MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 7826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007181	A	7	7	201000	201006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007181	TGG	2	6	201012	201017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007181	AT	3	6	201039	201044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007181	AAC	2	6	201079	201084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007181	TAA	3	9	201454	201462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_007181	AG	4	8	201503	201510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007181	AAATT	2	10	201572	201581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007181	ATT	2	6	201593	201598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007181	AAAT	2	8	201604	201611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007181	ATGT	2	8	201615	201622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007181	TAT	2	6	201636	201641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007181	CAT	2	6	201687	201692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_007181	TATT	2	8	201703	201710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007181	AT	3	6	201777	201782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007181	TTA	2	6	201818	201823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007181	GAA	3	9	201833	201841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007181	AAC	2	6	201855	201860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_007181	ATA	2	6	201861	201866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007181	TA	3	6	201865	201870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007181	TCT	2	6	203732	203737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_007181	TCT	2	6	203813	203818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007181	TG	3	6	203952	203957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007181	A	6	6	204010	204015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007181	TTTA	2	8	204058	204065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007181	TAA	2	6	206225	206230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007181	AAT	2	6	206236	206241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007181	TTAT	2	8	206249	206256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007181	TAA	2	6	206316	206321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007181	GTATT	2	10	206336	206345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
530	NC_007181	TTTA	2	8	206348	206355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007181	T	6	6	208238	208243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007181	TAAA	2	8	208272	208279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007181	TATC	2	8	208741	208748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_007181	AGT	2	6	210686	210691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007181	GAA	2	6	210699	210704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007181	T	6	6	211025	211030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007181	TTA	2	6	212819	212824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007181	TAG	2	6	212832	212837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007181	AAAT	2	8	212839	212846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007181	CTG	2	6	214090	214095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_007181	TA	3	6	214387	214392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007181	T	6	6	214415	214420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007181	AATT	2	8	214424	214431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007181	GTT	2	6	214436	214441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007181	GAA	2	6	214539	214544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007181	GGT	2	6	214583	214588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007181	GAA	2	6	214595	214600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007181	TTTC	2	8	217010	217017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_007181	ATG	2	6	217037	217042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007181	ATG	2	6	217062	217067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007181	T	6	6	217128	217133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_007181	TA	3	6	217149	217154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007181	CTT	2	6	220800	220805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_007181	ATT	2	6	223041	223046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007181	TAA	2	6	223114	223119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_007181	TCTCT	2	10	225019	225028	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
557	NC_007181	TAG	2	6	226205	226210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_007181	CT	3	6	229158	229163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_007181	AT	3	6	229166	229171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007181	AAT	2	6	231315	231320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007181	AAT	2	6	231343	231348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007181	TA	3	6	233164	233169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007181	ATA	2	6	233525	233530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007181	CAT	2	6	235215	235220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_007181	ATT	2	6	235737	235742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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568	NC_007181	TAA	2	6	237183	237188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_007181	T	6	6	242254	242259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007181	ATT	2	6	242270	242275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007181	TAA	2	6	242284	242289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007181	TA	3	6	242320	242325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007181	TAC	2	6	242334	242339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_007181	CAG	2	6	242368	242373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_007181	CTTAA	2	10	242973	242982	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
576	NC_007181	TAA	2	6	243006	243011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007181	AGT	2	6	243458	243463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_007181	AGTT	2	8	243555	243562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_007181	ATT	2	6	243647	243652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_007181	TAT	2	6	244987	244992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007181	TAAA	2	8	245019	245026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007181	ATTT	2	8	245028	245035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007181	T	7	7	245064	245070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_007181	T	7	7	245128	245134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_007181	AT	3	6	245219	245224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007181	TTAGG	2	10	248056	248065	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_007181	A	6	6	248235	248240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_007181	TAT	2	6	248626	248631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_007181	CT	3	6	248652	248657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_007181	CTAA	2	8	248665	248672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_007181	AT	3	6	250234	250239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_007181	TAAAA	2	10	251694	251703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007181	GA	3	6	251782	251787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007181	GAA	2	6	251801	251806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_007181	AAT	2	6	252931	252936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007181	A	6	6	252949	252954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_007181	TAAC	2	8	252961	252968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_007181	TAT	2	6	252993	252998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_007181	TAA	2	6	253131	253136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_007181	A	6	6	253470	253475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007181	TAA	2	6	254353	254358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007181	AT	3	6	254372	254377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007181	ATA	2	6	254391	254396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007181	TAT	2	6	254402	254407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_007181	AGT	2	6	254455	254460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_007181	A	6	6	256413	256418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007181	TTATA	2	10	257048	257057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007181	GT	4	8	257077	257084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_007181	T	6	6	257121	257126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007181	AAAT	2	8	257147	257154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007181	AAT	2	6	257157	257162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007181	TAA	2	6	257183	257188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_007181	TG	3	6	257242	257247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_007181	CAC	2	6	257263	257268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_007181	CTAA	2	8	257306	257313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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