MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004631	A	6	6	1203424	1203429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_004631	AAT	3	9	1204539	1204547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_004631	CT	3	6	1204563	1204568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_004631	AAC	2	6	1205139	1205144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_004631	ACAG	2	8	1205206	1205213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4506	NC_004631	CGG	2	6	1205245	1205250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_004631	TGT	2	6	1205265	1205270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_004631	GTG	2	6	1205652	1205657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_004631	CCT	2	6	1205689	1205694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_004631	AT	3	6	1205736	1205741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_004631	A	7	7	1205800	1205806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_004631	TCA	2	6	1205807	1205812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_004631	GGC	2	6	1205821	1205826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_004631	CTG	2	6	1205891	1205896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_004631	GGTTTA	2	12	1205931	1205942	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_004631	CTT	2	6	1205969	1205974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_004631	TAA	2	6	1205991	1205996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_004631	TTAA	2	8	1206071	1206078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_004631	AGTG	2	8	1206167	1206174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_004631	ATG	2	6	1206189	1206194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_004631	TTCTG	2	10	1206216	1206225	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4522	NC_004631	T	6	6	1206232	1206237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_004631	AGG	2	6	1206269	1206274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_004631	TGTCG	2	10	1211095	1211104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4525	NC_004631	CTC	2	6	1212454	1212459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_004631	TAA	2	6	1212461	1212466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_004631	TTC	2	6	1212812	1212817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_004631	A	6	6	1212903	1212908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_004631	AAAT	2	8	1212943	1212950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_004631	TATAA	2	10	1212958	1212967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_004631	ATC	2	6	1212970	1212975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_004631	AAGA	2	8	1212981	1212988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_004631	T	7	7	1213693	1213699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_004631	CAAT	2	8	1213723	1213730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4535	NC_004631	A	6	6	1213733	1213738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_004631	ACT	3	9	1214594	1214602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_004631	GAT	2	6	1214631	1214636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_004631	TTG	2	6	1214680	1214685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_004631	CAT	3	9	1215333	1215341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_004631	ATT	2	6	1216214	1216219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_004631	GAG	2	6	1216231	1216236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_004631	CCCT	2	8	1216242	1216249	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4543	NC_004631	CCAT	2	8	1216305	1216312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_004631	ACTC	2	8	1216410	1216417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_004631	GCC	2	6	1216422	1216427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_004631	ATT	2	6	1216442	1216447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_004631	TA	3	6	1216453	1216458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_004631	GA	3	6	1216755	1216760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_004631	TAA	2	6	1216955	1216960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_004631	TAA	2	6	1216977	1216982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_004631	AGG	2	6	1217011	1217016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_004631	GA	3	6	1217675	1217680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_004631	CGT	2	6	1218415	1218420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_004631	CGG	2	6	1218424	1218429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_004631	GTA	2	6	1219131	1219136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_004631	CG	3	6	1219178	1219183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_004631	TTTA	2	8	1219224	1219231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_004631	AGA	2	6	1219336	1219341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_004631	GATA	2	8	1220027	1220034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_004631	A	7	7	1220044	1220050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_004631	ATA	2	6	1220075	1220080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_004631	A	6	6	1220303	1220308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_004631	ATA	2	6	1220574	1220579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_004631	TAT	2	6	1220601	1220606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_004631	TTA	2	6	1220667	1220672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_004631	CAA	2	6	1220725	1220730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_004631	AG	3	6	1221263	1221268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_004631	GGA	2	6	1221305	1221310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_004631	TATT	2	8	1221311	1221318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_004631	ACC	2	6	1221331	1221336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_004631	GTT	2	6	1221390	1221395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_004631	GCG	2	6	1221419	1221424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_004631	A	6	6	1221436	1221441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_004631	ATA	2	6	1221453	1221458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_004631	GAC	2	6	1221475	1221480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_004631	GGTT	2	8	1221563	1221570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_004631	GCG	2	6	1222005	1222010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_004631	CCT	2	6	1222670	1222675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_004631	TCA	2	6	1222751	1222756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_004631	AGGCG	2	10	1223985	1223994	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4581	NC_004631	ACT	2	6	1225318	1225323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_004631	CGC	2	6	1225439	1225444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_004631	TTG	2	6	1225469	1225474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_004631	TGA	2	6	1225522	1225527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_004631	CGT	2	6	1225534	1225539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_004631	ATT	2	6	1225557	1225562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_004631	TCC	2	6	1226124	1226129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_004631	ATG	2	6	1226162	1226167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_004631	TGT	2	6	1226173	1226178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_004631	TGT	2	6	1226182	1226187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_004631	CAT	2	6	1226225	1226230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_004631	CGG	2	6	1226264	1226269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_004631	AAT	2	6	1226313	1226318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_004631	CCG	2	6	1226345	1226350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_004631	CAA	2	6	1226357	1226362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_004631	AAT	2	6	1226364	1226369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_004631	CGC	2	6	1226381	1226386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_004631	CAAT	2	8	1226506	1226513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_004631	AGTA	2	8	1226692	1226699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_004631	CCA	2	6	1226767	1226772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_004631	ATT	2	6	1226808	1226813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_004631	TAA	3	9	1226825	1226833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_004631	A	6	6	1226906	1226911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_004631	T	6	6	1226914	1226919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_004631	CCA	2	6	1226939	1226944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_004631	ATC	2	6	1227015	1227020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_004631	A	6	6	1227103	1227108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_004631	TTTA	2	8	1227168	1227175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_004631	TAA	2	6	1227184	1227189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_004631	GTC	2	6	1227228	1227233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_004631	GCAG	2	8	1227268	1227275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_004631	TCA	2	6	1227286	1227291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_004631	CG	3	6	1227408	1227413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_004631	GCG	2	6	1227469	1227474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_004631	ACG	2	6	1227506	1227511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_004631	CT	3	6	1227518	1227523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_004631	CATT	2	8	1227545	1227552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_004631	AGGA	2	8	1227583	1227590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_004631	ATG	2	6	1227639	1227644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_004631	ATG	2	6	1227652	1227657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_004631	TAA	2	6	1227772	1227777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_004631	AAT	2	6	1227782	1227787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_004631	AT	3	6	1227786	1227791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_004631	TTAA	2	8	1227838	1227845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_004631	AAAAT	2	10	1227868	1227877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_004631	TAT	2	6	1227884	1227889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_004631	ATA	2	6	1227918	1227923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_004631	AGC	2	6	1227967	1227972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_004631	CGT	2	6	1228008	1228013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_004631	GTG	3	9	1228035	1228043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_004631	ACT	2	6	1228077	1228082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4743	NC_004631	ATT	2	6	1251613	1251618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4750	NC_004631	CTT	2	6	1251930	1251935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4753	NC_004631	TGG	2	6	1252106	1252111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4756	NC_004631	CCG	2	6	1252235	1252240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4757	NC_004631	CG	3	6	1252264	1252269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4758	NC_004631	GAG	2	6	1252303	1252308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_004631	TGG	2	6	1253642	1253647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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