MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004631	AGC	2	6	1106174	1106179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_004631	AAT	3	9	1106204	1106212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_004631	ATT	2	6	1106268	1106273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_004631	T	7	7	1106286	1106292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_004631	CATTT	2	10	1106316	1106325	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4006	NC_004631	ATA	2	6	1106354	1106359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_004631	TA	3	6	1106358	1106363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_004631	TTAA	2	8	1106372	1106379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_004631	TGGCG	2	10	1106417	1106426	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4010	NC_004631	AGCC	2	8	1106476	1106483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_004631	AAC	2	6	1106505	1106510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_004631	ATAA	2	8	1106517	1106524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_004631	TG	3	6	1106543	1106548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_004631	GCA	2	6	1106551	1106556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_004631	TTGAA	2	10	1106558	1106567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004631	A	8	8	1106638	1106645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_004631	AGA	2	6	1106659	1106664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_004631	AAAAT	2	10	1106680	1106689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_004631	T	6	6	1106734	1106739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_004631	TAACA	2	10	1106804	1106813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4021	NC_004631	AAC	2	6	1106869	1106874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_004631	CGA	2	6	1106934	1106939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_004631	CAA	2	6	1106966	1106971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_004631	TGC	2	6	1107057	1107062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_004631	TAA	3	9	1107157	1107165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_004631	TGT	2	6	1107173	1107178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_004631	TCA	2	6	1107186	1107191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_004631	A	6	6	1107268	1107273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_004631	GTC	2	6	1107314	1107319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_004631	TGC	2	6	1107328	1107333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_004631	CAG	2	6	1107374	1107379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_004631	CGC	2	6	1107426	1107431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_004631	TAA	2	6	1107436	1107441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_004631	CAA	2	6	1107461	1107466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_004631	CCT	2	6	1107513	1107518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_004631	TA	3	6	1107579	1107584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_004631	CGT	2	6	1107615	1107620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_004631	ATTT	2	8	1107624	1107631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_004631	TTA	2	6	1107676	1107681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_004631	T	7	7	1107709	1107715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_004631	GTT	2	6	1107728	1107733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_004631	GAT	2	6	1107756	1107761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_004631	CAGT	2	8	1108043	1108050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_004631	GAT	2	6	1108064	1108069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_004631	TGA	2	6	1108091	1108096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_004631	ACA	2	6	1108109	1108114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_004631	TATC	2	8	1108160	1108167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_004631	ACT	2	6	1109070	1109075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_004631	G	6	6	1109106	1109111	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_004631	GAA	2	6	1109124	1109129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_004631	T	7	7	1109502	1109508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_004631	A	7	7	1110973	1110979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_004631	GC	3	6	1110983	1110988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_004631	T	6	6	1114883	1114888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_004631	AAT	2	6	1114943	1114948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_004631	AAT	2	6	1114970	1114975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_004631	TA	3	6	1115043	1115048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_004631	CTG	2	6	1115603	1115608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_004631	TTG	2	6	1115610	1115615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_004631	AGGCC	2	10	1116336	1116345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4061	NC_004631	A	6	6	1118413	1118418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_004631	T	8	8	1118428	1118435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_004631	GTC	2	6	1118449	1118454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_004631	T	7	7	1119515	1119521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_004631	CAC	2	6	1119559	1119564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_004631	CGC	2	6	1119565	1119570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_004631	CGC	3	9	1119586	1119594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_004631	AGC	2	6	1119596	1119601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_004631	GCG	2	6	1119653	1119658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_004631	CGCGG	2	10	1119722	1119731	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4071	NC_004631	ATT	2	6	1119748	1119753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_004631	ATC	2	6	1119791	1119796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_004631	ATA	2	6	1119803	1119808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_004631	AAC	2	6	1119848	1119853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_004631	GCG	2	6	1119927	1119932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_004631	GC	3	6	1120044	1120049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_004631	A	6	6	1120083	1120088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_004631	AAAG	2	8	1120130	1120137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_004631	GGC	2	6	1120140	1120145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_004631	GAA	2	6	1120150	1120155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_004631	CGACCA	2	12	1120161	1120172	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_004631	AGC	2	6	1120178	1120183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_004631	CAG	2	6	1120240	1120245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_004631	CATT	2	8	1120260	1120267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_004631	GAT	2	6	1120348	1120353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_004631	ATG	2	6	1120389	1120394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_004631	CGC	2	6	1120408	1120413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_004631	TCG	2	6	1120419	1120424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_004631	CGG	2	6	1120431	1120436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_004631	CGA	2	6	1120446	1120451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_004631	GCGCC	2	10	1120533	1120542	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4092	NC_004631	GC	3	6	1120561	1120566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_004631	GC	3	6	1120596	1120601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_004631	ATG	2	6	1120608	1120613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_004631	A	6	6	1120673	1120678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_004631	AGT	2	6	1120688	1120693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_004631	GAC	2	6	1120696	1120701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_004631	ATA	2	6	1120826	1120831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_004631	T	6	6	1120883	1120888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_004631	TAA	2	6	1120903	1120908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_004631	AAT	3	9	1120925	1120933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_004631	GTT	2	6	1120951	1120956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_004631	TAA	2	6	1121018	1121023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_004631	TTA	2	6	1121866	1121871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_004631	A	8	8	1121882	1121889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_004631	GCT	2	6	1121908	1121913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_004631	T	7	7	1121913	1121919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_004631	ATA	2	6	1121953	1121958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_004631	TTA	2	6	1121979	1121984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_004631	ATT	2	6	1121989	1121994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_004631	AAC	2	6	1122009	1122014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_004631	ATT	2	6	1122030	1122035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_004631	ATT	2	6	1122056	1122061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_004631	T	6	6	1122320	1122325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_004631	ATTG	2	8	1122350	1122357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_004631	TTCC	2	8	1122625	1122632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_004631	GGT	2	6	1122668	1122673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_004631	TC	3	6	1123019	1123024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_004631	TAC	2	6	1123046	1123051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_004631	AT	3	6	1123071	1123076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_004631	TC	4	8	1123168	1123175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_004631	TTGT	2	8	1123190	1123197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_004631	ATT	2	6	1123200	1123205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_004631	CTTTT	2	10	1123259	1123268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4125	NC_004631	TAT	2	6	1123270	1123275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004631	T	6	6	1123291	1123296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_004631	GAA	2	6	1123377	1123382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_004631	ATT	2	6	1123388	1123393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_004631	CAG	2	6	1123419	1123424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_004631	AT	3	6	1123457	1123462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_004631	TTG	2	6	1123474	1123479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_004631	TTG	2	6	1124098	1124103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_004631	TTA	2	6	1124117	1124122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_004631	T	6	6	1124129	1124134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_004631	ATCA	2	8	1124162	1124169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_004631	CAG	2	6	1127464	1127469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4140	NC_004631	TCA	2	6	1127680	1127685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_004631	TAT	2	6	1127739	1127744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4145	NC_004631	ACA	2	6	1128299	1128304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_004631	CGG	2	6	1130019	1130024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4148	NC_004631	TTA	2	6	1131006	1131011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4150	NC_004631	ATT	2	6	1131112	1131117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_004631	A	7	7	1131128	1131134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_004631	TG	3	6	1131140	1131145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_004631	AAGG	2	8	1131220	1131227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_004631	GCC	2	6	1139026	1139031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4166	NC_004631	ACT	2	6	1141771	1141776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4170	NC_004631	TAAT	2	8	1142524	1142531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4171	NC_004631	TGA	2	6	1142587	1142592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4174	NC_004631	T	8	8	1144348	1144355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4175	NC_004631	AAAT	2	8	1145538	1145545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4176	NC_004631	AAT	2	6	1145558	1145563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4244	NC_004631	CGCC	2	8	1163368	1163375	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4251	NC_004631	GGGCG	2	10	1163604	1163613	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4252	NC_004631	TCC	2	6	1163652	1163657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4256	NC_004631	AAAG	2	8	1163804	1163811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_004631	GTA	2	6	1163831	1163836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_004631	CAA	2	6	1164154	1164159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_004631	CAT	2	6	1164286	1164291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_004631	CGG	2	6	1164317	1164322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_004631	GTA	2	6	1164421	1164426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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