MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 4839

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< Previous 1 2 3 456 7 8 9 10 Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_005070	CAG	2	6	1155744	1155749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_005070	CACC	2	8	1155757	1155764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2003	NC_005070	AGCA	2	8	1155813	1155820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2004	NC_005070	AAT	2	6	1155835	1155840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_005070	ACT	2	6	1155849	1155854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_005070	ACC	2	6	1155904	1155909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_005070	GGC	2	6	1155932	1155937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_005070	AGTT	2	8	1155953	1155960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_005070	CACGA	2	10	1155962	1155971	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2010	NC_005070	CAT	2	6	1155998	1156003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_005070	AGCA	2	8	1156011	1156018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2012	NC_005070	ACA	2	6	1156086	1156091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_005070	CTA	2	6	1156128	1156133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_005070	TAA	2	6	1156148	1156153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_005070	ATT	2	6	1156167	1156172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_005070	AGAT	2	8	1156198	1156205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_005070	TTCC	2	8	1156290	1156297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2018	NC_005070	CTG	2	6	1156299	1156304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_005070	CAAGA	2	10	1156310	1156319	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2020	NC_005070	TAA	2	6	1156325	1156330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_005070	TAAT	2	8	1156367	1156374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_005070	TTAT	2	8	1157214	1157221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_005070	A	8	8	1157247	1157254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_005070	AT	3	6	1157301	1157306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_005070	TCC	2	6	1157327	1157332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2031	NC_005070	T	7	7	1157506	1157512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_005070	TAGG	2	8	1157542	1157549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_005070	TGAT	2	8	1157569	1157576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2035	NC_005070	CACT	2	8	1157648	1157655	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2037	NC_005070	ATCT	2	8	1157774	1157781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2044	NC_005070	CTTG	2	8	1163998	1164005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2052	NC_005070	ATGT	2	8	1171886	1171893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_005070	CTCAT	2	10	1172493	1172502	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2062	NC_005070	ATA	2	6	1172796	1172801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2127	NC_005070	CA	3	6	1184929	1184934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2128	NC_005070	CTT	2	6	1184944	1184949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_005070	AG	3	6	1194041	1194046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2131	NC_005070	CTGG	2	8	1195243	1195250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2132	NC_005070	CTG	2	6	1195253	1195258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_005070	CCG	2	6	1195278	1195283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2134	NC_005070	GTC	2	6	1198347	1198352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_005070	CAG	2	6	1198356	1198361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_005070	CTG	2	6	1198365	1198370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_005070	CAC	2	6	1198371	1198376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2138	NC_005070	TCC	2	6	1201321	1201326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2139	NC_005070	TGC	3	9	1201327	1201335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2140	NC_005070	TTG	2	6	1201342	1201347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_005070	GGC	2	6	1201352	1201357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2143	NC_005070	CGTT	2	8	1204043	1204050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2144	NC_005070	GAT	2	6	1204791	1204796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_005070	GCT	2	6	1204856	1204861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2149	NC_005070	AGGA	2	8	1205100	1205107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2162	NC_005070	GC	3	6	1222096	1222101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2163	NC_005070	TGA	2	6	1222197	1222202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2165	NC_005070	A	6	6	1222316	1222321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_005070	TTG	2	6	1222325	1222330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2241	NC_005070	AT	3	6	1299354	1299359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2242	NC_005070	AG	3	6	1299391	1299396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_005070	AAG	3	9	1299478	1299486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_005070	ATTT	2	8	1299594	1299601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_005070	GAT	2	6	1299606	1299611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2247	NC_005070	AATA	2	8	1299648	1299655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2248	NC_005070	GA	3	6	1300402	1300407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_005070	GA	4	8	1301065	1301072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_005070	TCC	2	6	1301153	1301158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2251	NC_005070	AGG	2	6	1301175	1301180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_005070	CTG	2	6	1301193	1301198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_005070	CGT	2	6	1301474	1301479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2254	NC_005070	GAG	2	6	1301533	1301538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_005070	TGA	2	6	1301716	1301721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_005070	CCTA	2	8	1301728	1301735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2257	NC_005070	TTC	2	6	1301752	1301757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_005070	GTC	3	9	1302651	1302659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2259	NC_005070	TGT	2	6	1302666	1302671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2261	NC_005070	GACT	2	8	1302714	1302721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2262	NC_005070	GCAA	2	8	1302776	1302783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2263	NC_005070	CAT	2	6	1302860	1302865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2265	NC_005070	GTG	2	6	1305232	1305237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2266	NC_005070	AGCG	2	8	1309148	1309155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2267	NC_005070	TTC	2	6	1309174	1309179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2272	NC_005070	CTAGG	2	10	1311245	1311254	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2273	NC_005070	GCCA	2	8	1312215	1312222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2392	NC_005070	CTC	2	6	1345103	1345108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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