MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004606	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_004606	ATTGAA	2	12	70711	70722	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004606	AGTGTA	2	12	78860	78871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004606	ACTAAT	2	12	78888	78899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_004606	TTCGGG	2	12	79830	79841	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_004606	ATAAAA	2	12	106990	107001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004606	AGATAA	2	12	118433	118444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004606	AGATAA	2	12	129971	129982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004606	CTTTAT	2	12	154930	154941	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004606	CTCTTT	2	12	156794	156805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004606	TGACAC	2	12	175535	175546	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004606	CAGTTC	2	12	180180	180191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004606	TTTAAA	2	12	182028	182039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004606	TCTTGC	2	12	249474	249485	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004606	AGTGTA	2	12	254915	254926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004606	ACTAAT	2	12	254943	254954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_004606	TTTTTC	2	12	261275	261286	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004606	AGAAAA	2	12	263971	263982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004606	TTGTTA	2	12	266359	266370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004606	AAAGCA	2	12	280304	280315	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_004606	GTTTTT	2	12	287683	287694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004606	AATATT	2	12	296053	296064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004606	GACTAG	2	12	314670	314681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_004606	AAAGGA	2	12	362146	362157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004606	ATGTTC	2	12	378932	378943	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_004606	AACAAT	2	12	394795	394806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_004606	AACAAA	2	12	414369	414380	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004606	AAAGAC	2	12	429997	430008	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004606	TAAATA	2	12	458274	458285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004606	GGTATT	2	12	507409	507420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004606	TTTCAG	2	12	516371	516382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_004606	AAAATA	2	12	516423	516434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004606	GAATTG	2	12	517495	517506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004606	AGTGTA	2	12	542051	542062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004606	ACTAAT	2	12	542079	542090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_004606	ATTGAG	2	12	543373	543384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004606	GAGAAG	2	12	585797	585808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004606	CTGTTC	2	12	638384	638395	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004606	TAAAAA	2	12	639788	639799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004606	TTTTTA	2	12	640545	640556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004606	TAAAAA	2	12	672754	672765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004606	ATTCTA	2	12	692562	692573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004606	AAAGTC	2	12	708911	708922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_004606	TTTTAG	2	12	732852	732863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004606	CCAAGG	2	12	766458	766469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004606	TCAAAA	2	12	787070	787081	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004606	AAAAAG	2	12	798466	798477	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004606	ATAAAA	2	12	824886	824897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004606	AAGACT	2	12	826059	826070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004606	TCATAT	2	12	845905	845916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_004606	AAAACA	2	12	870887	870898	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_004606	ATGTTA	2	12	972068	972079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004606	TTAAAA	2	12	975777	975788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004606	TAACAA	2	12	1024137	1024148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004606	GATAAT	2	12	1058025	1058036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004606	TTTAAA	2	12	1086109	1086120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004606	AGTCTT	2	12	1088970	1088981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004606	TATTGC	2	12	1111786	1111797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_004606	TCTGGT	2	12	1135845	1135856	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_004606	ATATAA	2	12	1136304	1136315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004606	TTTTTC	2	12	1153818	1153829	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_004606	CCCGAA	2	12	1207033	1207044	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004606	TTACCT	2	12	1242106	1242117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004606	TATTTA	2	12	1252926	1252937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004606	CGCGAA	2	12	1303923	1303934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004606	AAGATG	2	12	1371847	1371858	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004606	CTTTTT	2	12	1404812	1404823	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_004606	TCTTTT	2	12	1433134	1433145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_004606	CAAAAA	2	12	1440301	1440312	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_004606	AGTCCT	2	12	1452743	1452754	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004606	TTACTC	2	12	1468755	1468766	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004606	TAAAAT	2	12	1474544	1474555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004606	ATTTCT	2	12	1505836	1505847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_004606	ATTTAA	2	12	1538740	1538751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004606	AATCAT	2	12	1586846	1586857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_004606	ATTAAA	2	12	1596918	1596929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004606	TATTAG	2	12	1635702	1635713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004606	TACACT	2	12	1635731	1635742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004606	GTTAAA	2	12	1650848	1650859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004606	TCCACT	2	12	1654132	1654143	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004606	TTTTCA	2	12	1685546	1685557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_004606	CCTTTA	2	12	1769617	1769628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004606	TTAATA	2	12	1812406	1812417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004606	ATTTTA	2	12	1822829	1822840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004606	TTTTCA	2	12	1830023	1830034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_004606	TAAAAA	2	12	1842003	1842014	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004606	AATTTA	3	18	1853462	1853479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004606	GAAAAA	2	12	1889819	1889830	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.