MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 6931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004606	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004606	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004606	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004606	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004606	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004606	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004606	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004606	TC	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004606	TTTA	2	8	1663	1670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004606	TA	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004606	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004606	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004606	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004606	T	7	7	2904	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004606	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004606	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004606	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004606	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004606	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004606	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004606	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004606	TCT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004606	T	6	6	3432	3437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004606	TAA	2	6	3442	3447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004606	TTGA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004606	GAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004606	AAC	2	6	8749	8754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004606	GAAC	2	8	8784	8791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004606	TGC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_004606	A	6	6	8859	8864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004606	A	6	6	14788	14793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004606	T	6	6	14819	14824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004606	T	7	7	14899	14905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004606	TTA	2	6	14908	14913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004606	A	6	6	14969	14974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004606	AAT	2	6	14994	14999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004606	AGA	2	6	15000	15005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004606	AGA	2	6	15008	15013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004606	ATA	2	6	16509	16514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004606	ACATT	2	10	16522	16531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004606	TACT	2	8	16577	16584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004606	ACCC	2	8	16610	16617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_004606	AT	3	6	16690	16695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004606	A	6	6	16709	16714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004606	A	6	6	16792	16797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004606	TAA	2	6	16830	16835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004606	AG	3	6	16843	16848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004606	AC	3	6	16858	16863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004606	A	6	6	16870	16875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004606	AGT	2	6	16884	16889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004606	AAG	2	6	16919	16924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004606	AAAT	2	8	17019	17026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004606	AG	3	6	17070	17075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004606	GGC	2	6	17102	17107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004606	ACCT	2	8	17193	17200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_004606	AG	3	6	17245	17250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004606	CGA	2	6	17347	17352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004606	GCA	2	6	17421	17426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004606	CGC	2	6	17468	17473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_004606	GTGA	2	8	17474	17481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004606	TGT	2	6	17507	17512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004606	AGA	2	6	17516	17521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004606	ATG	2	6	17522	17527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004606	CCA	2	6	17543	17548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_004606	TAAC	2	8	17557	17564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004606	CAG	2	6	17590	17595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004606	AGCG	2	8	17645	17652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004606	T	6	6	17660	17665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004606	AT	3	6	17774	17779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004606	GGA	2	6	17780	17785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004606	CT	3	6	17805	17810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_004606	GAA	2	6	18044	18049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004606	GGT	2	6	18118	18123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004606	GTC	2	6	18132	18137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004606	TCGTG	2	10	18141	18150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004606	CAT	2	6	18200	18205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004606	TAA	2	6	18235	18240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004606	GGA	2	6	18244	18249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004606	ATC	2	6	18268	18273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_004606	AC	3	6	18295	18300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004606	TGGT	2	8	18310	18317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004606	CGC	2	6	18434	18439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_004606	AC	3	6	18464	18469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004606	CAC	2	6	18479	18484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_004606	AGCC	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_004606	GAT	2	6	18550	18555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004606	CCT	2	6	18606	18611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_004606	AGG	2	6	18705	18710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004606	CTA	2	6	18751	18756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004606	TG	3	6	18819	18824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004606	CA	3	6	18830	18835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_004606	AGCG	2	8	18873	18880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004606	TA	3	6	18894	18899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004606	ATT	2	6	18993	18998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004606	TAA	2	6	18999	19004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004606	A	8	8	19017	19024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004606	TAA	2	6	19031	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004606	GTTAA	2	10	19038	19047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004606	GAA	2	6	19084	19089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004606	ACG	2	6	19101	19106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004606	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004606	ACTA	2	8	19166	19173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004606	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004606	TAG	2	6	19272	19277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004606	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_004606	AGG	2	6	19294	19299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004606	AGA	2	6	19360	19365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004606	AG	3	6	19388	19393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004606	GGA	2	6	19476	19481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004606	CT	3	6	19502	19507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_004606	GGGAG	2	10	19557	19566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004606	ACA	2	6	19594	19599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_004606	ATG	2	6	19661	19666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004606	TGT	2	6	19731	19736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004606	GGA	2	6	19794	19799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004606	TC	3	6	19880	19885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_004606	ATC	2	6	20001	20006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004606	ACC	2	6	20059	20064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_004606	AGC	2	6	20139	20144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004606	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_004606	TG	3	6	20270	20275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004606	AAG	2	6	20276	20281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004606	GAG	2	6	20291	20296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004606	GA	3	6	20421	20426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004606	TA	3	6	20475	20480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004606	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_004606	TAG	2	6	20604	20609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004606	GA	3	6	20717	20722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004606	CT	3	6	20832	20837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004606	GAT	2	6	20850	20855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004606	AGG	2	6	20895	20900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004606	CGG	2	6	20941	20946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004606	GA	3	6	21039	21044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004606	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004606	GTT	2	6	21201	21206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004606	TAC	2	6	21211	21216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004606	CCT	2	6	21299	21304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_004606	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004606	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_004606	GGT	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004606	TCG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_004606	CGT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_004606	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004606	C	6	6	21806	21811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_004606	GA	3	6	21854	21859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004606	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004606	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_004606	CAG	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_004606	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_004606	AC	3	6	22147	22152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_004606	AGT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004606	T	6	6	22338	22343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_004606	CGT	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_004606	T	6	6	22776	22781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004606	CTC	2	6	22847	22852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_004606	CGC	2	6	23013	23018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_004606	TAT	2	6	23019	23024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004606	ATT	2	6	23129	23134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_004606	GGA	2	6	23137	23142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_004606	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_004606	TCC	2	6	23220	23225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_004606	TCG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_004606	GTT	2	6	23324	23329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_004606	CGG	2	6	23377	23382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_004606	TGT	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_004606	GGT	2	6	23534	23539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_004606	GGT	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_004606	AT	4	8	23593	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_004606	T	11	11	23778	23788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_004606	ATT	2	6	23830	23835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_004606	ACT	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_004606	GTT	2	6	23908	23913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_004606	TTCTT	2	10	23969	23978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
177	NC_004606	AAT	2	6	24038	24043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_004606	CTTTT	2	10	24075	24084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_004606	GTTA	2	8	24089	24096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
180	NC_004606	TAT	2	6	24126	24131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_004606	TGA	2	6	24132	24137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_004606	TAG	2	6	24320	24325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_004606	TAA	2	6	24348	24353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_004606	GAT	2	6	24488	24493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_004606	A	7	7	24720	24726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_004606	TAA	2	6	24749	24754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_004606	A	6	6	24765	24770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_004606	ATA	2	6	24813	24818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_004606	GCT	2	6	25055	25060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_004606	TTA	2	6	25099	25104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_004606	AGT	2	6	25179	25184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_004606	T	7	7	25184	25190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_004606	ATT	2	6	26394	26399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_004606	AT	3	6	26546	26551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_004606	ATTT	2	8	55527	55534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_004606	ATT	2	6	55556	55561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_004606	GTT	2	6	78180	78185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_004606	CCT	2	6	78278	78283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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