MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 4839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005070	ACG	2	6	584603	584608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_005070	GAA	2	6	586718	586723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_005070	GC	3	6	586833	586838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_005070	GCT	2	6	586850	586855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_005070	CCA	2	6	586876	586881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_005070	CG	3	6	586885	586890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_005070	CCAT	2	8	586902	586909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_005070	GGT	2	6	587240	587245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_005070	CCAA	2	8	588873	588880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_005070	GAG	2	6	590970	590975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_005070	TGT	2	6	592180	592185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_005070	TGGCC	2	10	592188	592197	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1013	NC_005070	GTC	3	9	592257	592265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_005070	GCG	2	6	592299	592304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_005070	GCC	2	6	592332	592337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_005070	CT	3	6	592404	592409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_005070	TCC	2	6	595749	595754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_005070	CCG	2	6	595757	595762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_005070	TTC	2	6	597672	597677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_005070	GC	3	6	597708	597713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_005070	CCT	2	6	601819	601824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_005070	TGA	2	6	603786	603791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_005070	T	7	7	605570	605576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_005070	AAC	2	6	605579	605584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_005070	GTG	2	6	605604	605609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_005070	GCACTG	2	12	605616	605627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_005070	TCA	2	6	605702	605707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_005070	GCA	2	6	605713	605718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_005070	G	6	6	606526	606531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_005070	CAG	3	9	606672	606680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_005070	GTCCT	2	10	606739	606748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1032	NC_005070	TCTT	2	8	606751	606758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_005070	GGT	2	6	606843	606848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_005070	CCG	2	6	607681	607686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_005070	TTG	2	6	607764	607769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_005070	GCT	2	6	613069	613074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_005070	AAC	2	6	613142	613147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_005070	TCC	2	6	613156	613161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_005070	ATCG	2	8	624263	624270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_005070	GGA	2	6	638179	638184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_005070	CAT	2	6	638198	638203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_005070	GTC	2	6	645691	645696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_005070	CG	3	6	645701	645706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_005070	TTCC	2	8	646327	646334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_005070	CTC	2	6	648318	648323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_005070	GAGCA	2	10	654460	654469	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_005070	TCT	2	6	654487	654492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_005070	AGC	2	6	657433	657438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_005070	GCT	2	6	658481	658486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_005070	GAAG	2	8	658504	658511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_005070	TGT	2	6	658543	658548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_005070	GCAT	2	8	661222	661229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_005070	CCCG	2	8	661271	661278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1054	NC_005070	ATG	2	6	661292	661297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_005070	GCT	2	6	665684	665689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_005070	CA	3	6	667790	667795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_005070	GAA	2	6	668989	668994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_005070	CGAT	2	8	669090	669097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_005070	GGA	2	6	669103	669108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_005070	CG	3	6	669119	669124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_005070	ACT	2	6	669132	669137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_005070	AGG	2	6	669171	669176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_005070	CAG	2	6	670642	670647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_005070	GCA	3	9	670674	670682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_005070	GAT	2	6	670755	670760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_005070	ACT	2	6	670764	670769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_005070	TGAGT	2	10	672446	672455	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_005070	CAG	2	6	672494	672499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_005070	TAA	2	6	672525	672530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_005070	GAA	2	6	672813	672818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_005070	TTC	2	6	675252	675257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_005070	TCA	2	6	675272	675277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_005070	CGGT	2	8	675302	675309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_005070	CGA	2	6	680498	680503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_005070	GTGA	2	8	680587	680594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_005070	CCA	2	6	682273	682278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_005070	CGA	2	6	682283	682288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_005070	ACG	2	6	682312	682317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_005070	CGT	2	6	689544	689549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_005070	GCA	2	6	689573	689578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_005070	CGC	2	6	689606	689611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_005070	TTG	2	6	690739	690744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_005070	TGT	2	6	690760	690765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_005070	CGCT	2	8	690766	690773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_005070	TTGA	2	8	690781	690788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_005070	TCAA	2	8	690796	690803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_005070	TGC	2	6	692449	692454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_005070	CATG	2	8	696929	696936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_005070	CGT	2	6	703880	703885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_005070	GAA	2	6	705027	705032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_005070	C	8	8	706379	706386	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1092	NC_005070	ATG	2	6	706734	706739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_005070	GC	3	6	706835	706840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_005070	G	6	6	706847	706852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_005070	GAG	2	6	706856	706861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_005070	TG	3	6	706862	706867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_005070	TGA	2	6	708076	708081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_005070	TCA	2	6	708086	708091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_005070	GCG	2	6	708108	708113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_005070	TCC	2	6	708648	708653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_005070	GGT	2	6	708674	708679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_005070	GAGT	2	8	717033	717040	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_005070	CAC	2	6	717238	717243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_005070	CGATT	2	10	717331	717340	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_005070	GATT	2	8	717350	717357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_005070	AAC	2	6	717378	717383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_005070	GCA	2	6	717399	717404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_005070	TGAG	2	8	717422	717429	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_005070	GTC	2	6	717956	717961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_005070	TCA	2	6	717968	717973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_005070	TTGA	2	8	717976	717983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_005070	GAT	2	6	718376	718381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_005070	CGGT	2	8	718443	718450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_005070	GAT	2	6	719829	719834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_005070	TTG	2	6	726622	726627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_005070	TGG	2	6	726949	726954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_005070	TTC	2	6	726962	726967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_005070	ATGA	2	8	726986	726993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_005070	TCT	2	6	727026	727031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_005070	AGTC	2	8	727038	727045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_005070	GTC	2	6	727078	727083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_005070	CT	3	6	727095	727100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_005070	TGA	2	6	727110	727115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_005070	TCA	2	6	727131	727136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_005070	CTT	2	6	727150	727155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_005070	GA	3	6	727254	727259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_005070	TTC	2	6	727260	727265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_005070	CAG	2	6	727936	727941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_005070	TGC	2	6	729757	729762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_005070	GGA	2	6	731052	731057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_005070	GCG	2	6	731071	731076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_005070	GGT	2	6	731083	731088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_005070	T	6	6	732686	732691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1261	NC_005070	GCAA	2	8	848932	848939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1263	NC_005070	TCAG	2	8	850091	850098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1264	NC_005070	CTT	2	6	850105	850110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_005070	AAGG	2	8	850120	850127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_005070	TCA	2	6	850133	850138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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