MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	TGGT	2	8	65	72	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005232	AGGC	2	8	180	187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005232	AAAG	2	8	381	388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005232	CTTA	2	8	3339	3346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_005232	AAAG	2	8	3421	3428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005232	TTTA	2	8	3456	3463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005232	CCGG	2	8	4430	4437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_005232	CTTT	2	8	7488	7495	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_005232	AGAA	2	8	10931	10938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005232	ATTT	2	8	11238	11245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005232	TAAA	2	8	11250	11257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005232	AATC	2	8	21484	21491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_005232	AAGA	2	8	22172	22179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005232	ATTA	2	8	22433	22440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005232	GAAA	2	8	22443	22450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005232	ATCA	2	8	22970	22977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_005232	CAAT	2	8	23875	23882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005232	TTAT	2	8	24176	24183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005232	CTTG	2	8	27829	27836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005232	AGAA	2	8	27891	27898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005232	ATTT	2	8	42318	42325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005232	TCTT	2	8	43021	43028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_005232	TTCA	2	8	55470	55477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_005232	TATT	2	8	57675	57682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005232	AAAG	2	8	58138	58145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005232	TTTA	2	8	58173	58180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005232	CCGG	2	8	59148	59155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_005232	CTTT	2	8	62206	62213	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_005232	AGAA	2	8	65649	65656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005232	ATTT	2	8	65956	65963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005232	TAAA	2	8	65968	65975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005232	AATC	2	8	76202	76209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005232	AAGA	2	8	76890	76897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005232	ATTA	2	8	77151	77158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005232	GAAA	2	8	77161	77168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005232	ATCA	2	8	77688	77695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005232	CAAT	2	8	78593	78600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_005232	TTAT	2	8	78894	78901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005232	CGCC	2	8	86882	86889	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_005232	CTGT	2	8	86957	86964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_005232	CAGA	2	8	88027	88034	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_005232	CTTA	2	8	94257	94264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_005232	CATG	2	8	98658	98665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_005232	CCAT	2	8	98822	98829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005232	ATCA	2	8	98887	98894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_005232	TTCA	2	8	102007	102014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_005232	ATCG	2	8	102098	102105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005232	TCAG	2	8	102766	102773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_005232	TAAA	2	8	102798	102805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005232	CCTG	2	8	105553	105560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.