MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004631	GGC	2	6	410607	410612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_004631	CGA	2	6	410614	410619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_004631	GTC	2	6	410763	410768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_004631	GC	4	8	410787	410794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_004631	GCG	2	6	410848	410853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_004631	CAAT	2	8	410914	410921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_004631	CGG	2	6	411068	411073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_004631	CGA	2	6	411101	411106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_004631	CAC	2	6	411152	411157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_004631	GTG	2	6	411213	411218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_004631	GGC	2	6	411225	411230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_004631	A	6	6	411257	411262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_004631	TACC	2	8	411284	411291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_004631	TGA	3	9	411347	411355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_004631	GAC	2	6	411384	411389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_004631	GGC	2	6	411390	411395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_004631	GAC	2	6	411420	411425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_004631	GGC	2	6	411426	411431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_004631	CAC	2	6	411439	411444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_004631	GC	3	6	411489	411494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_004631	CAGA	2	8	411507	411514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_004631	ACT	2	6	411632	411637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_004631	GGC	2	6	411652	411657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_004631	CAG	2	6	411774	411779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_004631	GCG	2	6	411845	411850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_004631	ACA	3	9	411884	411892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_004631	AG	3	6	411897	411902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004631	CGC	2	6	412010	412015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_004631	ACT	2	6	412037	412042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_004631	GAT	2	6	412201	412206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_004631	TGA	2	6	412221	412226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_004631	GCAG	2	8	412281	412288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_004631	GCA	2	6	412337	412342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_004631	CGGG	2	8	412405	412412	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_004631	CAG	2	6	413927	413932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_004631	A	7	7	413984	413990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_004631	TTA	2	6	414035	414040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_004631	TTC	2	6	415533	415538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_004631	ATTT	2	8	415560	415567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_004631	TTTA	2	8	417248	417255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004631	T	6	6	417492	417497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_004631	TGA	2	6	418290	418295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_004631	AAC	2	6	418311	418316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_004631	CCTG	2	8	418335	418342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_004631	TTAGGT	2	12	418348	418359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_004631	T	10	10	419472	419481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_004631	TCA	2	6	419486	419491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_004631	TAA	2	6	419508	419513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_004631	A	7	7	419545	419551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_004631	T	8	8	419580	419587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_004631	A	6	6	419593	419598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_004631	GAT	2	6	419609	419614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_004631	ATA	2	6	419696	419701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_004631	TTC	2	6	419972	419977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_004631	TAT	2	6	419983	419988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_004631	GAA	2	6	419995	420000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_004631	CAT	2	6	420259	420264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_004631	CTGT	2	8	420288	420295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_004631	G	6	6	420314	420319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_004631	CTG	2	6	420322	420327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_004631	CGC	2	6	422556	422561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_004631	GCG	2	6	422565	422570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_004631	AAGG	2	8	426307	426314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_004631	GCC	2	6	426343	426348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_004631	T	6	6	428077	428082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_004631	T	6	6	428169	428174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_004631	GCT	2	6	428190	428195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_004631	A	6	6	428215	428220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_004631	GGT	2	6	428252	428257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_004631	GTT	2	6	428300	428305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_004631	GTGA	2	8	428328	428335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_004631	AG	3	6	428403	428408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_004631	T	8	8	428431	428438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_004631	AATA	2	8	429103	429110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_004631	T	8	8	429137	429144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_004631	TAA	2	6	429157	429162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_004631	AC	3	6	429166	429171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_004631	TGC	2	6	430495	430500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_004631	CGC	2	6	431275	431280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_004631	CGG	2	6	431283	431288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_004631	TAA	2	6	431685	431690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_004631	TGT	2	6	433173	433178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_004631	CGT	2	6	433201	433206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_004631	TGA	2	6	433248	433253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_004631	T	6	6	433304	433309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_004631	CAT	2	6	434470	434475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_004631	GCC	2	6	434484	434489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_004631	TGA	2	6	434504	434509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_004631	T	8	8	434535	434542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_004631	GCC	2	6	434602	434607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_004631	TTC	2	6	434633	434638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_004631	TAA	2	6	434651	434656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_004631	CAT	2	6	434661	434666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_004631	T	6	6	434681	434686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_004631	GT	3	6	434717	434722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_004631	CG	3	6	434751	434756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_004631	ATT	2	6	434782	434787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_004631	GGA	2	6	435015	435020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_004631	CG	3	6	435025	435030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_004631	GGC	2	6	435051	435056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_004631	GGC	2	6	435177	435182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_004631	GTG	2	6	435214	435219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004631	ATT	2	6	435223	435228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_004631	ATT	2	6	435272	435277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_004631	CG	3	6	435288	435293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_004631	ATT	2	6	435334	435339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_004631	CAT	2	6	435419	435424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_004631	TTGG	2	8	435442	435449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_004631	T	6	6	435548	435553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_004631	GCT	2	6	435576	435581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_004631	TCGAA	2	10	435882	435891	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1612	NC_004631	TTG	2	6	435894	435899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004631	T	6	6	435925	435930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_004631	GC	3	6	435938	435943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_004631	AGG	2	6	435954	435959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_004631	A	8	8	439515	439522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_004631	ACA	2	6	439530	439535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_004631	GCTT	2	8	439554	439561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_004631	T	6	6	441573	441578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_004631	CAC	2	6	441637	441642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_004631	G	7	7	442448	442454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_004631	ATC	2	6	442470	442475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_004631	ATC	2	6	442531	442536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_004631	AG	3	6	442547	442552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_004631	AATA	2	8	447227	447234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_004631	ATA	2	6	447256	447261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_004631	TTAT	2	8	447279	447286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_004631	CAAT	2	8	447301	447308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_004631	TTG	2	6	447315	447320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_004631	GTGAAT	2	12	447322	447333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_004631	ATTG	2	8	447405	447412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_004631	T	6	6	447413	447418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_004631	AGT	2	6	447434	447439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_004631	CAA	2	6	447540	447545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_004631	ATA	3	9	447593	447601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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