MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 21274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004741	TGCGC	2	10	206448	206457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
502	NC_004741	CGC	2	6	206528	206533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_004741	GGCT	2	8	206554	206561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
504	NC_004741	A	6	6	207406	207411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_004741	A	7	7	209213	209219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004741	CTT	2	6	211322	211327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_004741	ATT	2	6	211330	211335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004741	TGT	2	6	211338	211343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004741	ATT	2	6	213032	213037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004741	TAT	2	6	213038	213043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004741	ATCA	2	8	213130	213137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_004741	TTA	2	6	213197	213202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004741	CGG	2	6	213876	213881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_004741	CA	3	6	213895	213900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_004741	CGGTT	2	10	213907	213916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
516	NC_004741	A	6	6	213923	213928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004741	TG	3	6	214039	214044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004741	GGC	2	6	214193	214198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_004741	ACT	2	6	214306	214311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004741	TAG	2	6	214403	214408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004741	CGA	2	6	214431	214436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_004741	GCA	2	6	214505	214510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_004741	GAA	2	6	214564	214569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004741	GGA	2	6	214600	214605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004741	AGA	2	6	214647	214652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004741	CAG	2	6	214673	214678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_004741	G	6	6	214820	214825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004741	GGA	2	6	214864	214869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004741	GGC	2	6	214884	214889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_004741	GAA	2	6	215127	215132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_004741	TGC	2	6	215203	215208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_004741	GTC	2	6	215215	215220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_004741	TTG	2	6	215276	215281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004741	CCGG	2	8	215290	215297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_004741	GGA	2	6	215328	215333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004741	TCA	2	6	215353	215358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_004741	AC	3	6	215379	215384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_004741	CGT	2	6	215447	215452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_004741	AC	3	6	215548	215553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_004741	GTAG	2	8	215589	215596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004741	CCT	2	6	215689	215694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_004741	AAG	2	6	215702	215707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004741	CA	3	6	215724	215729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_004741	TGA	2	6	215737	215742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004741	GGT	2	6	215779	215784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004741	GGT	2	6	215814	215819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004741	AGG	2	6	215924	215929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004741	CCA	2	6	215954	215959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_004741	TAAA	2	8	215973	215980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004741	A	6	6	215978	215983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004741	AAC	2	6	216065	216070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_004741	GTT	2	6	216075	216080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004741	TC	3	6	216087	216092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_004741	GAT	2	6	216108	216113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004741	GAAA	2	8	216119	216126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004741	GCG	2	6	216387	216392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_004741	AGC	2	6	216404	216409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_004741	GT	5	10	216425	216434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004741	G	6	6	216548	216553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004741	TCC	2	6	216558	216563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_004741	CTGA	2	8	216578	216585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_004741	GTAC	2	8	216662	216669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_004741	GGA	2	6	216867	216872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004741	AC	3	6	217085	217090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_004741	CGTC	2	8	217103	217110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_004741	AAC	2	6	217122	217127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_004741	AGC	2	6	217212	217217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_004741	CAT	2	6	217218	217223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_004741	AAAG	2	8	217226	217233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004741	GTT	2	6	217321	217326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004741	G	6	6	217563	217568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004741	TGA	2	6	217662	217667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004741	CAA	2	6	217689	217694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_004741	GGT	2	6	217761	217766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004741	GA	3	6	217791	217796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004741	GCTG	2	8	217905	217912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
577	NC_004741	TTA	2	6	217920	217925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004741	CGG	2	6	218044	218049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_004741	ATG	2	6	218120	218125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004741	ACC	2	6	218315	218320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_004741	TGG	2	6	218375	218380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_004741	TCC	2	6	218401	218406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_004741	GGA	2	6	218418	218423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004741	AGG	2	6	218456	218461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_004741	GGT	2	6	218538	218543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004741	CGG	2	6	218625	218630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_004741	TCA	2	6	218653	218658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004741	CGT	2	6	218733	218738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_004741	G	6	6	218782	218787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004741	GAC	3	9	218964	218972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_004741	GT	3	6	218986	218991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004741	GA	3	6	219074	219079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004741	GGC	2	6	219145	219150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_004741	GGT	2	6	219159	219164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004741	GGT	2	6	219290	219295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004741	CCTG	2	8	219339	219346	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
597	NC_004741	CCGT	2	8	219374	219381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_004741	TTA	2	6	219390	219395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004741	T	7	7	219421	219427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004741	TAT	2	6	219441	219446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004741	CT	3	6	220357	220362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_004741	CTC	2	6	220368	220373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_004741	A	7	7	221722	221728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004741	ATTT	2	8	222740	222747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_004741	AAT	2	6	222797	222802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_004741	ACA	2	6	223803	223808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_004741	ACA	2	6	223825	223830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_004741	CCA	2	6	223836	223841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_004741	A	6	6	224595	224600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004741	TAT	2	6	224626	224631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_004741	GAC	2	6	226011	226016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004741	GCA	2	6	228873	228878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004741	CCTG	2	8	228989	228996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_004741	CCGT	2	8	229024	229031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
615	NC_004741	TCG	2	6	229076	229081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_004741	A	6	6	229131	229136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_004741	CAGC	2	8	230448	230455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
618	NC_004741	TGA	2	6	230458	230463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004741	TC	4	8	232672	232679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_004741	CTTC	2	8	233185	233192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_004741	CAG	2	6	233223	233228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_004741	TC	3	6	233285	233290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_004741	GGA	2	6	234433	234438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004741	TGC	3	9	234485	234493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004741	ATCCAG	2	12	234502	234513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_004741	GAT	2	6	234581	234586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004741	ACCC	2	8	236261	236268	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
628	NC_004741	CTT	2	6	236292	236297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_004741	TCT	2	6	236347	236352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_004741	GTT	2	6	236370	236375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_004741	TCT	2	6	236462	236467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_004741	ACG	2	6	236519	236524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_004741	TTC	2	6	236565	236570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_004741	AAC	2	6	236636	236641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_004741	TTG	2	6	237840	237845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004741	TGA	2	6	237889	237894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_004741	CAC	2	6	237993	237998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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