MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004349	GGA	2	6	40	45	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004349	T	6	6	163	168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004349	A	6	6	373	378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004349	AGCG	2	8	487	494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_004349	TAT	2	6	500	505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004349	GAT	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004349	A	7	7	1552	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004349	A	6	6	1674	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004349	AAT	2	6	1733	1738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004349	A	7	7	1766	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004349	AT	3	6	1784	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004349	CATG	2	8	1791	1798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004349	AAG	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004349	ATGAA	2	10	1870	1879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004349	GTTA	2	8	1892	1899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004349	ACA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004349	A	6	6	1958	1963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004349	AC	3	6	1986	1991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_004349	CCT	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_004349	GAG	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004349	CAC	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_004349	CACT	2	8	2177	2184	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004349	AAT	2	6	2238	2243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004349	CAT	2	6	2302	2307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004349	CAT	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004349	ATT	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004349	TGT	2	6	2488	2493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004349	CAA	2	6	2508	2513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004349	ATTA	2	8	2561	2568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004349	TA	3	6	2628	2633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004349	ATA	2	6	5670	5675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004349	T	7	7	6878	6884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004349	CGT	2	6	6946	6951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004349	AACG	2	8	6971	6978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_004349	T	7	7	6979	6985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004349	T	6	6	7025	7030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004349	C	6	6	7033	7038	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_004349	AATT	2	8	9368	9375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004349	TA	3	6	9392	9397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004349	AAT	2	6	9398	9403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004349	TAAT	2	8	9414	9421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004349	ATT	2	6	9440	9445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004349	AAG	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004349	TAA	2	6	9711	9716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004349	T	6	6	9736	9741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004349	CA	3	6	9996	10001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_004349	TG	3	6	10013	10018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004349	GAT	2	6	10033	10038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004349	AC	3	6	11741	11746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004349	ATA	2	6	11828	11833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004349	A	6	6	11854	11859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004349	AAAAT	2	10	11883	11892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004349	AC	3	6	11894	11899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004349	CTG	2	6	11911	11916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004349	A	7	7	11926	11932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004349	T	6	6	12033	12038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004349	TGGG	2	8	12047	12054	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004349	CGGG	2	8	12099	12106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004349	TGC	2	6	12157	12162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004349	C	6	6	12189	12194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_004349	AGC	2	6	12228	12233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004349	AGG	2	6	12309	12314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004349	CAA	2	6	12438	12443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004349	ACC	2	6	12457	12462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_004349	T	6	6	12498	12503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004349	AT	3	6	12510	12515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004349	GCC	2	6	12585	12590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_004349	AAC	2	6	12601	12606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_004349	GCC	2	6	12675	12680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_004349	GGCGT	2	10	12693	12702	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004349	A	6	6	12932	12937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004349	CTT	3	9	15920	15928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004349	ACA	2	6	15971	15976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004349	ATT	2	6	16019	16024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004349	ATA	2	6	16055	16060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004349	T	6	6	17298	17303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004349	CAG	2	6	17409	17414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004349	A	6	6	17567	17572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004349	CCG	2	6	17586	17591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_004349	A	6	6	17622	17627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004349	TTG	2	6	17643	17648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004349	GAAA	2	8	17662	17669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004349	AGGC	2	8	17726	17733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004349	GCA	2	6	17760	17765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004349	CGG	2	6	17872	17877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004349	AAGA	2	8	17879	17886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004349	TTA	2	6	17959	17964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004349	GCA	2	6	18061	18066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004349	ATT	2	6	18110	18115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004349	CGG	2	6	18164	18169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004349	GCT	2	6	18204	18209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004349	GTT	2	6	18268	18273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004349	CAAC	2	8	18322	18329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_004349	TTG	2	6	18612	18617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004349	ATTT	2	8	18728	18735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004349	GGA	2	6	18761	18766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004349	CCA	2	6	19100	19105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_004349	A	7	7	19476	19482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004349	TA	3	6	19487	19492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004349	T	7	7	19497	19503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004349	ACC	2	6	22502	22507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_004349	CCAAA	2	10	22513	22522	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_004349	CTT	2	6	22642	22647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_004349	CGC	2	6	22687	22692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_004349	GC	3	6	22694	22699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_004349	TGTC	2	8	22703	22710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_004349	TAAA	2	8	24713	24720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004349	TG	3	6	24727	24732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004349	GT	3	6	24738	24743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004349	AGG	2	6	25741	25746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004349	TGA	2	6	25986	25991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004349	AAT	2	6	26003	26008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004349	AGATT	2	10	26067	26076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004349	ATT	2	6	27519	27524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004349	ATT	2	6	27592	27597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004349	ATG	2	6	27606	27611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004349	AAG	2	6	27640	27645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004349	A	6	6	27655	27660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004349	AATTTA	2	12	27671	27682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004349	TGA	3	9	27684	27692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004349	TTG	2	6	27716	27721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004349	ATAA	2	8	27744	27751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004349	G	6	6	27759	27764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004349	GCG	2	6	28065	28070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004349	CGC	2	6	28075	28080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_004349	CGG	2	6	28131	28136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004349	GCT	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004349	TGA	2	6	28197	28202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004349	TCGG	2	8	28218	28225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_004349	TCGCT	2	10	28231	28240	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_004349	GCAA	2	8	28267	28274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004349	G	6	6	30679	30684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004349	T	6	6	30699	30704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004349	T	6	6	30712	30717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004349	TTC	2	6	30726	30731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004349	A	6	6	30737	30742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004349	AGG	2	6	30820	30825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004349	A	6	6	31425	31430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004349	GTG	2	6	31431	31436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004349	T	6	6	31487	31492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004349	ACCA	2	8	32100	32107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004349	CAGAC	2	10	32318	32327	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_004349	GTT	2	6	32352	32357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004349	T	6	6	32396	32401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004349	T	6	6	32421	32426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004349	GTC	2	6	35039	35044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_004349	CG	3	6	35089	35094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_004349	GTT	2	6	35359	35364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004349	TTG	2	6	35402	35407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004349	GGT	2	6	35808	35813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004349	AAT	2	6	35831	35836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004349	AATCT	2	10	35845	35854	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_004349	TCAGA	2	10	35884	35893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_004349	TAA	2	6	37877	37882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_004349	ATC	2	6	37903	37908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_004349	ATC	2	6	37924	37929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_004349	TTA	2	6	37930	37935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_004349	TTAG	2	8	37937	37944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004349	TAA	2	6	37952	37957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_004349	ATGC	2	8	38026	38033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_004349	TAA	2	6	38035	38040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_004349	TAC	2	6	38043	38048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_004349	ATT	2	6	38053	38058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_004349	A	7	7	38290	38296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_004349	TA	3	6	38301	38306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_004349	TTCC	2	8	38758	38765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_004349	ATGTCA	2	12	38879	38890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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169	NC_004349	TA	3	6	42460	42465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_004349	ATT	2	6	42575	42580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_004349	ATT	2	6	42645	42650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_004349	AT	3	6	42676	42681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_004349	GTT	2	6	42727	42732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_004349	TCT	2	6	42764	42769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_004349	AT	3	6	42773	42778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_004349	TAT	2	6	42785	42790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_004349	TGAT	2	8	42807	42814	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_004349	CGC	2	6	42898	42903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_004349	A	6	6	42905	42910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_004349	T	6	6	42918	42923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_004349	T	6	6	42983	42988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_004349	TAT	2	6	42999	43004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_004349	TTAGT	2	10	43033	43042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_004349	A	6	6	43060	43065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_004349	T	6	6	43134	43139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_004349	T	6	6	43175	43180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_004349	ACT	2	6	43203	43208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_004349	T	6	6	43208	43213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_004349	AAT	2	6	43272	43277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_004349	GTT	2	6	43367	43372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_004349	TTG	2	6	43452	43457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_004349	T	6	6	44160	44165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_004349	ATT	2	6	46602	46607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_004349	ATT	2	6	48272	48277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_004349	TAA	2	6	48311	48316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_004349	CGG	2	6	52703	52708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_004349	CTG	2	6	54309	54314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_004349	ACC	2	6	56157	56162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_004349	TTG	2	6	56222	56227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_004349	ACT	2	6	56304	56309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_004349	TAAT	2	8	56322	56329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_004349	TCA	2	6	56376	56381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_004349	CA	3	6	56380	56385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
290	NC_004349	TAT	2	6	56473	56478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_004349	CAG	2	6	56542	56547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_004349	TAA	2	6	57276	57281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_004349	ATT	2	6	57393	57398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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