MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004631	TGC	2	6	1620224	1620229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_004631	GCG	2	6	1620285	1620290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_004631	CAG	2	6	1620352	1620357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_004631	TTC	2	6	1620405	1620410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_004631	CGG	3	9	1620414	1620422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_004631	ATA	2	6	1620509	1620514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_004631	A	8	8	1620592	1620599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_004631	CGT	2	6	1620619	1620624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_004631	A	6	6	1620653	1620658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_004631	AACGC	2	10	1620677	1620686	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6011	NC_004631	GA	4	8	1620714	1620721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_004631	T	6	6	1620774	1620779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_004631	TC	3	6	1621852	1621857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_004631	A	6	6	1621896	1621901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_004631	TAT	2	6	1621933	1621938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_004631	TTTTAT	2	12	1623126	1623137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_004631	ATC	2	6	1623229	1623234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_004631	CATC	2	8	1623258	1623265	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_004631	TTA	2	6	1623372	1623377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_004631	GA	3	6	1624314	1624319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_004631	CAA	2	6	1624888	1624893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_004631	TCA	2	6	1624927	1624932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_004631	ATT	2	6	1624946	1624951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_004631	TCT	2	6	1625812	1625817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_004631	TTCA	2	8	1625872	1625879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_004631	CAA	2	6	1627232	1627237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_004631	TCT	2	6	1627331	1627336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_004631	GAT	2	6	1627348	1627353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_004631	AGGA	2	8	1627412	1627419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_004631	AAT	2	6	1627429	1627434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_004631	GTT	2	6	1628525	1628530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_004631	CCTT	2	8	1628535	1628542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_004631	CA	3	6	1630278	1630283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_004631	GCG	2	6	1630335	1630340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_004631	A	6	6	1630934	1630939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_004631	ATA	2	6	1630954	1630959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_004631	GAT	2	6	1630961	1630966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_004631	CCTG	2	8	1633870	1633877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_004631	TTA	2	6	1634782	1634787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_004631	AAT	2	6	1634798	1634803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_004631	ATT	2	6	1634840	1634845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_004631	TCTT	2	8	1634961	1634968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_004631	AAC	2	6	1634986	1634991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_004631	C	6	6	1634991	1634996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6045	NC_004631	TAA	2	6	1635004	1635009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_004631	ATG	3	9	1635063	1635071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_004631	TCT	2	6	1635956	1635961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_004631	TAA	2	6	1635975	1635980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_004631	A	8	8	1636045	1636052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_004631	AAC	2	6	1637503	1637508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_004631	ACA	2	6	1637519	1637524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_004631	ATTCA	2	10	1637567	1637576	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6053	NC_004631	GATG	2	8	1637929	1637936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_004631	T	6	6	1637982	1637987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_004631	ACT	2	6	1638638	1638643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_004631	TGA	2	6	1638665	1638670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_004631	TCG	2	6	1640355	1640360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_004631	TAA	2	6	1640439	1640444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_004631	T	6	6	1640457	1640462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_004631	TGCT	2	8	1640482	1640489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_004631	AAT	2	6	1640606	1640611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_004631	T	6	6	1640613	1640618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_004631	TCTA	2	8	1641606	1641613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_004631	AG	3	6	1641629	1641634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_004631	GGC	2	6	1642622	1642627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_004631	ATT	2	6	1644316	1644321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_004631	CAG	2	6	1644327	1644332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_004631	CGG	2	6	1644409	1644414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_004631	ACA	2	6	1644422	1644427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_004631	GAT	2	6	1644432	1644437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_004631	AAT	2	6	1646199	1646204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_004631	CTG	2	6	1646769	1646774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_004631	AAG	2	6	1646817	1646822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_004631	CTT	2	6	1646839	1646844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_004631	T	8	8	1646843	1646850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_004631	TTA	2	6	1646910	1646915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_004631	CAA	2	6	1646968	1646973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_004631	AG	3	6	1647506	1647511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_004631	GGA	2	6	1647548	1647553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_004631	TATT	2	8	1647554	1647561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_004631	AAT	2	6	1649122	1649127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_004631	GAT	2	6	1649141	1649146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_004631	AGGA	2	8	1649166	1649173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_004631	CAA	2	6	1649180	1649185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_004631	GCG	2	6	1649217	1649222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_004631	GAAGA	2	10	1651728	1651737	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_004631	A	6	6	1651737	1651742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_004631	TAA	2	6	1651743	1651748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_004631	TTA	2	6	1651780	1651785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_004631	GA	3	6	1651797	1651802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_004631	CAA	2	6	1651804	1651809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_004631	CA	3	6	1652202	1652207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_004631	AT	3	6	1652480	1652485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_004631	TGA	2	6	1653095	1653100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_004631	GCC	2	6	1653119	1653124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_004631	ATT	2	6	1653131	1653136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_004631	TAT	2	6	1653880	1653885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_004631	ATT	2	6	1653899	1653904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_004631	GCCA	2	8	1653917	1653924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_004631	GTG	2	6	1653936	1653941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_004631	TCA	2	6	1653966	1653971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_004631	GAC	2	6	1654970	1654975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_004631	TAT	2	6	1655059	1655064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_004631	ATAA	2	8	1657889	1657896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_004631	CTG	2	6	1657904	1657909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_004631	GTC	2	6	1657972	1657977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_004631	CCA	2	6	1657980	1657985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_004631	TCCAG	2	10	1658010	1658019	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6109	NC_004631	CAAT	2	8	1658035	1658042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6110	NC_004631	CATGA	2	10	1658069	1658078	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6111	NC_004631	AAG	2	6	1658079	1658084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_004631	CGC	2	6	1658140	1658145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_004631	TTC	2	6	1658156	1658161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_004631	CAA	2	6	1658282	1658287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_004631	AGTG	2	8	1658295	1658302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_004631	CAAA	2	8	1658386	1658393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6117	NC_004631	CCAC	2	8	1658394	1658401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6118	NC_004631	TTG	2	6	1658451	1658456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_004631	AAC	2	6	1658462	1658467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_004631	CAA	2	6	1658592	1658597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_004631	CAA	2	6	1659074	1659079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_004631	ATAC	2	8	1659158	1659165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6123	NC_004631	CAT	2	6	1659180	1659185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6125	NC_004631	TCTGTA	2	12	1659276	1659287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6126	NC_004631	TAT	2	6	1659332	1659337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_004631	A	7	7	1659524	1659530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_004631	ATA	2	6	1659539	1659544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_004631	T	6	6	1659549	1659554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_004631	CT	3	6	1659561	1659566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_004631	ACC	2	6	1659588	1659593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_004631	AAAC	2	8	1659661	1659668	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_004631	TAA	2	6	1660127	1660132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_004631	ATGC	2	8	1660142	1660149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6153	NC_004631	GCAA	2	8	1661549	1661556	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6257	NC_004631	GAA	2	6	1689687	1689692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6397	NC_004631	CAT	2	6	1728375	1728380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_004631	TTCGA	2	10	1728468	1728477	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6399	NC_004631	GA	3	6	1728486	1728491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6435	NC_004631	A	7	7	1744110	1744116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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