12	594322	594333	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_007181	TAT	2	6	594349	594354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_007181	CCG	2	6	594477	594482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_007181	AAT	2	6	594547	594552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_007181	ATT	2	6	594804	594809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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