MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 6711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006448	GGT	2	6	1204162	1204167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_006448	CTG	2	6	1204876	1204881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_006448	ATC	2	6	1204916	1204921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_006448	AAG	2	6	1204959	1204964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_006448	ATTT	2	8	1205017	1205024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_006448	ATCTA	2	10	1205035	1205044	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4507	NC_006448	ATA	2	6	1205063	1205068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_006448	ATT	2	6	1210261	1210266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_006448	TTG	2	6	1210296	1210301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_006448	TTTC	2	8	1210311	1210318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_006448	TTC	2	6	1210333	1210338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_006448	CTT	2	6	1210361	1210366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_006448	TAA	2	6	1211963	1211968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_006448	A	6	6	1212005	1212010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_006448	TAA	2	6	1212067	1212072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_006448	ATT	2	6	1212089	1212094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_006448	A	6	6	1212098	1212103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_006448	TCT	2	6	1212514	1212519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_006448	A	6	6	1212653	1212658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_006448	ATT	2	6	1212662	1212667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_006448	AAC	2	6	1212700	1212705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_006448	TAA	2	6	1212725	1212730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_006448	A	6	6	1212742	1212747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_006448	GGTT	2	8	1213133	1213140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_006448	TC	3	6	1213161	1213166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_006448	T	6	6	1213187	1213192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_006448	GATC	2	8	1213502	1213509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_006448	TATT	2	8	1213935	1213942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_006448	CTT	2	6	1214427	1214432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_006448	CAA	2	6	1214691	1214696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_006448	ATA	2	6	1214701	1214706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_006448	GTT	2	6	1214710	1214715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_006448	A	7	7	1216585	1216591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_006448	AGT	2	6	1216620	1216625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_006448	AGT	2	6	1217776	1217781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_006448	T	7	7	1217819	1217825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_006448	AGA	2	6	1217832	1217837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_006448	TA	3	6	1217851	1217856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_006448	TA	3	6	1217859	1217864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_006448	T	6	6	1217884	1217889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_006448	T	6	6	1217905	1217910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_006448	AGG	2	6	1217930	1217935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_006448	CAA	2	6	1218321	1218326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_006448	T	6	6	1218343	1218348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_006448	TATCC	2	10	1218378	1218387	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4546	NC_006448	AATAA	2	10	1218394	1218403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_006448	ATT	2	6	1218423	1218428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_006448	ATA	2	6	1218454	1218459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_006448	ACA	2	6	1218466	1218471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_006448	CTT	2	6	1218731	1218736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_006448	AAT	2	6	1218801	1218806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_006448	TAAA	2	8	1218892	1218899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_006448	AAATA	2	10	1218904	1218913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_006448	TAA	2	6	1218919	1218924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_006448	ATT	2	6	1219599	1219604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_006448	AAAT	2	8	1219660	1219667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_006448	ATT	2	6	1219680	1219685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_006448	A	7	7	1219700	1219706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_006448	CGA	2	6	1219813	1219818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_006448	GAA	2	6	1219831	1219836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_006448	ACT	2	6	1220257	1220262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_006448	TAGA	2	8	1220287	1220294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_006448	TCA	2	6	1220350	1220355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4565	NC_006448	A	6	6	1220519	1220524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_006448	CAT	2	6	1220551	1220556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4568	NC_006448	AC	3	6	1220679	1220684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_006448	T	6	6	1220709	1220714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_006448	AAT	2	6	1220803	1220808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_006448	T	6	6	1222919	1222924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_006448	CTAG	2	8	1222925	1222932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_006448	T	6	6	1222937	1222942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_006448	TTAAT	2	10	1223101	1223110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_006448	T	6	6	1223120	1223125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_006448	T	6	6	1223134	1223139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_006448	A	6	6	1223165	1223170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_006448	AT	3	6	1223221	1223226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_006448	TA	3	6	1223262	1223267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_006448	AGC	2	6	1223276	1223281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4582	NC_006448	A	8	8	1223322	1223329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4587	NC_006448	GAG	2	6	1223935	1223940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_006448	ATG	2	6	1224043	1224048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_006448	A	7	7	1224051	1224057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_006448	TCCG	2	8	1224058	1224065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_006448	T	6	6	1224069	1224074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_006448	GTT	2	6	1224139	1224144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4594	NC_006448	TAT	2	6	1224219	1224224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4600	NC_006448	AAT	2	6	1229093	1229098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_006448	T	6	6	1229141	1229146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_006448	GTA	2	6	1229182	1229187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_006448	ATT	2	6	1229228	1229233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_006448	AT	3	6	1229314	1229319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_006448	AC	3	6	1229375	1229380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_006448	AAT	2	6	1229447	1229452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4612	NC_006448	ATT	2	6	1235616	1235621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_006448	A	6	6	1235627	1235632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_006448	ACA	2	6	1235641	1235646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_006448	TA	4	8	1235649	1235656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_006448	T	7	7	1235664	1235670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_006448	TAT	2	6	1235674	1235679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4619	NC_006448	T	7	7	1239461	1239467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_006448	A	7	7	1239482	1239488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_006448	GTTAT	2	10	1239494	1239503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_006448	GAG	2	6	1239514	1239519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_006448	T	6	6	1240608	1240613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_006448	ACAT	2	8	1240654	1240661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_006448	ACA	2	6	1240766	1240771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_006448	TCA	2	6	1240787	1240792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_006448	ATT	2	6	1240805	1240810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_006448	T	6	6	1240809	1240814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_006448	ACC	3	9	1240939	1240947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_006448	TACTG	2	10	1240949	1240958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4631	NC_006448	A	6	6	1240964	1240969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_006448	CAAT	2	8	1240975	1240982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4634	NC_006448	AAT	2	6	1241057	1241062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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