MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 6711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006448	TAGC	2	8	101454	101461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_006448	TCC	2	6	101486	101491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_006448	TGA	2	6	101501	101506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_006448	T	6	6	101517	101522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_006448	AGG	2	6	101530	101535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006448	AGA	2	6	102516	102521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006448	A	6	6	102521	102526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006448	A	6	6	102532	102537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006448	GGTA	2	8	102550	102557	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_006448	T	7	7	102576	102582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_006448	TA	4	8	102691	102698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006448	T	10	10	103629	103638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_006448	TAT	2	6	103685	103690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006448	T	7	7	103690	103696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_006448	CAG	2	6	103719	103724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_006448	TTA	2	6	104020	104025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_006448	TTTAC	2	10	104034	104043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
518	NC_006448	GGA	2	6	104044	104049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006448	T	6	6	104351	104356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_006448	TCT	2	6	104416	104421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_006448	ATTTT	2	10	104453	104462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006448	ATA	2	6	104463	104468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_006448	GAAT	2	8	104483	104490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_006448	ATT	2	6	104500	104505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_006448	AAAT	2	8	104509	104516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006448	TAT	2	6	104527	104532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_006448	AAG	2	6	104545	104550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_006448	ATTG	2	8	104676	104683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006448	T	7	7	104712	104718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_006448	AAT	2	6	104805	104810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_006448	T	6	6	104820	104825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_006448	GAA	2	6	107659	107664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006448	A	6	6	109823	109828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_006448	ATTT	2	8	109913	109920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_006448	ATTAT	2	10	109922	109931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_006448	CAT	2	6	109932	109937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_006448	TTAG	2	8	109952	109959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_006448	TAA	2	6	109993	109998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_006448	TGA	2	6	110002	110007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_006448	GGA	2	6	110030	110035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006448	TTAC	2	8	110098	110105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_006448	AT	4	8	110126	110133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006448	GTT	2	6	110138	110143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006448	TA	3	6	110157	110162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006448	CTA	2	6	110233	110238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_006448	GAT	2	6	110316	110321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006448	AGA	2	6	110966	110971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_006448	AGT	2	6	110976	110981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006448	A	6	6	111023	111028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006448	AAAAG	2	10	111054	111063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
551	NC_006448	T	7	7	111223	111229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006448	CCA	2	6	111249	111254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_006448	CCA	2	6	111261	111266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_006448	CCA	2	6	111272	111277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_006448	CCT	2	6	112501	112506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_006448	ATTG	2	8	112535	112542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006448	TTG	2	6	112552	112557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_006448	TAT	2	6	112619	112624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_006448	T	6	6	112653	112658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_006448	ATG	2	6	112698	112703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_006448	TTA	2	6	112715	112720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_006448	AT	3	6	112777	112782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_006448	TAAAAA	2	12	112794	112805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_006448	AGA	2	6	112806	112811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_006448	CTG	2	6	112825	112830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_006448	TTC	2	6	112844	112849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_006448	TTAT	2	8	112850	112857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_006448	A	7	7	112868	112874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_006448	AGCAA	2	10	112877	112886	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
570	NC_006448	TTA	2	6	112913	112918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006448	TGA	2	6	112951	112956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_006448	T	7	7	112962	112968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_006448	ACT	2	6	114056	114061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_006448	TGT	2	6	114077	114082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006448	TAAA	2	8	114103	114110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_006448	T	7	7	114126	114132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_006448	GATT	2	8	114133	114140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_006448	CTT	2	6	114141	114146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_006448	ATTA	2	8	114200	114207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_006448	TAA	2	6	114242	114247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006448	ATT	2	6	114262	114267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_006448	CTT	2	6	114559	114564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_006448	AGAC	2	8	114608	114615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
584	NC_006448	TGT	2	6	114707	114712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_006448	GT	3	6	114730	114735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006448	ACC	2	6	114821	114826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_006448	ATG	2	6	114909	114914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_006448	CAA	2	6	114931	114936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_006448	ATT	2	6	114956	114961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006448	TAAA	2	8	115007	115014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_006448	TCC	2	6	115730	115735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_006448	TAT	2	6	115749	115754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_006448	TAG	2	6	115769	115774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_006448	TTA	2	6	115809	115814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_006448	T	6	6	115818	115823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_006448	ATC	2	6	115824	115829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_006448	T	7	7	115841	115847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006448	ATG	2	6	115876	115881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_006448	ATTGT	2	10	117221	117230	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006448	GTT	2	6	117258	117263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_006448	TGT	2	6	117305	117310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_006448	T	6	6	117323	117328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_006448	A	6	6	117333	117338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_006448	A	7	7	117353	117359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_006448	TA	3	6	117389	117394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006448	ATG	2	6	117402	117407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006448	GAT	2	6	119043	119048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006448	TGA	2	6	119080	119085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006448	GCTA	2	8	119090	119097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_006448	AGG	2	6	119146	119151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006448	TAT	2	6	119622	119627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006448	GGTGAT	2	12	119668	119679	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006448	TCG	2	6	119684	119689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006448	T	6	6	121268	121273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006448	T	7	7	121328	121334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006448	T	8	8	121336	121343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006448	ATA	2	6	121370	121375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006448	TAA	2	6	121410	121415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006448	GA	3	6	123114	123119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_006448	AGA	2	6	123166	123171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_006448	A	6	6	123171	123176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_006448	AGAA	2	8	123181	123188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_006448	GAA	2	6	125081	125086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_006448	AGAA	2	8	125099	125106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_006448	CA	3	6	125168	125173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_006448	AAG	2	6	125223	125228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_006448	AAGTG	2	10	125270	125279	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
628	NC_006448	TTCGT	2	10	125299	125308	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
629	NC_006448	AATA	2	8	125309	125316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_006448	TCG	2	6	125340	125345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_006448	AGAT	2	8	125375	125382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_006448	AGT	2	6	125397	125402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_006448	A	7	7	126676	126682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006448	TGATA	2	10	126685	126694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
635	NC_006448	A	6	6	128207	128212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_006448	TTA	2	6	128219	128224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_006448	TCCAAC	2	12	128272	128283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_006448	A	7	7	128764	128770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_006448	AAG	2	6	128786	128791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_006448	GAT	2	6	128793	128798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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