MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004347	AGCTT	2	10	13097	13106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004347	TAATG	2	10	14020	14029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004347	ATAAA	2	10	23245	23254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004347	CAGGT	2	10	45573	45582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_004347	AAGGG	2	10	47711	47720	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004347	AGTCG	2	10	49055	49064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004347	AGGCT	2	10	49384	49393	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004347	ATCCC	2	10	51090	51099	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_004347	GTTAA	2	10	51200	51209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004347	TCCGC	2	10	51276	51285	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_004347	GGGCT	2	10	57302	57311	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004347	GATAG	2	10	58085	58094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004347	TGAAG	2	10	63174	63183	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004347	TTTTC	2	10	71853	71862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004347	GAGTT	2	10	96748	96757	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004347	AATAA	2	10	99458	99467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004347	TTAAG	2	10	100205	100214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004347	AAATA	2	10	120232	120241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004347	TTTAA	2	10	121731	121740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004347	AGATA	2	10	132977	132986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004347	TAGGA	2	10	134330	134339	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004347	TCAAT	2	10	136132	136141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004347	ATCTA	2	10	149981	149990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_004347	ATATT	2	10	159295	159304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004347	CAAAG	2	10	165682	165691	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_004347	GCATT	2	10	165697	165706	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_004347	TTAAT	2	10	167875	167884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004347	TATCC	2	10	169724	169733	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_004347	TCCCT	2	10	190133	190142	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_004347	CAAAT	2	10	209296	209305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004347	GAAAA	2	10	209379	209388	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004347	TAGTG	2	10	213032	213041	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004347	AGTCG	2	10	220051	220060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_004347	AGGCT	2	10	220380	220389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_004347	ATCCC	2	10	222086	222095	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_004347	GCAAG	2	10	223286	223295	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_004347	GAATT	2	10	231723	231732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004347	GTTTT	2	10	259399	259408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004347	AAGCT	2	10	259844	259853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_004347	AGTCG	2	10	272752	272761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_004347	AGGCT	2	10	273081	273090	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004347	ATCCC	2	10	274788	274797	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_004347	AATAA	2	10	280401	280410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004347	AAAAG	2	10	308879	308888	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004347	AATAA	2	10	322520	322529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004347	TTTGA	2	10	322587	322596	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004347	AGTAA	2	10	322623	322632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004347	TAATT	2	10	336330	336339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004347	ACTTT	2	10	346023	346032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004347	CCTTC	2	10	351359	351368	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_004347	ATTGT	2	10	353739	353748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004347	GGTCA	2	10	367519	367528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004347	GTTTT	2	10	375616	375625	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004347	TTTGG	2	10	375676	375685	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004347	TTTGA	2	10	399443	399452	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004347	TTTTC	2	10	416874	416883	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_004347	AATTT	2	10	423206	423215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004347	ACGCT	2	10	428864	428873	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_004347	GAGTA	2	10	451787	451796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004347	AGTTG	2	10	455595	455604	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004347	TTAAT	2	10	461182	461191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004347	CATCC	2	10	474883	474892	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_004347	GTGCT	2	10	478706	478715	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_004347	CTTGT	2	10	490705	490714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004347	GATTT	2	10	498969	498978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004347	GTTAA	2	10	502446	502455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004347	GGTTT	2	10	506181	506190	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004347	AATCT	2	10	514318	514327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_004347	TTTAC	2	10	518427	518436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004347	TACCT	2	10	524929	524938	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_004347	TAAAA	2	10	526867	526876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004347	TGCTT	2	10	527429	527438	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004347	TAAAA	2	10	530769	530778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004347	AATCT	2	10	535119	535128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004347	TTAAC	2	10	536997	537006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_004347	GCAGG	2	10	537552	537561	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004347	TAGGC	2	10	545088	545097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_004347	AAAAC	2	10	545480	545489	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004347	CATCC	2	10	548201	548210	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_004347	TTGAA	2	10	579216	579225	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004347	GGGAA	2	10	582318	582327	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004347	TAATT	2	10	591737	591746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004347	ACGCC	2	10	599839	599848	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_004347	GTGAT	2	10	602314	602323	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004347	ATTGG	2	10	607514	607523	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004347	CTTTT	2	10	610962	610971	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004347	GAAAA	2	10	620160	620169	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004347	AAAAC	2	10	621197	621206	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004347	TGCTG	2	10	644762	644771	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_004347	TTTTG	2	10	648318	648327	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004347	GTATC	2	10	670193	670202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_004347	GGTTA	2	10	673457	673466	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004347	CACTC	2	10	692185	692194	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_004347	AATCG	2	10	694329	694338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004347	GCTTT	2	10	708866	708875	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_004347	CGCTT	2	10	709174	709183	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_004347	GTTTT	2	10	722851	722860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004347	TGTTT	2	10	727246	727255	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004347	ATCAA	2	10	727280	727289	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_004347	CCTTG	2	10	730490	730499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_004347	GCTAT	2	10	737861	737870	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004347	CATTC	2	10	740815	740824	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_004347	AGTCG	2	10	740875	740884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004347	CTTTG	2	10	748974	748983	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_004347	CCGCA	2	10	754174	754183	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_004347	TCAAA	2	10	763459	763468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004347	GGAAG	2	10	765444	765453	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004347	ACTGC	2	10	777913	777922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_004347	CAATC	2	10	781044	781053	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_004347	TGCGA	2	10	781547	781556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004347	AACAG	2	10	782671	782680	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_004347	CATTG	2	10	785836	785845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_004347	CGAGC	2	10	787595	787604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_004347	TGTTT	2	10	788201	788210	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004347	GCCAT	2	10	788987	788996	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_004347	GGTTT	2	10	799835	799844	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004347	TGAAA	2	10	802137	802146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004347	CTTTC	2	10	802416	802425	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_004347	ATCGG	2	10	802820	802829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_004347	AGGTT	2	10	804574	804583	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004347	TTTTG	2	10	804588	804597	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004347	AAACT	2	10	843721	843730	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_004347	GGTTA	2	10	846590	846599	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004347	AAATT	2	10	846613	846622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004347	AACAG	2	10	866465	866474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_004347	ATCTA	2	10	880583	880592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_004347	AGAGG	2	10	881050	881059	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004347	AAATG	2	10	890228	890237	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004347	TATGC	2	10	891543	891552	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_004347	TTTCA	2	10	904663	904672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004347	TGAAA	2	10	904706	904715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004347	ATAAG	2	10	906935	906944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004347	ATCTT	2	10	910190	910199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004347	CTTAG	2	10	918898	918907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004347	AGAAA	2	10	919315	919324	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004347	GAATT	2	10	924668	924677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004347	GTTAA	2	10	928706	928715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004347	AAATT	2	10	938123	938132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004347	TTTGC	2	10	939195	939204	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004347	ATTGG	2	10	944379	944388	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004347	AGTGA	2	10	946341	946350	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004347	AGTCT	2	10	951349	951358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_004347	AATCT	2	10	957830	957839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_004347	TCGCT	2	10	959543	959552	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_004347	ATATT	2	10	984470	984479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004347	ATTAA	2	10	1006993	1007002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004347	AGATA	2	10	1009565	1009574	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_004347	AAATT	2	10	3514920	3514929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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