MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 4839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005070	GTCA	2	8	1534507	1534514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_005070	GTG	2	6	1534655	1534660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_005070	ACC	2	6	1534661	1534666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_005070	AGC	2	6	1534717	1534722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_005070	CCA	2	6	1538393	1538398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_005070	TTTA	2	8	1539671	1539678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_005070	ACTG	2	8	1542733	1542740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_005070	AGC	2	6	1542743	1542748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_005070	C	6	6	1542764	1542769	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3010	NC_005070	G	6	6	1544136	1544141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_005070	GTC	2	6	1544145	1544150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_005070	CCA	2	6	1544159	1544164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_005070	C	6	6	1545154	1545159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3014	NC_005070	CCA	2	6	1545205	1545210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_005070	TCC	2	6	1545236	1545241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_005070	GTT	2	6	1546553	1546558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_005070	TTC	2	6	1547508	1547513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_005070	TCT	2	6	1550480	1550485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_005070	GCCTG	2	10	1552386	1552395	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3020	NC_005070	CAA	2	6	1552949	1552954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_005070	A	6	6	1552953	1552958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_005070	ATC	2	6	1552966	1552971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_005070	GACCA	2	10	1553765	1553774	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_005070	GCA	2	6	1555299	1555304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_005070	GCC	2	6	1555305	1555310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_005070	ACC	2	6	1555316	1555321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_005070	GGC	2	6	1556801	1556806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_005070	TGC	2	6	1556841	1556846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_005070	GAA	2	6	1556850	1556855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_005070	TCC	2	6	1560972	1560977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_005070	GTG	2	6	1560981	1560986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_005070	A	6	6	1561010	1561015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_005070	CA	3	6	1561261	1561266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_005070	GGA	2	6	1561269	1561274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_005070	GCA	2	6	1563854	1563859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_005070	A	6	6	1567363	1567368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_005070	AC	3	6	1569661	1569666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_005070	CCA	2	6	1569999	1570004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_005070	C	6	6	1570090	1570095	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3040	NC_005070	GCCG	2	8	1570141	1570148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_005070	TACA	2	8	1571524	1571531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_005070	CGC	2	6	1572822	1572827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_005070	CT	3	6	1574056	1574061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_005070	CGG	2	6	1577681	1577686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_005070	CTCG	2	8	1577746	1577753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_005070	AC	3	6	1577788	1577793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_005070	CCGCTT	2	12	1577820	1577831	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_005070	GTT	2	6	1579246	1579251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_005070	CTG	2	6	1580332	1580337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_005070	GCA	2	6	1581581	1581586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_005070	GA	3	6	1581610	1581615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_005070	GCT	2	6	1582814	1582819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_005070	C	8	8	1586712	1586719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3054	NC_005070	CGCC	2	8	1587407	1587414	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3055	NC_005070	TC	3	6	1591454	1591459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_005070	TCG	2	6	1591807	1591812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_005070	TCG	2	6	1591830	1591835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_005070	AAG	2	6	1591860	1591865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_005070	AACA	2	8	1591886	1591893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_005070	AAT	2	6	1591906	1591911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_005070	TAA	2	6	1592017	1592022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_005070	ACG	2	6	1592045	1592050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_005070	TTC	2	6	1592089	1592094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_005070	TGC	2	6	1592108	1592113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_005070	AAC	3	9	1592118	1592126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_005070	AACA	2	8	1592162	1592169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_005070	AATC	2	8	1592194	1592201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_005070	T	6	6	1592215	1592220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_005070	GCCAA	2	10	1592242	1592251	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3070	NC_005070	ACAA	2	8	1593402	1593409	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_005070	AAACG	2	10	1593437	1593446	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_005070	TCT	2	6	1593537	1593542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3074	NC_005070	AGC	2	6	1593578	1593583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_005070	CGATT	2	10	1593610	1593619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3076	NC_005070	T	7	7	1593639	1593645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_005070	ACC	2	6	1593690	1593695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_005070	CAG	2	6	1593781	1593786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_005070	GTT	2	6	1593804	1593809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_005070	GGA	2	6	1594116	1594121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_005070	CCT	2	6	1594284	1594289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_005070	GC	3	6	1594300	1594305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_005070	ACG	2	6	1594451	1594456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_005070	CAG	2	6	1594556	1594561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_005070	TAAG	2	8	1594583	1594590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_005070	TCG	2	6	1595033	1595038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_005070	GCA	2	6	1595039	1595044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_005070	GCA	2	6	1595085	1595090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_005070	A	6	6	1595111	1595116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_005070	GGC	2	6	1595117	1595122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_005070	GCC	2	6	1595130	1595135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_005070	CAG	2	6	1595179	1595184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_005070	CT	3	6	1595192	1595197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_005070	A	8	8	1595238	1595245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_005070	CT	3	6	1595261	1595266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_005070	ACCA	2	8	1595348	1595355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_005070	AAG	2	6	1595375	1595380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_005070	TCAT	2	8	1595411	1595418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_005070	CCT	2	6	1595948	1595953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_005070	CCG	2	6	1595958	1595963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_005070	TCAA	2	8	1596178	1596185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_005070	GCC	2	6	1596581	1596586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_005070	AGG	2	6	1596612	1596617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_005070	CGGA	2	8	1596662	1596669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_005070	CAG	2	6	1596687	1596692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_005070	CAAA	2	8	1596709	1596716	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_005070	T	6	6	1596789	1596794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_005070	GT	3	6	1596988	1596993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_005070	G	6	6	1597135	1597140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_005070	TCC	2	6	1597173	1597178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_005070	CCT	2	6	1597216	1597221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_005070	AC	3	6	1597265	1597270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_005070	AGGC	2	8	1597428	1597435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_005070	GGTT	2	8	1597469	1597476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_005070	TCA	2	6	1597483	1597488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_005070	T	6	6	1597538	1597543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_005070	TTC	2	6	1597664	1597669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_005070	TTC	2	6	1597679	1597684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_005070	TGCC	2	8	1597753	1597760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_005070	TGCC	2	8	1597767	1597774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_005070	TGG	2	6	1597790	1597795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_005070	TGC	2	6	1597819	1597824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_005070	A	6	6	1597858	1597863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_005070	AAC	2	6	1597998	1598003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_005070	CAT	2	6	1598090	1598095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3130	NC_005070	GGA	2	6	1598120	1598125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_005070	GAT	2	6	1598169	1598174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_005070	CGT	2	6	1598513	1598518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_005070	AG	3	6	1598532	1598537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_005070	CTT	2	6	1598581	1598586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_005070	CTTCT	2	10	1598588	1598597	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3136	NC_005070	GAT	2	6	1598614	1598619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3140	NC_005070	TCCG	2	8	1598811	1598818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3142	NC_005070	TCT	2	6	1598871	1598876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_005070	GGA	3	9	1598915	1598923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_005070	CATG	2	8	1601067	1601074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3166	NC_005070	ACAT	2	8	1601103	1601110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3172	NC_005070	CGG	2	6	1601688	1601693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3250	NC_005070	C	6	6	1608896	1608901	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3251	NC_005070	GCA	3	9	1608914	1608922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_005070	AGC	2	6	1608934	1608939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3254	NC_005070	GGGA	2	8	1610363	1610370	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_005070	GCC	2	6	1610420	1610425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3256	NC_005070	ATCC	2	8	1610426	1610433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_005070	CTC	2	6	1610456	1610461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3258	NC_005070	CGT	2	6	1610468	1610473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_005070	TCGA	2	8	1610548	1610555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3261	NC_005070	ACG	2	6	1611001	1611006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3385	NC_005070	TTGGTC	2	12	1700001	1700012	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3389	NC_005070	ACC	2	6	1702968	1702973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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