MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006905	CAC	2	6	1725963	1725968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_006905	CGCGC	2	10	1725972	1725981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6003	NC_006905	GGC	2	6	1726006	1726011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_006905	CCG	3	9	1726036	1726044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_006905	CGG	2	6	1726082	1726087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_006905	CGC	3	9	1726136	1726144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_006905	GCG	2	6	1726232	1726237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_006905	GGC	2	6	1726261	1726266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_006905	TTC	2	6	1726299	1726304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_006905	ACG	2	6	1726309	1726314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_006905	CCA	2	6	1726340	1726345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_006905	CCTT	2	8	1726372	1726379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_006905	GAA	2	6	1727819	1727824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_006905	ATC	2	6	1727928	1727933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_006905	TAAAA	2	10	1727936	1727945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_006905	TAA	2	6	1727973	1727978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_006905	CT	3	6	1730671	1730676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_006905	CATT	2	8	1730775	1730782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_006905	CTTT	2	8	1732440	1732447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_006905	TTTA	2	8	1732539	1732546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_006905	GGT	2	6	1732554	1732559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_006905	CCG	2	6	1732626	1732631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_006905	A	6	6	1732687	1732692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_006905	TCA	2	6	1732735	1732740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_006905	AATC	2	8	1732756	1732763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_006905	TAA	2	6	1732769	1732774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_006905	TTA	2	6	1733305	1733310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_006905	TCT	2	6	1733351	1733356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_006905	ATA	2	6	1733366	1733371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_006905	GTA	2	6	1733437	1733442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_006905	CAT	2	6	1733451	1733456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_006905	TTCT	2	8	1733473	1733480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_006905	CAA	2	6	1733502	1733507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_006905	A	7	7	1733506	1733512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_006905	A	7	7	1733521	1733527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_006905	TA	3	6	1733528	1733533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_006905	CCA	2	6	1733649	1733654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_006905	A	10	10	1733665	1733674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_006905	AG	3	6	1733699	1733704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_006905	A	7	7	1733746	1733752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_006905	A	6	6	1733799	1733804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_006905	TAT	2	6	1733829	1733834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_006905	TGT	2	6	1733879	1733884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_006905	ACC	2	6	1733903	1733908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_006905	ACC	2	6	1733970	1733975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_006905	ATC	2	6	1734015	1734020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_006905	AAT	2	6	1734103	1734108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_006905	GAT	2	6	1734114	1734119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_006905	CTT	2	6	1734189	1734194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_006905	T	6	6	1734193	1734198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_006905	AAT	2	6	1734228	1734233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_006905	ATA	2	6	1734246	1734251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_006905	GTT	2	6	1734273	1734278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_006905	GAT	2	6	1734279	1734284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_006905	AT	3	6	1734283	1734288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_006905	TGTA	2	8	1734315	1734322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_006905	CGA	2	6	1734332	1734337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_006905	AAG	2	6	1734348	1734353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_006905	TAAT	2	8	1734405	1734412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_006905	TAA	2	6	1734431	1734436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_006905	AGG	2	6	1734441	1734446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_006905	ATG	2	6	1735748	1735753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_006905	TGC	2	6	1735761	1735766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_006905	AAT	2	6	1736160	1736165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_006905	T	7	7	1736218	1736224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_006905	GAA	2	6	1736363	1736368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_006905	TGTT	2	8	1736382	1736389	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_006905	TTA	2	6	1736417	1736422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_006905	TATTTA	2	12	1736427	1736438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_006905	CAA	2	6	1736478	1736483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_006905	TA	3	6	1736487	1736492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_006905	ATC	2	6	1736517	1736522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_006905	AAC	2	6	1736554	1736559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_006905	AAT	2	6	1736602	1736607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_006905	ATAG	2	8	1736624	1736631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_006905	A	6	6	1736652	1736657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_006905	TAGA	2	8	1736696	1736703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_006905	GAT	2	6	1736711	1736716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_006905	TGA	2	6	1736905	1736910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_006905	CCT	2	6	1736922	1736927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_006905	TAC	2	6	1737030	1737035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_006905	ATAG	2	8	1737041	1737048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_006905	TTA	2	6	1737382	1737387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_006905	TAAA	2	8	1737453	1737460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_006905	TAC	2	6	1737530	1737535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_006905	AAGTA	2	10	1737541	1737550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_006905	A	6	6	1737589	1737594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_006905	AGA	2	6	1737619	1737624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_006905	GAT	2	6	1737736	1737741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_006905	TTATTT	2	12	1739944	1739955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_006905	ATT	2	6	1739981	1739986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_006905	ATT	2	6	1740585	1740590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_006905	CTGG	2	8	1740678	1740685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6096	NC_006905	ATT	2	6	1740964	1740969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_006905	TGG	2	6	1741013	1741018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_006905	TTAT	2	8	1741025	1741032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_006905	TCT	3	9	1741044	1741052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_006905	TCC	2	6	1741066	1741071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_006905	TTAC	2	8	1741085	1741092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_006905	A	7	7	1741099	1741105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_006905	TTA	2	6	1741139	1741144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_006905	TCATA	2	10	1741157	1741166	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6106	NC_006905	ATG	2	6	1741233	1741238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_006905	ATT	2	6	1741263	1741268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_006905	TAT	2	6	1741280	1741285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_006905	AT	3	6	1741399	1741404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_006905	TGGT	2	8	1741445	1741452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_006905	GCG	2	6	1741455	1741460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_006905	T	6	6	1741589	1741594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_006905	CAGTG	2	10	1741598	1741607	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6114	NC_006905	ACTGCC	2	12	1741617	1741628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_006905	AGGT	2	8	1741688	1741695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_006905	TAAA	2	8	1741701	1741708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_006905	AAT	2	6	1741752	1741757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_006905	AATA	2	8	1741773	1741780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_006905	TTC	2	6	1741784	1741789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6122	NC_006905	TAA	2	6	1741862	1741867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_006905	TAT	3	9	1741894	1741902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_006905	ATA	2	6	1741935	1741940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_006905	TCG	2	6	1741951	1741956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_006905	ACTC	2	8	1741966	1741973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_006905	GTT	2	6	1742005	1742010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_006905	ATT	2	6	1742027	1742032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_006905	GA	3	6	1742037	1742042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_006905	TTTAT	2	10	1742792	1742801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_006905	AGT	2	6	1742939	1742944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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