MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006905	GGA	2	6	309237	309242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_006905	CAC	2	6	309288	309293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_006905	TCA	2	6	309311	309316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_006905	TG	3	6	309323	309328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_006905	CGG	2	6	309401	309406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_006905	TGG	2	6	309494	309499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_006905	GC	3	6	309590	309595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_006905	TGA	2	6	309708	309713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_006905	ATTT	2	8	311919	311926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006905	AGA	2	6	311954	311959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006905	TAT	2	6	312868	312873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_006905	ATT	2	6	312889	312894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_006905	AAT	2	6	312906	312911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_006905	TATCGG	2	12	312939	312950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1015	NC_006905	TCT	2	6	312963	312968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_006905	ATT	2	6	312980	312985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_006905	GTT	2	6	313567	313572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_006905	GGC	2	6	317614	317619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_006905	TGG	2	6	317751	317756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_006905	GTA	2	6	317767	317772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_006905	ATT	2	6	318234	318239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_006905	TGG	2	6	323937	323942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_006905	GAT	2	6	323962	323967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_006905	TTA	2	6	323994	323999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_006905	TAA	2	6	324039	324044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_006905	ATA	2	6	324055	324060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_006905	TTAT	2	8	324078	324085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_006905	TATGT	2	10	324099	324108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_006905	TTC	2	6	324159	324164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_006905	TATT	2	8	324235	324242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_006905	TTTTA	2	10	326507	326516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_006905	GA	3	6	332159	332164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_006905	TAT	2	6	332182	332187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_006905	TAAA	2	8	332474	332481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_006905	CCG	2	6	332493	332498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_006905	GCTG	2	8	332502	332509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_006905	GTGA	2	8	332525	332532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_006905	C	6	6	332560	332565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1039	NC_006905	TGA	2	6	332579	332584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_006905	GTCA	2	8	332674	332681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_006905	AGG	2	6	332700	332705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_006905	TAA	2	6	332802	332807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_006905	TGC	2	6	332919	332924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_006905	TGC	2	6	333063	333068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_006905	TTA	2	6	333075	333080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_006905	TG	3	6	333137	333142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_006905	ATG	2	6	333162	333167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_006905	TCA	2	6	333184	333189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_006905	TGA	2	6	333212	333217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_006905	TAA	2	6	333225	333230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_006905	TAT	2	6	333249	333254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_006905	ATA	2	6	333271	333276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_006905	TAT	2	6	333281	333286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_006905	A	7	7	333328	333334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_006905	ATA	2	6	333343	333348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_006905	ATTT	2	8	333353	333360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_006905	ATT	2	6	333413	333418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_006905	GTA	2	6	333482	333487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_006905	AC	3	6	333556	333561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_006905	AG	3	6	333573	333578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_006905	TAT	2	6	333588	333593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_006905	TG	3	6	333598	333603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_006905	CTG	2	6	333625	333630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_006905	TTA	2	6	333666	333671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_006905	CTT	2	6	333712	333717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_006905	GAA	2	6	334406	334411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_006905	TAT	2	6	334421	334426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_006905	TTA	2	6	334553	334558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_006905	TTA	2	6	334591	334596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_006905	GGAT	2	8	334977	334984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_006905	ATC	2	6	335357	335362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_006905	AATC	2	8	335369	335376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_006905	ATC	2	6	335427	335432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_006905	CGGA	2	8	335456	335463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_006905	CGT	2	6	335686	335691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_006905	TGT	2	6	335706	335711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_006905	TGA	2	6	335712	335717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_006905	GCT	2	6	336206	336211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_006905	GGT	2	6	336240	336245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_006905	AAGG	2	8	336276	336283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_006905	GTCA	2	8	336323	336330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_006905	TAA	2	6	336431	336436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_006905	ATGT	2	8	336457	336464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_006905	CT	3	6	336505	336510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_006905	TTA	2	6	336558	336563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_006905	ACA	2	6	336620	336625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_006905	T	7	7	336667	336673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_006905	AT	3	6	336693	336698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_006905	TTA	2	6	336756	336761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_006905	T	6	6	336773	336778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_006905	ATT	2	6	336826	336831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_006905	A	6	6	336844	336849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_006905	AAC	2	6	337369	337374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_006905	ATC	2	6	337417	337422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_006905	GA	3	6	340731	340736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_006905	ATTT	2	8	341342	341349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_006905	T	7	7	341368	341374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_006905	AAT	2	6	341403	341408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_006905	TAT	2	6	341429	341434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_006905	TTTG	2	8	341450	341457	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_006905	GTTT	2	8	341502	341509	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_006905	ATTT	2	8	341588	341595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_006905	T	6	6	341593	341598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_006905	TGC	2	6	342460	342465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_006905	TCC	2	6	342474	342479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_006905	CAT	2	6	342482	342487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_006905	CGG	2	6	342488	342493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_006905	ATG	2	6	342519	342524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_006905	GCA	2	6	342594	342599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_006905	GTT	3	9	342677	342685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_006905	ATT	2	6	342694	342699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_006905	GAG	2	6	342763	342768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_006905	TCTGT	2	10	342814	342823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_006905	TCC	2	6	342825	342830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_006905	ATA	2	6	342841	342846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_006905	G	6	6	342858	342863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_006905	AAT	2	6	342876	342881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_006905	TAT	2	6	343008	343013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_006905	GATG	2	8	343102	343109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_006905	T	6	6	343152	343157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_006905	ATG	2	6	343161	343166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_006905	CA	3	6	343185	343190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_006905	AATC	2	8	344495	344502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_006905	ATC	2	6	344553	344558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_006905	CGGA	2	8	344582	344589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_006905	CCA	2	6	344629	344634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_006905	CGG	2	6	344657	344662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_006905	CTG	2	6	344755	344760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_006905	AAC	2	6	345158	345163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_006905	CAG	2	6	345237	345242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_006905	GAC	2	6	345291	345296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_006905	CGAT	2	8	345301	345308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_006905	CTGG	2	8	345311	345318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_006905	ATTCC	2	10	345380	345389	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1135	NC_006905	CTG	2	6	345414	345419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1408	NC_006905	CGA	2	6	387291	387296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_006905	AGA	2	6	387297	387302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_006905	ACC	2	6	387342	387347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1412	NC_006905	ATG	2	6	387398	387403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_006905	TA	3	6	387451	387456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_006905	GCTG	2	8	387768	387775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1439	NC_006905	AAG	2	6	390142	390147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_006905	TTA	2	6	390983	390988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_006905	CTT	2	6	391004	391009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1444	NC_006905	TCA	2	6	391153	391158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_006905	TGG	2	6	392720	392725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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