MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004631	GTT	2	6	311972	311977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004631	A	6	6	312023	312028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004631	TGTAG	2	10	312088	312097	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004631	GCG	2	6	312101	312106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_004631	ATA	2	6	312174	312179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_004631	GTC	2	6	315006	315011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_004631	ATT	2	6	315030	315035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004631	CTT	2	6	315160	315165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_004631	TTG	2	6	315225	315230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004631	CATT	2	8	315234	315241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_004631	GGC	2	6	318711	318716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_004631	AT	3	6	318745	318750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004631	TTG	2	6	318783	318788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_004631	ACA	2	6	319088	319093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_004631	CGGG	2	8	319099	319106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_004631	A	6	6	320079	320084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004631	T	7	7	320109	320115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004631	ATA	2	6	321352	321357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_004631	CGA	2	6	323199	323204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_004631	CAT	2	6	323244	323249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_004631	TTA	2	6	323256	323261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004631	GT	3	6	324187	324192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_004631	TCT	2	6	326827	326832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_004631	TTC	2	6	326833	326838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_004631	GCG	2	6	326840	326845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_004631	TGA	2	6	326880	326885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_004631	GGAAGG	2	12	326903	326914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004631	CTC	2	6	326928	326933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_004631	TGC	2	6	328414	328419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_004631	TCG	2	6	328542	328547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_004631	GGC	2	6	328569	328574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_004631	C	6	6	328580	328585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1033	NC_004631	AGA	2	6	328604	328609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_004631	GA	3	6	328611	328616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_004631	T	6	6	332546	332551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_004631	CGC	2	6	332637	332642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_004631	ATTTT	2	10	332756	332765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004631	GAC	2	6	332790	332795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_004631	A	6	6	332805	332810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004631	CAGA	2	8	332811	332818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_004631	CTT	2	6	332927	332932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_004631	CAA	2	6	332978	332983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_004631	TGCC	2	8	332986	332993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_004631	ATA	2	6	333006	333011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004631	TGT	2	6	333093	333098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_004631	T	6	6	333125	333130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004631	TTC	2	6	333132	333137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_004631	TCC	2	6	337124	337129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_004631	ACC	2	6	337143	337148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_004631	TGC	2	6	338622	338627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_004631	A	6	6	338631	338636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_004631	CGCTA	2	10	340842	340851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1053	NC_004631	AT	3	6	342272	342277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004631	A	6	6	342362	342367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004631	GATT	2	8	342374	342381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004631	T	7	7	342380	342386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004631	T	6	6	342491	342496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_004631	TAA	3	9	344151	344159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_004631	T	6	6	344176	344181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_004631	T	6	6	344189	344194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004631	AAAG	2	8	344198	344205	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_004631	AGC	2	6	344214	344219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_004631	GGA	2	6	344239	344244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004631	T	6	6	344276	344281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004631	TAA	2	6	345514	345519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004631	TCT	2	6	345567	345572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_004631	AAC	2	6	345593	345598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_004631	GAA	2	6	345724	345729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_004631	TGTGT	2	10	347073	347082	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_004631	CGG	2	6	347157	347162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_004631	GGGA	2	8	347241	347248	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004631	GAG	2	6	349754	349759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004631	CTG	3	9	350487	350495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_004631	CAG	2	6	350577	350582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_004631	GC	3	6	350587	350592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_004631	GCGG	3	12	350621	350632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_004631	CTG	2	6	350643	350648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_004631	TATG	2	8	350654	350661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_004631	GTG	2	6	350696	350701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_004631	TGGC	2	8	350711	350718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_004631	CGC	3	9	350761	350769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_004631	TGG	3	9	350799	350807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_004631	CTGG	2	8	350860	350867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_004631	TGCTG	2	10	350907	350916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1086	NC_004631	CG	3	6	350936	350941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1089	NC_004631	GC	4	8	351058	351065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_004631	GGC	2	6	351181	351186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_004631	GCT	2	6	351217	351222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_004631	GGC	2	6	351282	351287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_004631	CGCTGG	2	12	351303	351314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_004631	GGGC	2	8	351376	351383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_004631	AAAT	2	8	354331	354338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_004631	TAA	2	6	354427	354432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004631	AT	3	6	354433	354438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004631	AT	3	6	354458	354463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004631	GGT	2	6	355433	355438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004631	CGG	2	6	355465	355470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_004631	CCG	2	6	355485	355490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_004631	TC	4	8	356305	356312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_004631	AGC	2	6	356350	356355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_004631	AAT	2	6	356395	356400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004631	GAA	2	6	356409	356414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004631	AAGCG	2	10	357217	357226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_004631	A	6	6	357352	357357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_004631	TAAG	2	8	357383	357390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004631	TCT	2	6	357906	357911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_004631	GGC	2	6	357912	357917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_004631	GTC	2	6	357938	357943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_004631	A	6	6	357959	357964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_004631	TGC	2	6	360079	360084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_004631	CTTA	2	8	360117	360124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_004631	GCG	2	6	360163	360168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_004631	AAG	2	6	360175	360180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004631	GTA	2	6	362967	362972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004631	ACG	2	6	363193	363198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_004631	TAA	2	6	363209	363214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004631	AAGCG	2	10	364532	364541	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_004631	GCC	2	6	365406	365411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_004631	CCT	2	6	365423	365428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_004631	TCTG	2	8	365483	365490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_004631	AAG	2	6	365516	365521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004631	GCA	2	6	365578	365583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_004631	ATA	2	6	365700	365705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_004631	TCG	2	6	365725	365730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_004631	CAA	2	6	365801	365806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_004631	CTG	2	6	365810	365815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_004631	A	7	7	365841	365847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004631	T	7	7	365864	365870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_004631	A	6	6	366644	366649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_004631	A	6	6	366734	366739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_004631	TGG	2	6	391397	391402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_004631	GTA	2	6	408168	408173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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