MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 6711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006448	AGA	2	6	358292	358297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_006448	GAC	2	6	358333	358338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_006448	ATT	2	6	358362	358367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_006448	GGC	2	6	358410	358415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_006448	AG	3	6	358445	358450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_006448	CTT	2	6	358460	358465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_006448	ATTT	2	8	358572	358579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_006448	TAG	2	6	358627	358632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_006448	CGA	2	6	358655	358660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_006448	GCA	2	6	358729	358734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_006448	CGC	2	6	358776	358781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_006448	GTGA	2	8	358782	358789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_006448	TGT	2	6	358815	358820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_006448	CAG	2	6	358898	358903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_006448	AGCG	2	8	358953	358960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_006448	AT	3	6	359082	359087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_006448	GGA	2	6	359088	359093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_006448	CT	3	6	359113	359118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_006448	GAA	2	6	359352	359357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_006448	GGT	2	6	359426	359431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_006448	GTC	2	6	359440	359445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_006448	TCGTG	2	10	359449	359458	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_006448	CAT	2	6	359508	359513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_006448	TAA	2	6	359543	359548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_006448	GGA	2	6	359552	359557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_006448	ATC	2	6	359576	359581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_006448	AC	3	6	359603	359608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_006448	TGGT	2	8	359618	359625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_006448	CGC	2	6	359742	359747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_006448	AC	3	6	359772	359777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_006448	CAC	2	6	359787	359792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_006448	AGCC	2	8	359834	359841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_006448	GAT	2	6	359857	359862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_006448	CCT	2	6	359913	359918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_006448	AGG	2	6	360015	360020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_006448	GTAA	2	8	360109	360116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_006448	ATAG	2	8	360123	360130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_006448	GTTAA	2	10	360196	360205	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_006448	ACG	2	6	360259	360264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_006448	TAG	2	6	360430	360435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_006448	GCGA	2	8	360438	360445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_006448	AGA	2	6	360517	360522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_006448	AG	3	6	360545	360550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_006448	TCG	2	6	360620	360625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_006448	GGA	2	6	360633	360638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_006448	CT	3	6	360659	360664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_006448	GGGAG	2	10	360714	360723	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_006448	ACA	2	6	360751	360756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_006448	ATG	2	6	360818	360823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_006448	GGA	2	6	360951	360956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_006448	TC	3	6	361037	361042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_006448	ACC	2	6	361216	361221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_006448	AT	3	6	361237	361242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_006448	AGC	2	6	361296	361301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_006448	ATTC	2	8	361303	361310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_006448	GAA	2	6	361430	361435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_006448	GAG	2	6	361446	361451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_006448	GA	3	6	361576	361581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_006448	ACA	2	6	361602	361607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_006448	TA	3	6	361630	361635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_006448	CTAA	2	8	361657	361664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_006448	TAG	2	6	361759	361764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_006448	GA	3	6	361871	361876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_006448	CTGA	2	8	361930	361937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_006448	CT	3	6	361987	361992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_006448	GAT	2	6	362005	362010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_006448	CGG	2	6	362096	362101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_006448	GA	3	6	362194	362199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_006448	TAGG	2	8	362312	362319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_006448	GTT	2	6	362356	362361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_006448	TAC	2	6	362366	362371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_006448	CCT	2	6	362454	362459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_006448	GGT	2	6	362590	362595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_006448	TCG	2	6	362705	362710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_006448	CGT	2	6	362785	362790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_006448	GTT	2	6	362888	362893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_006448	AGGGA	2	10	362923	362932	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_006448	GA	3	6	363009	363014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_006448	GAAGTG	2	12	363034	363045	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_006448	ACTAAT	2	12	363064	363075	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1581	NC_006448	AT	3	6	363109	363114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_006448	TTGAG	2	10	363157	363166	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_006448	GTG	2	6	363380	363385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_006448	AT	3	6	363538	363543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_006448	A	6	6	363630	363635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_006448	CGG	2	6	363757	363762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_006448	TTTCTT	2	12	363826	363837	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1588	NC_006448	TA	3	6	363852	363857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_006448	T	6	6	363864	363869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_006448	T	7	7	364830	364836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_006448	TTA	2	6	365529	365534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_006448	T	6	6	365541	365546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_006448	ATT	2	6	366122	366127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_006448	TTA	3	9	366939	366947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_006448	ATT	2	6	368359	368364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_006448	A	6	6	368386	368391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_006448	T	6	6	368415	368420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_006448	AGG	2	6	368423	368428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_006448	TAT	2	6	369494	369499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_006448	A	7	7	370946	370952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_006448	ATT	2	6	370959	370964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_006448	GAA	2	6	371048	371053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_006448	AGG	2	6	371055	371060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_006448	ACA	2	6	371710	371715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_006448	A	6	6	371753	371758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_006448	TGATT	2	10	371816	371825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_006448	TA	3	6	371837	371842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_006448	A	6	6	371860	371865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_006448	ACA	2	6	371870	371875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_006448	ATT	2	6	372794	372799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_006448	TA	3	6	374212	374217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_006448	AT	3	6	374246	374251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_006448	TTA	2	6	374519	374524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_006448	ATT	2	6	374558	374563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_006448	TATT	2	8	374568	374575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_006448	A	6	6	374590	374595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_006448	A	7	7	377275	377281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_006448	ATCC	2	8	377296	377303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_006448	TATT	2	8	383168	383175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_006448	ATATCC	2	12	383194	383205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_006448	ACA	2	6	383493	383498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_006448	TCA	2	6	383509	383514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_006448	TTG	2	6	383528	383533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_006448	A	6	6	383543	383548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_006448	T	6	6	383551	383556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_006448	AGG	2	6	383627	383632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_006448	AGT	2	6	384393	384398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_006448	ATA	2	6	384428	384433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_006448	A	7	7	384456	384462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_006448	CTG	2	6	384489	384494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_006448	TGAT	2	8	384506	384513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_006448	T	6	6	384527	384532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_006448	TAA	2	6	384626	384631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_006448	GTGG	2	8	386365	386372	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_006448	ATG	2	6	386398	386403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_006448	T	6	6	386441	386446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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