MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 7194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004350	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004350	ATC	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004350	T	6	6	122	127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004350	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004350	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004350	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004350	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_004350	ACT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004350	TTA	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004350	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004350	GTT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004350	T	6	6	2868	2873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004350	A	6	6	2922	2927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004350	A	7	7	2934	2940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004350	ATTA	2	8	2945	2952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004350	GCT	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004350	TAT	2	6	3364	3369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004350	T	6	6	3412	3417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004350	A	6	6	4597	4602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004350	CTT	2	6	4625	4630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004350	GGAAA	2	10	4651	4660	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004350	TTA	2	6	8727	8732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004350	TGT	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004350	ATAAA	2	10	8820	8829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004350	A	6	6	9606	9611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004350	TAAT	2	8	12672	12679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004350	CAA	2	6	14670	14675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004350	GGAATA	2	12	14685	14696	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004350	TTA	2	6	14727	14732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004350	CATT	2	8	14748	14755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_004350	TAAC	2	8	14764	14771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004350	TAA	2	6	14777	14782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004350	TAT	2	6	14801	14806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004350	TGT	2	6	14829	14834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004350	AGG	2	6	14876	14881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004350	T	6	6	14887	14892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004350	TTAA	2	8	14913	14920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004350	TTCA	2	8	14963	14970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_004350	TCGC	2	8	14980	14987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004350	AAT	2	6	15004	15009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004350	A	6	6	15028	15033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004350	T	6	6	15066	15071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004350	TAA	2	6	15111	15116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004350	TAA	2	6	15123	15128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004350	TAT	2	6	16606	16611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004350	AAG	2	6	16764	16769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004350	AACC	2	8	16773	16780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004350	GAAC	2	8	16819	16826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004350	GGC	2	6	16907	16912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004350	AC	3	6	16945	16950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_004350	ATA	2	6	17055	17060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004350	ATT	2	6	17064	17069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004350	ATTG	2	8	17078	17085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004350	TAG	2	6	17105	17110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004350	GGTAA	2	10	17137	17146	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004350	CGA	2	6	17160	17165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004350	GCA	2	6	17234	17239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004350	CGC	2	6	17281	17286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_004350	GTGA	2	8	17287	17294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004350	TGT	2	6	17320	17325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004350	GT	3	6	17337	17342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004350	CA	3	6	17357	17362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004350	CAG	2	6	17403	17408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004350	AT	3	6	17587	17592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004350	GGA	2	6	17593	17598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004350	CT	3	6	17618	17623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_004350	GAA	2	6	17857	17862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004350	GGT	2	6	17931	17936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004350	GTC	2	6	17945	17950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004350	TCGTG	2	10	17954	17963	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004350	CAT	2	6	18013	18018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004350	TAA	2	6	18048	18053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004350	GGA	2	6	18057	18062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004350	ATC	2	6	18081	18086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004350	AC	3	6	18108	18113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004350	CGC	2	6	18247	18252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_004350	AC	3	6	18277	18282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_004350	CAC	2	6	18292	18297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_004350	GCC	2	6	18345	18350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_004350	GATG	2	8	18359	18366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004350	CCT	2	6	18419	18424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_004350	CTT	2	6	18458	18463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_004350	AGG	2	6	18526	18531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004350	AGA	2	6	18604	18609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004350	AAG	2	6	18624	18629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004350	A	6	6	18770	18775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004350	GTTAA	2	10	18816	18825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004350	ACGA	2	8	18875	18882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004350	GTAA	2	8	18902	18909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004350	GAAG	2	8	18984	18991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004350	GCG	2	6	19055	19060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004350	AGG	2	6	19072	19077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004350	AGC	2	6	19122	19127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004350	AGA	3	9	19137	19145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004350	AG	4	8	19163	19170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004350	CGG	2	6	19221	19226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004350	AAG	2	6	19373	19378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004350	TTACGT	2	12	19431	19442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_004350	GGA	2	6	19571	19576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004350	TC	3	6	19657	19662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_004350	GTCG	2	8	19684	19691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_004350	TTGA	2	8	19718	19725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004350	ACC	2	6	19836	19841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_004350	AAT	2	6	19856	19861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004350	AGC	2	6	19916	19921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004350	ATTC	2	8	19923	19930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_004350	GA	3	6	20194	20199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004350	AGG	2	6	20258	20263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004350	GCA	2	6	20267	20272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004350	GTGAG	2	10	20313	20322	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004350	CCA	2	6	20349	20354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_004350	TAG	2	6	20377	20382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004350	CT	3	6	20606	20611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004350	CGG	2	6	20717	20722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_004350	GA	3	6	20815	20820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004350	TAGG	2	8	20933	20940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004350	GTT	2	6	20977	20982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004350	TAC	2	6	20987	20992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004350	TG	3	6	20996	21001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004350	ATC	2	6	21027	21032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004350	CCT	2	6	21075	21080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_004350	GACA	2	8	21168	21175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_004350	GGT	2	6	21211	21216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004350	TCG	2	6	21326	21331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004350	CGT	2	6	21406	21411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004350	GTT	2	6	21509	21514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004350	AGGG	2	8	21544	21551	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004350	C	6	6	21582	21587	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_004350	GA	3	6	21630	21635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004350	T	6	6	21796	21801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004350	T	6	6	21825	21830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004350	AAAG	2	8	21831	21838	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004350	GCTA	2	8	21862	21869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_004350	GTGA	2	8	21877	21884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004350	TGA	2	6	21903	21908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004350	CAG	2	6	21944	21949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004350	AGT	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004350	GTC	2	6	22001	22006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004350	TTAG	2	8	22111	22118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004350	GTG	2	6	22126	22131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004350	AG	3	6	22206	22211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004350	ATC	2	6	22214	22219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_004350	TCA	2	6	22290	22295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_004350	CGT	2	6	22534	22539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_004350	AGG	2	6	22547	22552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004350	ATAA	2	8	22637	22644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004350	ATT	2	6	22851	22856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004350	CGC	2	6	22923	22928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_004350	ATTA	2	8	22934	22941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004350	GGA	2	6	23042	23047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004350	GCGT	2	8	23101	23108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_004350	TCC	2	6	23125	23130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_004350	TCG	2	6	23168	23173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_004350	CGG	2	6	23274	23279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_004350	TGT	2	6	23345	23350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004350	CTTTT	2	10	23375	23384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_004350	GGT	2	6	23460	23465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_004350	AT	4	8	23484	23491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004350	GTA	2	6	23581	23586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_004350	TG	3	6	23627	23632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_004350	GATGA	2	10	23640	23649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_004350	TAAA	2	8	24993	25000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_004350	TAA	2	6	25005	25010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_004350	AT	3	6	25018	25023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_004350	T	8	8	25031	25038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_004350	TATCT	2	10	26403	26412	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_004350	TCA	2	6	26431	26436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_004350	GGA	2	6	26493	26498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_004350	T	7	7	27489	27495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_004350	A	6	6	29491	29496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_004350	TGA	2	6	29507	29512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_004350	ATT	2	6	29569	29574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_004350	T	7	7	29617	29623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_004350	GAG	2	6	29674	29679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_004350	TGT	2	6	30950	30955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_004350	T	7	7	30993	30999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_004350	ACT	2	6	31025	31030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_004350	T	7	7	31030	31036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_004350	TAA	2	6	31052	31057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_004350	CAG	2	6	31103	31108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_004350	T	7	7	31772	31778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_004350	TAT	2	6	31784	31789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_004350	TTG	2	6	31802	31807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_004350	TTG	2	6	38493	38498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_004350	GA	3	6	40546	40551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_004350	ACA	2	6	69489	69494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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