MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 1067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004851	TGT	2	6	99061	99066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004851	TGC	2	6	99103	99108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004851	GCT	2	6	99205	99210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_004851	TG	3	6	99294	99299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_004851	GAT	2	6	99329	99334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004851	GCA	2	6	99436	99441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_004851	TGA	2	6	100243	100248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004851	CAG	2	6	100280	100285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_004851	G	6	6	100290	100295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004851	CCTGA	2	10	101603	101612	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
511	NC_004851	CCA	2	6	101637	101642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_004851	C	6	6	101658	101663	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
513	NC_004851	GAC	2	6	101672	101677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_004851	CTGG	2	8	101701	101708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_004851	TTG	2	6	102801	102806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004851	C	6	6	102883	102888	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
517	NC_004851	GAG	2	6	102945	102950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004851	ATAA	2	8	102958	102965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004851	CAT	2	6	103005	103010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004851	GGA	2	6	103140	103145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004851	CTG	2	6	103155	103160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_004851	CT	3	6	103227	103232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_004851	TATCTT	2	12	103343	103354	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
524	NC_004851	TGG	2	6	103357	103362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004851	AGA	2	6	103397	103402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004851	GCAG	2	8	103406	103413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
527	NC_004851	AT	3	6	103516	103521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004851	ACA	2	6	103545	103550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_004851	TGAA	2	8	103554	103561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004851	AGC	2	6	103590	103595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_004851	TAAG	2	8	103649	103656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004851	TGG	2	6	103659	103664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004851	CTAT	2	8	103677	103684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_004851	TCGG	2	8	103694	103701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_004851	A	6	6	103746	103751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004851	GGT	2	6	103766	103771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004851	TGCTGA	2	12	103871	103882	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_004851	TAA	2	6	103897	103902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004851	GTT	2	6	103921	103926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004851	GACG	2	8	103932	103939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
541	NC_004851	TGA	2	6	103940	103945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004851	GTTC	2	8	103979	103986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_004851	TAG	2	6	104018	104023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004851	TGC	2	6	104048	104053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_004851	TCG	2	6	104060	104065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_004851	T	6	6	104853	104858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004851	TGGGG	2	10	104883	104892	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004851	G	6	6	104889	104894	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004851	TG	3	6	104947	104952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004851	TG	3	6	105003	105008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004851	GAT	2	6	105079	105084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004851	TTTTA	2	10	105087	105096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004851	TTTAT	2	10	105122	105131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004851	AAAT	2	8	105237	105244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004851	TAA	2	6	105252	105257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004851	TTATAA	2	12	105285	105296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004851	AAT	2	6	105297	105302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004851	AT	3	6	105369	105374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004851	T	6	6	105384	105389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004851	TGG	2	6	105414	105419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004851	T	6	6	105421	105426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004851	A	8	8	105441	105448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004851	AGT	2	6	105452	105457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004851	CAT	2	6	105556	105561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_004851	CAG	2	6	105638	105643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_004851	TAT	2	6	105753	105758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004851	TGTA	2	8	106785	106792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004851	TGA	2	6	106798	106803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004851	AAT	2	6	106876	106881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004851	A	6	6	106919	106924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004851	AT	3	6	110111	110116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004851	TAT	3	9	110114	110122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004851	CTTTA	2	10	113483	113492	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
574	NC_004851	TTA	2	6	116052	116057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004851	TA	3	6	116102	116107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004851	AT	3	6	116108	116113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004851	TAA	2	6	116119	116124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004851	ATA	2	6	116174	116179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004851	TCA	2	6	116210	116215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_004851	AG	3	6	116271	116276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_004851	T	6	6	116297	116302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_004851	CAAT	2	8	116327	116334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_004851	AATT	2	8	130558	130565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004851	CA	3	6	130570	130575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_004851	A	10	10	130586	130595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004851	AATA	2	8	131840	131847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004851	AAAT	2	8	131901	131908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_004851	TAA	2	6	135464	135469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004851	CAT	2	6	135509	135514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_004851	ATA	2	6	135570	135575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_004851	A	6	6	135658	135663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004851	TGA	2	6	135668	135673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004851	TCAT	2	8	135681	135688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_004851	TTG	2	6	135717	135722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004851	ATA	2	6	135790	135795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004851	CTT	2	6	135830	135835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_004851	TTA	2	6	135836	135841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004851	AG	3	6	135852	135857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004851	TA	3	6	135888	135893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004851	TAT	2	6	135954	135959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004851	CTTT	2	8	135987	135994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_004851	AGT	2	6	135998	136003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004851	GTTT	2	8	136110	136117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004851	CAA	2	6	136168	136173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004851	AAG	2	6	136199	136204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_004851	TTG	2	6	136998	137003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004851	AGGA	2	8	137351	137358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004851	GCT	2	6	138340	138345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004851	CTG	2	6	138377	138382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_004851	GCC	2	6	138386	138391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_004851	TCT	2	6	138417	138422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004851	CGT	2	6	138443	138448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004851	ACG	2	6	138632	138637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_004851	GAG	2	6	138646	138651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004851	GGA	2	6	138671	138676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004851	A	7	7	138701	138707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_004851	CGGC	2	8	138708	138715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_004851	GGA	2	6	138717	138722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004851	GC	3	6	138728	138733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_004851	GAA	2	6	138751	138756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004851	GCC	2	6	138757	138762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_004851	T	6	6	138907	138912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004851	GT	3	6	138949	138954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004851	GA	3	6	138956	138961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004851	GGAT	2	8	138989	138996	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004851	TG	3	6	139076	139081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004851	CCG	2	6	139098	139103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_004851	GAA	2	6	139134	139139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004851	CG	3	6	139143	139148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_004851	CTG	2	6	139159	139164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_004851	A	6	6	139219	139224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004851	AG	4	8	139256	139263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004851	GGA	2	6	139609	139614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004851	CTGC	2	8	139627	139634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
635	NC_004851	CTGA	2	8	139869	139876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_004851	CTA	2	6	139901	139906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_004851	AAC	2	6	140404	140409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_004851	CGG	2	6	140462	140467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_004851	CTT	2	6	140473	140478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_004851	GCA	2	6	140480	140485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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