MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004851	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004851	AT	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004851	AT	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004851	AT	3	6	4811	4816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004851	AT	3	6	4963	4968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004851	TG	3	6	4989	4994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004851	TA	4	8	5113	5120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004851	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004851	AT	3	6	7014	7019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004851	AT	3	6	10319	10324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004851	AT	5	10	11933	11942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004851	CT	3	6	12423	12428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004851	AT	3	6	18740	18745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004851	TC	3	6	19614	19619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_004851	TG	3	6	19627	19632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004851	CT	3	6	20537	20542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004851	AG	3	6	20548	20553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004851	AT	3	6	21341	21346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004851	GA	3	6	21649	21654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004851	GC	3	6	26849	26854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004851	GA	3	6	30097	30102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004851	AT	3	6	30956	30961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004851	AG	4	8	35233	35240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004851	AT	3	6	38555	38560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004851	AT	3	6	39445	39450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004851	AT	3	6	39517	39522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004851	AT	3	6	39572	39577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004851	AT	3	6	47728	47733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004851	AT	4	8	49386	49393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004851	AG	4	8	58712	58719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004851	CA	3	6	61832	61837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_004851	GA	3	6	67856	67861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004851	TA	3	6	68265	68270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004851	AT	3	6	69973	69978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004851	TC	4	8	74630	74637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004851	TG	3	6	77501	77506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004851	TA	3	6	79614	79619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004851	AT	3	6	79884	79889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004851	TA	4	8	81433	81440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004851	AT	3	6	81764	81769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004851	TC	3	6	86443	86448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004851	TG	3	6	86579	86584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004851	AC	3	6	86688	86693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_004851	CT	3	6	86765	86770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_004851	GA	3	6	86911	86916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004851	AT	3	6	90815	90820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004851	CT	3	6	94821	94826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004851	TG	3	6	99294	99299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004851	CT	3	6	103227	103232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004851	AT	3	6	103516	103521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004851	TG	3	6	104947	104952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004851	TG	3	6	105003	105008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004851	AT	3	6	105369	105374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004851	AT	3	6	110111	110116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004851	TA	3	6	116102	116107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004851	AT	3	6	116108	116113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004851	AG	3	6	116271	116276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004851	CA	3	6	130570	130575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004851	AG	3	6	135852	135857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004851	TA	3	6	135888	135893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004851	GC	3	6	138728	138733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004851	GT	3	6	138949	138954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004851	GA	3	6	138956	138961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004851	TG	3	6	139076	139081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004851	CG	3	6	139143	139148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_004851	AG	4	8	139256	139263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004851	TA	3	6	140839	140844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004851	AG	3	6	141896	141901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004851	AT	4	8	149151	149158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004851	AT	3	6	149515	149520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004851	AT	3	6	149569	149574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004851	AT	3	6	153231	153236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004851	GA	3	6	157229	157234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004851	CA	4	8	159007	159014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_004851	CA	3	6	161291	161296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004851	GT	3	6	163075	163080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004851	TA	3	6	166990	166995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004851	AT	3	6	171883	171888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004851	TA	4	8	172626	172633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004851	AT	3	6	172760	172765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004851	AC	3	6	172837	172842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004851	AT	3	6	176523	176528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004851	TC	3	6	177193	177198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_004851	AT	3	6	180494	180499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004851	TA	3	6	183264	183269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004851	TA	3	6	183275	183280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004851	CA	3	6	183749	183754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_004851	TG	3	6	183776	183781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004851	TC	3	6	185212	185217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004851	GT	3	6	185517	185522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004851	GT	3	6	195676	195681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004851	TG	3	6	197179	197184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004851	AG	4	8	205473	205480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004851	TC	3	6	215068	215073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_004851	AT	3	6	215109	215114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004851	AT	3	6	215223	215228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004851	CA	3	6	215869	215874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_004851	TC	3	6	218192	218197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004851	TA	3	6	218274	218279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004851	AT	3	6	218586	218591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004851	TA	3	6	218646	218651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004851	GA	3	6	220022	220027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.