MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 7194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_004350	ACTT	2	8	1147361	1147368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_004350	CTC	2	6	1147369	1147374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_004350	CT	3	6	1147988	1147993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_004350	CGT	2	6	1148014	1148019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_004350	CAT	2	6	1149478	1149483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_004350	T	6	6	1149514	1149519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_004350	TCAG	2	8	1149522	1149529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_004350	TCG	2	6	1149536	1149541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_004350	CG	3	6	1149540	1149545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_004350	AGAA	2	8	1149589	1149596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4013	NC_004350	AG	3	6	1149712	1149717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_004350	ATT	2	6	1153061	1153066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_004350	T	6	6	1153072	1153077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004350	T	6	6	1153088	1153093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4019	NC_004350	TTTC	2	8	1153877	1153884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4021	NC_004350	AT	3	6	1156115	1156120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_004350	T	7	7	1156123	1156129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_004350	TCTA	2	8	1158912	1158919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_004350	A	7	7	1158995	1159001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4033	NC_004350	TTA	2	6	1162767	1162772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4041	NC_004350	AACT	2	8	1166019	1166026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_004350	A	6	6	1166040	1166045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_004350	CT	3	6	1166094	1166099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_004350	T	6	6	1166122	1166127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_004350	TGAAA	2	10	1166139	1166148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4053	NC_004350	CT	3	6	1168827	1168832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_004350	CTTT	2	8	1168836	1168843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4062	NC_004350	TTCA	2	8	1173411	1173418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4101	NC_004350	AAGA	2	8	1183486	1183493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_004350	TA	3	6	1183512	1183517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_004350	CAT	2	6	1183567	1183572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4113	NC_004350	TTTAA	2	10	1185619	1185628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_004350	T	7	7	1186687	1186693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4124	NC_004350	TTTC	2	8	1188818	1188825	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_004350	T	6	6	1188857	1188862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_004350	GAG	2	6	1191647	1191652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_004350	CGTT	2	8	1192019	1192026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_004350	CCT	2	6	1192042	1192047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4137	NC_004350	GCAG	2	8	1192062	1192069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4138	NC_004350	TCT	2	6	1192139	1192144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4140	NC_004350	CTT	2	6	1192741	1192746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_004350	T	6	6	1192754	1192759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_004350	CTTTG	2	10	1194169	1194178	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4143	NC_004350	AT	3	6	1194179	1194184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_004350	CTT	3	9	1194186	1194194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_004350	TA	3	6	1196212	1196217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_004350	CTTTCT	2	12	1196258	1196269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4151	NC_004350	TA	3	6	1196358	1196363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4158	NC_004350	A	6	6	1202682	1202687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4160	NC_004350	TTCA	2	8	1202722	1202729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4163	NC_004350	T	7	7	1202897	1202903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4167	NC_004350	T	6	6	1203075	1203080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_004350	TTA	2	6	1203116	1203121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4174	NC_004350	T	6	6	1203288	1203293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4234	NC_004350	A	6	6	1224068	1224073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4240	NC_004350	CTTT	2	8	1225115	1225122	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4242	NC_004350	A	7	7	1225934	1225940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_004350	TA	3	6	1226002	1226007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_004350	ACG	2	6	1229440	1229445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4256	NC_004350	T	6	6	1233619	1233624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_004350	CTT	2	6	1233626	1233631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4259	NC_004350	TCC	2	6	1234745	1234750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4262	NC_004350	GTTTT	2	10	1235002	1235011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_004350	AAT	2	6	1236597	1236602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_004350	TTTA	2	8	1236616	1236623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4400	NC_004350	A	7	7	1293361	1293367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_004350	GGC	2	6	1293419	1293424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_004350	GT	4	8	1293612	1293619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_004350	GAT	2	6	1293641	1293646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4404	NC_004350	GTTT	2	8	1295040	1295047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_004350	A	7	7	1295084	1295090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_004350	TAA	2	6	1295109	1295114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4407	NC_004350	ACTTGA	2	12	1295246	1295257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4408	NC_004350	CAT	2	6	1295258	1295263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4409	NC_004350	CAT	2	6	1295972	1295977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4410	NC_004350	AT	3	6	1295995	1296000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4411	NC_004350	TTTG	2	8	1296016	1296023	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_004350	CAC	2	6	1296132	1296137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4413	NC_004350	CAA	2	6	1296180	1296185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4414	NC_004350	CTC	2	6	1296186	1296191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4415	NC_004350	ATC	2	6	1296216	1296221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4416	NC_004350	ATA	2	6	1296226	1296231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4417	NC_004350	TAC	2	6	1296259	1296264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4418	NC_004350	CTTG	2	8	1296300	1296307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4419	NC_004350	TGA	2	6	1296336	1296341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4420	NC_004350	ACC	2	6	1296464	1296469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4422	NC_004350	CCAG	2	8	1296512	1296519	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4423	NC_004350	ACT	2	6	1296955	1296960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4424	NC_004350	GAT	2	6	1296976	1296981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4425	NC_004350	T	6	6	1297064	1297069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4426	NC_004350	T	6	6	1297124	1297129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4427	NC_004350	GGT	2	6	1297160	1297165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4428	NC_004350	TCC	2	6	1300368	1300373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4429	NC_004350	ATATTT	3	18	1301013	1301030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4431	NC_004350	A	6	6	1301069	1301074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4432	NC_004350	AAGT	2	8	1301115	1301122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_004350	TCA	2	6	1301131	1301136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4434	NC_004350	AAG	2	6	1301142	1301147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4436	NC_004350	TCA	2	6	1301349	1301354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4437	NC_004350	GAA	2	6	1301387	1301392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4438	NC_004350	AAT	2	6	1301409	1301414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4439	NC_004350	CTC	2	6	1301431	1301436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4441	NC_004350	TCT	2	6	1301628	1301633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4442	NC_004350	CGT	2	6	1301637	1301642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4443	NC_004350	TCCA	2	8	1301666	1301673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4444	NC_004350	AAG	2	6	1301755	1301760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_004350	TGC	2	6	1301792	1301797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4447	NC_004350	ATA	2	6	1302122	1302127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4448	NC_004350	AGGT	2	8	1302944	1302951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4449	NC_004350	ATG	2	6	1302952	1302957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4450	NC_004350	TAA	2	6	1303026	1303031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4452	NC_004350	CATCT	2	10	1303123	1303132	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4453	NC_004350	GAC	2	6	1303149	1303154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4461	NC_004350	TC	3	6	1303445	1303450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4462	NC_004350	AAG	2	6	1303478	1303483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4463	NC_004350	TGGT	2	8	1303823	1303830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4472	NC_004350	CTA	2	6	1304430	1304435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4480	NC_004350	CTG	2	6	1305791	1305796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4482	NC_004350	AG	3	6	1307265	1307270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4483	NC_004350	A	6	6	1307313	1307318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4499	NC_004350	ACA	3	9	1308618	1308626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_004350	GTACA	2	10	1308662	1308671	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

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