MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004631	CTGG	2	8	990689	990696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_004631	AGCGT	2	10	990703	990712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3503	NC_004631	GGC	2	6	990807	990812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_004631	GCA	3	9	990866	990874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_004631	TAT	2	6	990929	990934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_004631	TGG	2	6	990946	990951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_004631	GTC	2	6	991303	991308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_004631	TGC	2	6	991320	991325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_004631	TGA	2	6	991359	991364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_004631	CGG	2	6	993943	993948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_004631	AAG	2	6	993984	993989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_004631	GCA	2	6	994026	994031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_004631	GC	3	6	994066	994071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_004631	TCAT	2	8	994076	994083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_004631	A	6	6	994086	994091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_004631	A	7	7	994108	994114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_004631	CTT	2	6	994170	994175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_004631	T	7	7	994213	994219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_004631	AGG	2	6	994573	994578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_004631	CTCA	2	8	995450	995457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_004631	ATC	2	6	995593	995598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_004631	TAAAG	2	10	995600	995609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_004631	AT	3	6	995658	995663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_004631	T	6	6	995675	995680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_004631	ATTT	2	8	995684	995691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004631	TCG	2	6	1001582	1001587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_004631	CCT	2	6	1001589	1001594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_004631	T	6	6	1006372	1006377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_004631	ACTC	2	8	1006393	1006400	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_004631	ATT	2	6	1006434	1006439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_004631	T	6	6	1006477	1006482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_004631	CTG	2	6	1006526	1006531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_004631	A	6	6	1006535	1006540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_004631	ACA	2	6	1006883	1006888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_004631	GACGC	2	10	1006934	1006943	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3536	NC_004631	GC	3	6	1006986	1006991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_004631	CTG	2	6	1007357	1007362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_004631	ATAA	2	8	1007366	1007373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_004631	ATC	2	6	1007374	1007379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_004631	ATA	2	6	1007443	1007448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_004631	ATT	2	6	1007449	1007454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_004631	T	6	6	1007481	1007486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_004631	TA	3	6	1007520	1007525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_004631	GAC	2	6	1007550	1007555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_004631	CCG	2	6	1007614	1007619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_004631	AAG	2	6	1009112	1009117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_004631	TAC	2	6	1009124	1009129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_004631	TAA	2	6	1009155	1009160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_004631	GGC	2	6	1009208	1009213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_004631	TTC	2	6	1009235	1009240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_004631	TCT	2	6	1009243	1009248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_004631	TTC	2	6	1009249	1009254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_004631	TCT	2	6	1009257	1009262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_004631	TTC	2	6	1009263	1009268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_004631	TCT	2	6	1009271	1009276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_004631	TTC	2	6	1009277	1009282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_004631	TCT	2	6	1009285	1009290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_004631	TTC	2	6	1009291	1009296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_004631	TCT	2	6	1009299	1009304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_004631	TTC	2	6	1009305	1009310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_004631	ATGA	2	8	1009320	1009327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_004631	GCC	2	6	1009763	1009768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_004631	GAA	2	6	1011307	1011312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_004631	CTT	2	6	1013532	1013537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_004631	AGT	2	6	1013555	1013560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_004631	AAT	2	6	1013612	1013617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_004631	AAT	2	6	1013624	1013629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_004631	CGC	2	6	1013650	1013655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_004631	GATT	2	8	1015313	1015320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_004631	T	6	6	1015361	1015366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_004631	GAAA	2	8	1015387	1015394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_004631	TTG	2	6	1015459	1015464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_004631	GAC	2	6	1015492	1015497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_004631	ACG	2	6	1015526	1015531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_004631	ATT	2	6	1015556	1015561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_004631	CTG	2	6	1015562	1015567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_004631	AAT	2	6	1015577	1015582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_004631	G	6	6	1015587	1015592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_004631	A	6	6	1015814	1015819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_004631	CAG	2	6	1015828	1015833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_004631	GCA	2	6	1015863	1015868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_004631	CAG	2	6	1015914	1015919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_004631	TGA	2	6	1015983	1015988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_004631	TGA	2	6	1016066	1016071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_004631	TGCAGA	2	12	1016111	1016122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3586	NC_004631	CGCT	2	8	1016131	1016138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_004631	TCT	2	6	1016184	1016189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_004631	CGG	2	6	1016201	1016206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_004631	GC	3	6	1016257	1016262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_004631	AGC	2	6	1016279	1016284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_004631	AGA	2	6	1016285	1016290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_004631	AAT	2	6	1016332	1016337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_004631	CG	3	6	1016368	1016373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_004631	TAT	2	6	1016379	1016384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_004631	TTA	2	6	1016402	1016407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_004631	CAGC	2	8	1016420	1016427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_004631	GCGG	2	8	1016438	1016445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_004631	CAGC	2	8	1016493	1016500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_004631	GGC	2	6	1016514	1016519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_004631	CGA	2	6	1016556	1016561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_004631	GAT	2	6	1016568	1016573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_004631	TCT	2	6	1016577	1016582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_004631	CTT	2	6	1016698	1016703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_004631	GCC	2	6	1019090	1019095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_004631	T	6	6	1019150	1019155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_004631	ATA	2	6	1019177	1019182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_004631	AC	3	6	1019189	1019194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_004631	AAT	2	6	1021691	1021696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_004631	ATT	2	6	1021716	1021721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_004631	TA	4	8	1021794	1021801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_004631	TCAT	2	8	1021827	1021834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_004631	AAT	2	6	1021835	1021840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_004631	TATCAA	2	12	1021844	1021855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3614	NC_004631	T	6	6	1022655	1022660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_004631	TTC	2	6	1023044	1023049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_004631	TTA	2	6	1023059	1023064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_004631	ATT	2	6	1023083	1023088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_004631	AGC	2	6	1023158	1023163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_004631	ACA	2	6	1023217	1023222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_004631	T	7	7	1023261	1023267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_004631	ACA	2	6	1025869	1025874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_004631	CGC	2	6	1026447	1026452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_004631	GTGA	2	8	1026471	1026478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_004631	GCA	2	6	1026534	1026539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_004631	GCTG	2	8	1026695	1026702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_004631	A	7	7	1026710	1026716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_004631	TGG	2	6	1026812	1026817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_004631	AAT	2	6	1026905	1026910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_004631	ACC	2	6	1026935	1026940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_004631	T	7	7	1026950	1026956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_004631	A	6	6	1027013	1027018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_004631	ACA	2	6	1027044	1027049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3752	NC_004631	AATA	2	8	1053743	1053750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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