MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004741	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004741	ATTTA	2	10	28146	28155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004741	AATCA	2	10	42072	42081	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_004741	TAGTG	2	10	72942	72951	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004741	ATTTT	2	10	74658	74667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004741	AATGC	2	10	114724	114733	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004741	AGGCG	2	10	127488	127497	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004741	GGTTG	2	10	128241	128250	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004741	GCGAT	2	10	132082	132091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004741	GGCAT	2	10	139578	139587	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004741	GTAAG	2	10	140342	140351	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004741	TCCTC	2	10	142062	142071	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_004741	ACCGC	2	10	147260	147269	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_004741	GCGGT	2	10	147279	147288	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004741	TTATC	2	10	158687	158696	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_004741	TACGT	2	10	173563	173572	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_004741	AAATA	2	10	183179	183188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004741	GTCTG	2	10	183264	183273	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_004741	TGCGC	2	10	206448	206457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_004741	CGGTT	2	10	213907	213916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_004741	GAAAA	2	10	239695	239704	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004741	ATTTT	2	10	276733	276742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004741	GGGAA	2	10	277475	277484	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004741	AGCCC	2	10	290101	290110	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_004741	GATGC	2	10	294896	294905	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_004741	CCTTT	2	10	297561	297570	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_004741	TTATT	2	10	317551	317560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004741	ACCAG	2	10	319619	319628	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_004741	GTTTC	2	10	360760	360769	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004741	CTTTT	2	10	364235	364244	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004741	GGAGT	2	10	366807	366816	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004741	GTGAT	2	10	378125	378134	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004741	GCCCG	2	10	383754	383763	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_004741	GTTTT	2	10	389745	389754	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004741	GAAGA	2	10	396326	396335	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004741	GCGTC	2	10	400619	400628	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_004741	GTCGT	2	10	400849	400858	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004741	TGAGT	2	10	410079	410088	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004741	CAGGT	2	10	412804	412813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_004741	TTAAG	2	10	420737	420746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004741	TCAGG	2	10	441101	441110	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004741	CAGGC	2	10	455719	455728	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_004741	GCTGG	2	10	457779	457788	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004741	TATTT	2	10	458377	458386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004741	TCGCC	2	10	468654	468663	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_004741	GTTTC	2	10	476114	476123	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_004741	GCGCG	2	10	482731	482740	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_004741	CACGC	2	10	485236	485245	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_004741	ACGCG	3	15	485462	485476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_004741	CGGCG	2	10	486131	486140	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_004741	TAATG	2	10	494071	494080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004741	GTCAG	2	10	507470	507479	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004741	GTCAG	2	10	507973	507982	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_004741	GCAGT	2	10	511198	511207	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004741	TAATC	2	10	517683	517692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004741	CATTC	2	10	525314	525323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_004741	GTTAA	2	10	529015	529024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004741	CATCC	2	10	534107	534116	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_004741	TGGGT	2	10	534350	534359	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004741	GAAAT	2	10	538662	538671	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004741	ATGCC	2	10	548194	548203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_004741	TGAAG	2	10	554842	554851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004741	CACGA	2	10	572903	572912	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_004741	ATTAT	2	10	582451	582460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004741	AAAAT	2	10	600035	600044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004741	GATGG	2	10	604585	604594	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004741	AATTT	2	10	604878	604887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004741	CGCCT	2	10	605071	605080	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_004741	GCGCA	2	10	608801	608810	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_004741	ATCTA	2	10	614873	614882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004741	AACAT	2	10	619768	619777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_004741	AATTA	2	10	620562	620571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004741	GCCGC	2	10	625180	625189	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_004741	CCCTG	2	10	625991	626000	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_004741	GTACC	2	10	626907	626916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_004741	GCCAG	2	10	627590	627599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_004741	CCGGC	2	10	628432	628441	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_004741	GCTTT	2	10	629098	629107	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004741	GTTCC	2	10	629642	629651	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_004741	CGCGA	2	10	639719	639728	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_004741	AAGCG	2	10	640083	640092	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_004741	TCGCA	2	10	644123	644132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_004741	AGCCC	2	10	648137	648146	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_004741	GGTGC	2	10	658816	658825	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004741	ACGCC	2	10	663896	663905	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_004741	ATATA	2	10	670151	670160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004741	TTGCT	2	10	671772	671781	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004741	GCTAT	2	10	671877	671886	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004741	TTACG	2	10	684074	684083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_004741	CGTTC	2	10	685281	685290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_004741	ATTGA	2	10	686471	686480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004741	CAAAT	2	10	688776	688785	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_004741	GGTTT	2	10	693459	693468	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004741	TATTG	2	10	706975	706984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004741	GAAGT	2	10	707410	707419	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004741	TGGGC	2	10	708236	708245	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_004741	AAATC	2	10	711725	711734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_004741	ACATA	2	10	775093	775102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_004741	CGCCC	2	10	779260	779269	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_004741	TGCGC	2	10	779803	779812	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_004741	GATGC	2	10	781797	781806	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004741	GAAAA	2	10	784600	784609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004741	CAAAA	2	10	788539	788548	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004741	TATAT	2	10	793271	793280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004741	TGATG	2	10	799353	799362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004741	ATTTT	2	10	813317	813326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004741	CAGGG	2	10	818366	818375	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_004741	ACCGC	2	10	823313	823322	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_004741	AGTAA	2	10	831485	831494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004741	AGCGC	2	10	841335	841344	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_004741	TAAAT	2	10	846533	846542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004741	GGATT	2	10	859003	859012	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004741	GCCCA	2	10	897031	897040	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_004741	AAAAT	2	10	900315	900324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004741	GGGAT	2	10	900677	900686	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004741	CTTCT	2	10	901096	901105	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_004741	ACCGC	2	10	902102	902111	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_004741	AACAA	2	10	904353	904362	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_004741	GATGC	2	10	923481	923490	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_004741	AAAAT	2	10	924984	924993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004741	GTAAC	2	10	925838	925847	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_004741	AGATG	2	10	932009	932018	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004741	ATTTT	2	10	941240	941249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004741	GCGTG	2	10	943483	943492	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004741	GCAAC	2	10	943935	943944	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_004741	AGCAA	2	10	952251	952260	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_004741	TTAAG	2	10	952943	952952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004741	AGTGG	2	10	952961	952970	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004741	GATGC	2	10	982543	982552	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_004741	AGGGC	2	10	983637	983646	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004741	ATGCC	2	10	983735	983744	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_004741	AGCGA	2	10	996913	996922	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004741	ATGAC	2	10	998653	998662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004741	TATTT	2	10	998716	998725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004741	TTTTC	2	10	1006691	1006700	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_004741	TTCTT	2	10	1009433	1009442	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004741	TTATG	2	10	1012131	1012140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004741	CTTAT	2	10	1023482	1023491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_004741	GCATC	2	10	1032431	1032440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_004741	ACCAT	2	10	1035550	1035559	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_004741	TTCAG	2	10	1035754	1035763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_004741	AATGT	2	10	1037675	1037684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004741	TAAAA	2	10	1042334	1042343	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004741	GGCGG	2	10	1080659	1080668	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
145	NC_004741	TGACT	2	10	1084824	1084833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_004741	GATCG	2	10	1089452	1089461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004741	ACCAC	2	10	1101923	1101932	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_004741	CATTA	2	10	1101958	1101967	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_004741	GTTTC	2	10	1106080	1106089	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_004741	GTCAT	2	10	1111324	1111333	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_004741	GCGAT	2	10	1118347	1118356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_004741	CGTTG	2	10	1124674	1124683	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_004741	AGGCG	2	10	1124796	1124805	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_004741	GATCA	2	10	1129474	1129483	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_004741	ACCAG	2	10	1150648	1150657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_004741	GATGC	2	10	1156385	1156394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_004741	GGGGA	2	10	1194589	1194598	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_004741	CTGGT	2	10	1207512	1207521	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_004741	GTTTT	2	10	1212431	1212440	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_004741	GCATC	2	10	1228682	1228691	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_004741	TGAAA	2	10	1253211	1253220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_004741	TATCT	2	10	1266216	1266225	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_004741	TTATC	2	10	1273383	1273392	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_004741	CAAAT	2	10	1293705	1293714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_004741	ATTGA	2	10	1294939	1294948	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_004741	GAAAC	2	10	1329486	1329495	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_004741	TTTGC	2	10	1329832	1329841	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_004741	TGCGC	2	10	1360835	1360844	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_004741	TGGCC	2	10	1378790	1378799	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_004741	AGTAC	2	10	1385602	1385611	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
193	NC_004741	GTCAG	2	10	1387003	1387012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_004741	TTTTA	2	10	1405993	1406002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_004741	CATTG	2	10	1415098	1415107	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_004741	GGATG	2	10	1626357	1626366	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_004741	CCTGA	2	10	1676722	1676731	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_004741	CCAAA	2	10	1676861	1676870	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
265	NC_004741	AAGCA	2	10	1683998	1684007	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_004741	TGGCT	2	10	1740094	1740103	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_004741	TGGCT	2	10	1741292	1741301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_004741	AAGCG	2	10	1797609	1797618	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_004741	AGCGA	2	10	1799799	1799808	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_004741	CTGGC	2	10	1831873	1831882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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300	NC_004741	CTGCG	2	10	1863938	1863947	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
301	NC_004741	GCTAT	2	10	1879516	1879525	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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303	NC_004741	TACGG	2	10	1885645	1885654	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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