MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 6711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006448	TAAA	2	8	180294	180301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_006448	CTT	2	6	181826	181831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_006448	T	6	6	181836	181841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_006448	GATT	2	8	181847	181854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_006448	T	6	6	181898	181903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_006448	ATT	2	6	181948	181953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_006448	CTTTA	2	10	181965	181974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_006448	GGA	2	6	182019	182024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_006448	GAA	2	6	183287	183292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006448	AAC	2	6	183294	183299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_006448	TTG	2	6	183309	183314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_006448	A	6	6	183339	183344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_006448	CT	4	8	183357	183364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_006448	A	7	7	183392	183398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_006448	GGT	2	6	186325	186330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_006448	CCT	2	6	186344	186349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_006448	TTA	2	6	186352	186357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_006448	TAA	2	6	186390	186395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_006448	ACA	3	9	186438	186446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_006448	GTC	2	6	186485	186490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_006448	ATTG	2	8	186521	186528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_006448	CAT	2	6	186728	186733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_006448	AG	4	8	186797	186804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_006448	AT	3	6	188748	188753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_006448	ACC	2	6	188782	188787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_006448	TAT	2	6	188791	188796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_006448	AAT	2	6	188818	188823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_006448	TCC	2	6	188845	188850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_006448	ATTTG	2	10	188876	188885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_006448	T	6	6	188887	188892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_006448	AAG	2	6	188895	188900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_006448	AT	3	6	188906	188911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_006448	A	7	7	188931	188937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_006448	AT	3	6	188946	188951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_006448	GA	3	6	189040	189045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_006448	TTG	2	6	189886	189891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_006448	TAT	2	6	193655	193660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_006448	ATA	2	6	195715	195720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_006448	T	6	6	195769	195774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_006448	AAT	2	6	195789	195794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_006448	A	6	6	195812	195817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_006448	TCAG	2	8	195818	195825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_006448	TGTC	2	8	195836	195843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_006448	CAAAAA	2	12	195855	195866	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1045	NC_006448	GGA	2	6	195867	195872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_006448	GGC	2	6	196843	196848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_006448	A	8	8	196859	196866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_006448	A	6	6	196868	196873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_006448	TA	3	6	196919	196924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_006448	TCA	2	6	197366	197371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_006448	ATC	2	6	197417	197422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_006448	ACA	2	6	197448	197453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_006448	ATA	2	6	199160	199165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_006448	A	7	7	200100	200106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_006448	ATAA	2	8	200119	200126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_006448	T	6	6	201552	201557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_006448	TTA	2	6	201561	201566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_006448	CAG	2	6	201596	201601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_006448	A	6	6	201654	201659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_006448	A	6	6	201661	201666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_006448	AGA	2	6	201694	201699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_006448	TTGT	2	8	202489	202496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_006448	TAG	2	6	202514	202519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_006448	ATT	2	6	202531	202536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_006448	GGA	2	6	202537	202542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_006448	GTG	3	9	204578	204586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_006448	CCT	2	6	205906	205911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_006448	A	6	6	207792	207797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_006448	ATCT	2	8	207909	207916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_006448	TTA	2	6	207976	207981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_006448	ATAA	2	8	208248	208255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_006448	TGT	2	6	208317	208322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_006448	AGA	2	6	208346	208351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_006448	A	8	8	211156	211163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_006448	T	6	6	211190	211195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_006448	ACA	2	6	211264	211269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_006448	GAGT	2	8	211639	211646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_006448	A	6	6	213276	213281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_006448	A	7	7	213283	213289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_006448	TAT	2	6	213360	213365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_006448	AACT	2	8	213368	213375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_006448	AT	3	6	213394	213399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_006448	TAT	2	6	214225	214230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_006448	T	9	9	214531	214539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_006448	TTAA	2	8	214551	214558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_006448	CAT	2	6	214606	214611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_006448	TTG	2	6	214615	214620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_006448	ATA	2	6	214661	214666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_006448	GAT	2	6	214672	214677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_006448	GTTT	2	8	214912	214919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_006448	TTTCT	2	10	214924	214933	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_006448	CTT	2	6	214936	214941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_006448	AAG	2	6	214954	214959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_006448	TGTT	2	8	214963	214970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_006448	TTA	2	6	215016	215021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_006448	ATTT	2	8	215039	215046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_006448	CTT	2	6	215071	215076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_006448	TTC	2	6	215135	215140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_006448	CAT	2	6	215146	215151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_006448	CAT	2	6	215161	215166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_006448	CTG	2	6	215188	215193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_006448	T	7	7	215264	215270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_006448	GTTT	2	8	215283	215290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_006448	GCT	2	6	215322	215327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_006448	A	6	6	215373	215378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_006448	CAATC	2	10	215380	215389	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1107	NC_006448	TTG	2	6	215390	215395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_006448	GAGT	2	8	216299	216306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_006448	TGCT	2	8	219988	219995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_006448	T	6	6	219997	220002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_006448	TAA	2	6	220007	220012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_006448	GCC	2	6	220037	220042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_006448	T	6	6	220047	220052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_006448	CATT	2	8	220078	220085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_006448	AAAG	2	8	220143	220150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_006448	GA	3	6	220764	220769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_006448	TCT	2	6	221321	221326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_006448	GA	3	6	221329	221334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_006448	T	6	6	221342	221347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_006448	A	6	6	221353	221358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_006448	GTT	2	6	221417	221422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_006448	CAA	2	6	221788	221793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_006448	TAA	2	6	221844	221849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_006448	GTTG	2	8	221898	221905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_006448	AGT	2	6	221964	221969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_006448	TAA	2	6	221970	221975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_006448	ATC	2	6	222022	222027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_006448	TAGTA	2	10	223033	223042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_006448	T	6	6	223053	223058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_006448	TA	3	6	223060	223065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_006448	A	7	7	223073	223079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_006448	GA	3	6	223175	223180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_006448	TTTG	2	8	225691	225698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_006448	CTAA	2	8	225738	225745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_006448	TTG	2	6	225758	225763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_006448	ATCA	2	8	225970	225977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_006448	A	7	7	226142	226148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_006448	A	6	6	226168	226173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_006448	AGC	2	6	226202	226207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_006448	AAT	2	6	326798	326803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_006448	AATATT	2	12	326813	326824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_006448	ATT	2	6	326850	326855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_006448	T	6	6	328354	328359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_006448	T	6	6	328362	328367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_006448	ATT	2	6	330821	330826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_006448	GCTAT	2	10	330845	330854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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