MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006905	TTTG	2	8	128448	128455	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_006905	TAA	2	6	128602	128607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006905	ATT	2	6	128846	128851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_006905	CG	3	6	129019	129024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_006905	ATA	2	6	129268	129273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006905	A	6	6	129304	129309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006905	CGT	2	6	129340	129345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_006905	TTA	2	6	129394	129399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006905	GAA	2	6	129405	129410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_006905	CGT	2	6	129414	129419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_006905	AAC	2	6	129526	129531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_006905	TC	3	6	129543	129548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_006905	GCTG	2	8	129682	129689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
514	NC_006905	ATGG	2	8	129806	129813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_006905	TTA	2	6	129819	129824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_006905	TCG	2	6	129941	129946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_006905	ATT	2	6	129991	129996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_006905	TCT	2	6	130035	130040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_006905	CTT	2	6	130041	130046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_006905	CCT	2	6	130048	130053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_006905	ATT	2	6	130055	130060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006905	AGCG	2	8	130109	130116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_006905	TGA	2	6	130138	130143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_006905	GAC	2	6	132401	132406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_006905	CAGG	2	8	132471	132478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
526	NC_006905	CCCAA	2	10	132510	132519	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
527	NC_006905	T	8	8	132535	132542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_006905	CGG	2	6	133679	133684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_006905	CT	4	8	133692	133699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_006905	GCC	2	6	133703	133708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_006905	CAAA	2	8	133711	133718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_006905	AAT	2	6	133744	133749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006905	ATT	2	6	133754	133759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_006905	T	6	6	133782	133787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_006905	CTTT	2	8	133793	133800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_006905	TTA	2	6	133862	133867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006905	TCG	2	6	133883	133888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_006905	CGG	2	6	134063	134068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_006905	T	7	7	134080	134086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_006905	T	6	6	134168	134173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006905	CTTG	2	8	134193	134200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_006905	TCC	2	6	134210	134215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_006905	AAG	2	6	134260	134265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006905	AAT	2	6	145399	145404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006905	GCC	2	6	149965	149970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_006905	GA	4	8	150005	150012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006905	CCG	2	6	151213	151218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_006905	CT	3	6	152227	152232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_006905	T	8	8	152253	152260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006905	CTG	2	6	152372	152377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_006905	A	6	6	152963	152968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006905	TTTA	2	8	152980	152987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_006905	CGCGG	2	10	152994	153003	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
554	NC_006905	CGGT	2	8	155772	155779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_006905	ATT	2	6	155786	155791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_006905	T	6	6	155859	155864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006905	CAA	2	6	155872	155877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_006905	GGCA	2	8	157326	157333	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_006905	CTA	2	6	159968	159973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_006905	A	7	7	160005	160011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_006905	CTGG	2	8	161159	161166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
562	NC_006905	AAT	2	6	164362	164367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_006905	AGC	2	6	165377	165382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_006905	CAC	2	6	165389	165394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_006905	TGC	2	6	166853	166858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_006905	GAT	2	6	169293	169298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_006905	ATT	2	6	169306	169311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_006905	T	8	8	169323	169330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_006905	CGC	2	6	169345	169350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_006905	AGT	2	6	170867	170872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006905	GT	3	6	170875	170880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_006905	ATTT	2	8	170908	170915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_006905	T	8	8	170925	170932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_006905	AAT	2	6	170964	170969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006905	TGA	2	6	171007	171012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_006905	AAAG	2	8	171025	171032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_006905	CCT	2	6	171045	171050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_006905	ATTT	2	8	171074	171081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_006905	ATT	2	6	171088	171093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_006905	CTG	2	6	171116	171121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_006905	T	6	6	171142	171147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_006905	CCT	2	6	171172	171177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_006905	CCT	2	6	171249	171254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_006905	TCAA	2	8	171264	171271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_006905	T	6	6	172139	172144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006905	AGA	2	6	172162	172167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_006905	TGT	2	6	172168	172173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_006905	TTA	2	6	172220	172225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_006905	TAGA	2	8	172276	172283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006905	CGGC	2	8	176578	176585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_006905	T	8	8	176586	176593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006905	TTA	2	6	176618	176623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_006905	TGT	2	6	176650	176655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_006905	GAT	2	6	176708	176713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_006905	CCG	2	6	176734	176739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_006905	TCT	2	6	178186	178191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_006905	A	6	6	178218	178223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006905	T	7	7	178240	178246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_006905	ATG	2	6	178272	178277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006905	GCA	2	6	178314	178319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_006905	TGTC	2	8	178357	178364	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_006905	TCA	2	6	178413	178418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_006905	ATA	2	6	178443	178448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_006905	TC	3	6	181224	181229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_006905	TGCC	2	8	181259	181266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
606	NC_006905	T	6	6	181436	181441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006905	T	6	6	181449	181454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006905	CTA	2	6	181519	181524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_006905	ACT	2	6	181525	181530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_006905	CAA	2	6	181562	181567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_006905	GAG	2	6	181594	181599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006905	TCCT	2	8	184716	184723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_006905	A	6	6	184747	184752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_006905	CTG	2	6	184773	184778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_006905	CAA	2	6	184826	184831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_006905	GAT	2	6	184850	184855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006905	TGA	2	6	184902	184907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006905	A	6	6	184914	184919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006905	ATA	2	6	184998	185003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_006905	GC	3	6	185020	185025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_006905	GTC	2	6	185043	185048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_006905	GATG	2	8	185087	185094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_006905	AAAT	2	8	185444	185451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_006905	GT	3	6	185483	185488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_006905	AT	3	6	185550	185555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_006905	AAT	2	6	185583	185588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_006905	TTTTA	2	10	185604	185613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_006905	TTTC	2	8	185635	185642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_006905	TGC	2	6	185647	185652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_006905	CT	3	6	186078	186083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_006905	T	6	6	186174	186179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_006905	T	6	6	186192	186197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_006905	TTA	2	6	186203	186208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006905	TTGA	2	8	186250	186257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_006905	TTTA	2	8	186274	186281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_006905	CAA	2	6	186286	186291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_006905	TGA	2	6	190304	190309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_006905	CCT	2	6	191115	191120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_006905	A	7	7	192016	192022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_006905	CAT	2	6	192031	192036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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