MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_006905	GC	3	6	2847757	2847762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_006905	CGC	2	6	2847844	2847849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_006905	GAT	2	6	2847876	2847881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_006905	TCG	2	6	2848012	2848017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_006905	GAC	2	6	2848068	2848073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_006905	GCC	2	6	2848167	2848172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_006905	ATC	2	6	2848281	2848286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_006905	ACGG	2	8	2848329	2848336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_006905	CGC	2	6	2848351	2848356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_006905	ACC	2	6	2848378	2848383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_006905	CGG	2	6	2848408	2848413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_006905	GCC	2	6	2848491	2848496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_006905	CGG	2	6	2848502	2848507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_006905	CAT	2	6	2848589	2848594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_006905	TAG	2	6	2848730	2848735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_006905	CGC	2	6	2848795	2848800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_006905	AAT	2	6	2848842	2848847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_006905	AACG	2	8	2848853	2848860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_006905	GA	3	6	2848888	2848893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_006905	GCA	2	6	2848897	2848902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_006905	AAT	2	6	2848917	2848922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_006905	GCG	2	6	2849152	2849157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_006905	GAC	2	6	2849166	2849171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_006905	GCA	2	6	2849206	2849211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_006905	TTA	2	6	2849212	2849217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_006905	GCA	2	6	2849230	2849235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_006905	GC	3	6	2849293	2849298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_006905	GCC	2	6	2849331	2849336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_006905	GCC	2	6	2849340	2849345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10030	NC_006905	CAG	2	6	2849351	2849356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_006905	CCGTT	2	10	2849392	2849401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10032	NC_006905	GCC	2	6	2849405	2849410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_006905	CGT	2	6	2849411	2849416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_006905	GCG	2	6	2849506	2849511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_006905	GCA	2	6	2849518	2849523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10037	NC_006905	CCGCC	2	10	2849701	2849710	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10038	NC_006905	GAC	2	6	2849733	2849738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_006905	CG	3	6	2849746	2849751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_006905	TCG	2	6	2849845	2849850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_006905	ATCG	2	8	2849901	2849908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_006905	CG	3	6	2849907	2849912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_006905	CCG	2	6	2849962	2849967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_006905	GAT	2	6	2849991	2849996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10046	NC_006905	GGC	2	6	2850027	2850032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_006905	GAC	2	6	2850039	2850044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_006905	CAC	2	6	2850065	2850070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_006905	CA	3	6	2850182	2850187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_006905	GGC	2	6	2850225	2850230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_006905	GC	3	6	2850265	2850270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_006905	TTA	2	6	2850283	2850288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_006905	GAT	2	6	2850300	2850305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_006905	GC	3	6	2850337	2850342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_006905	AACGG	2	10	2850367	2850376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10056	NC_006905	CGC	2	6	2850473	2850478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10057	NC_006905	CA	3	6	2850491	2850496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_006905	CCG	2	6	2850503	2850508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_006905	ACCG	2	8	2850624	2850631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_006905	CGA	2	6	2850657	2850662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_006905	CGC	2	6	2850728	2850733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_006905	CGG	2	6	2850833	2850838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_006905	CGT	2	6	2850915	2850920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_006905	AACG	2	8	2850966	2850973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_006905	CGA	2	6	2851013	2851018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10067	NC_006905	CGC	2	6	2851094	2851099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_006905	CGC	2	6	2851103	2851108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_006905	CGG	2	6	2851151	2851156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10072	NC_006905	ATA	2	6	2851241	2851246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_006905	CGG	2	6	2851275	2851280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_006905	CGA	2	6	2851283	2851288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_006905	CAAC	2	8	2851331	2851338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10076	NC_006905	GC	3	6	2851355	2851360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10077	NC_006905	GGCA	2	8	2851464	2851471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_006905	CGC	2	6	2851524	2851529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_006905	ACG	2	6	2851550	2851555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_006905	GC	3	6	2851606	2851611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10081	NC_006905	GCT	2	6	2851671	2851676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10083	NC_006905	CT	3	6	2851728	2851733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_006905	TCG	3	9	2851814	2851822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_006905	CGC	3	9	2851829	2851837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_006905	TCAG	2	8	2851855	2851862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10089	NC_006905	CAG	2	6	2852094	2852099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_006905	ACC	2	6	2852134	2852139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_006905	ATG	2	6	2852282	2852287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_006905	GCG	2	6	2852324	2852329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_006905	CGA	2	6	2852345	2852350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_006905	ACG	2	6	2852360	2852365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_006905	GGCA	2	8	2852400	2852407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_006905	CCA	2	6	2852420	2852425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_006905	TGA	2	6	2852487	2852492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10099	NC_006905	AC	3	6	2852540	2852545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_006905	GC	3	6	2852603	2852608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_006905	CCG	2	6	2852660	2852665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_006905	GCC	2	6	2852701	2852706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10103	NC_006905	GC	3	6	2852774	2852779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_006905	TCA	2	6	2852792	2852797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_006905	GCAG	2	8	2852833	2852840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10106	NC_006905	ACCGCC	2	12	2852881	2852892	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_006905	GCC	2	6	2852992	2852997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_006905	GC	3	6	2853005	2853010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_006905	CG	3	6	2853017	2853022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_006905	ATC	2	6	2853037	2853042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_006905	GAT	2	6	2853055	2853060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_006905	GGTCA	2	10	2853091	2853100	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10113	NC_006905	GGCG	2	8	2853138	2853145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_006905	AAC	2	6	2853163	2853168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_006905	GCT	2	6	2853174	2853179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_006905	CAC	3	9	2853183	2853191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_006905	CACCGC	2	12	2853258	2853269	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_006905	CCG	2	6	2853302	2853307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_006905	GCAG	2	8	2853384	2853391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10120	NC_006905	GGCG	2	8	2853420	2853427	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_006905	CAC	3	9	2853438	2853446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_006905	GCA	2	6	2853452	2853457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_006905	TC	3	6	2853469	2853474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_006905	ACAAA	2	10	2853484	2853493	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10125	NC_006905	GGC	2	6	2853582	2853587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_006905	CCG	2	6	2853623	2853628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10127	NC_006905	CTG	3	9	2853661	2853669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_006905	GC	3	6	2853674	2853679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10129	NC_006905	GGT	2	6	2853742	2853747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_006905	GCC	2	6	2853769	2853774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_006905	GCT	2	6	2853795	2853800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_006905	GAC	2	6	2853852	2853857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_006905	CCG	2	6	2853869	2853874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10134	NC_006905	GCG	2	6	2853911	2853916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_006905	ACCAG	2	10	2854022	2854031	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10136	NC_006905	TAT	2	6	2854038	2854043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_006905	TGA	2	6	2854080	2854085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10140	NC_006905	CGG	2	6	2854238	2854243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10231	NC_006905	GC	3	6	2867851	2867856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10232	NC_006905	CGT	2	6	2867884	2867889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10233	NC_006905	AGAC	2	8	2867996	2868003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10234	NC_006905	GA	3	6	2868027	2868032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10235	NC_006905	TG	3	6	2868063	2868068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_006905	TAG	2	6	2868083	2868088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10239	NC_006905	TTC	2	6	2868368	2868373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10240	NC_006905	GTT	2	6	2868406	2868411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_006905	AGTT	2	8	2868436	2868443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_006905	GTG	2	6	2868494	2868499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_006905	T	6	6	2868525	2868530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_006905	GATTG	2	10	2868572	2868581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_006905	GGTGT	2	10	2868780	2868789	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_006905	CTTT	2	8	2868835	2868842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10247	NC_006905	CAA	2	6	2868958	2868963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_006905	ATGTT	2	10	2869074	2869083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_006905	TTGG	2	8	2869095	2869102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_006905	AG	3	6	2869215	2869220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_006905	TTG	2	6	2869248	2869253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_006905	ATT	2	6	2869258	2869263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_006905	CTTAA	2	10	2869310	2869319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10254	NC_006905	TCA	2	6	2869347	2869352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_006905	CAG	2	6	2869394	2869399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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