MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004347	TTG	2	6	489076	489081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_004347	TGTA	2	8	489139	489146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_004347	ATA	2	6	489238	489243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_004347	T	6	6	489254	489259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_004347	GCT	2	6	489366	489371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_004347	ATA	2	6	489372	489377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_004347	ATT	2	6	489389	489394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_004347	TA	3	6	490396	490401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_004347	CAT	2	6	490425	490430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_004347	CCAT	2	8	490457	490464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_004347	CGT	2	6	490569	490574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_004347	CA	3	6	490579	490584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_004347	TGCT	2	8	490591	490598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_004347	CTTGT	2	10	490705	490714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1515	NC_004347	GC	3	6	490722	490727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_004347	TCT	2	6	490738	490743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_004347	T	6	6	490762	490767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_004347	CGCT	2	8	493002	493009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_004347	ATG	2	6	493017	493022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_004347	AAT	2	6	493953	493958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004347	AAG	2	6	493973	493978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_004347	AAT	2	6	494524	494529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_004347	ATT	2	6	494564	494569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_004347	CTGA	2	8	494591	494598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_004347	AG	3	6	494672	494677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_004347	TTA	2	6	494709	494714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_004347	A	7	7	495151	495157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_004347	T	6	6	495195	495200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_004347	GCG	2	6	495212	495217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_004347	T	6	6	495231	495236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_004347	AT	3	6	495247	495252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_004347	TTA	2	6	495292	495297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_004347	TTAA	2	8	495328	495335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_004347	ATC	2	6	495345	495350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_004347	TGCA	2	8	495394	495401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_004347	GC	3	6	495427	495432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_004347	GGT	2	6	495440	495445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_004347	AGG	2	6	495522	495527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_004347	GAT	2	6	496617	496622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_004347	GAG	2	6	496699	496704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_004347	ACC	2	6	497894	497899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_004347	TCG	2	6	497911	497916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_004347	CA	3	6	497986	497991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_004347	TTC	2	6	498015	498020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_004347	TGA	2	6	498153	498158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_004347	GCC	2	6	498170	498175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1548	NC_004347	AAAG	2	8	498858	498865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_004347	AGC	2	6	498926	498931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_004347	GATTT	2	10	498969	498978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_004347	CCG	2	6	499007	499012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_004347	ATG	2	6	502190	502195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_004347	T	6	6	502202	502207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_004347	TTAT	2	8	502228	502235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_004347	T	7	7	502390	502396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_004347	A	7	7	502403	502409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_004347	GTTAA	2	10	502446	502455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_004347	T	6	6	502468	502473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_004347	T	6	6	502528	502533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_004347	TC	3	6	502540	502545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_004347	TCA	2	6	502548	502553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_004347	TAAA	2	8	504817	504824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_004347	AAAT	2	8	505313	505320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_004347	GGTTT	2	10	506181	506190	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_004347	ATGA	2	8	506236	506243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_004347	AACGAT	2	12	506980	506991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1567	NC_004347	ATAA	2	8	506992	506999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_004347	GGA	2	6	507025	507030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_004347	TAA	2	6	508698	508703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_004347	TGA	2	6	508717	508722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_004347	T	8	8	508727	508734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_004347	TCG	2	6	508743	508748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_004347	TGT	2	6	512596	512601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_004347	GTT	2	6	512686	512691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_004347	TTA	2	6	514031	514036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_004347	GCA	2	6	514111	514116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_004347	GCA	2	6	514184	514189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_004347	TGC	2	6	514205	514210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_004347	CAT	2	6	514274	514279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_004347	GAAC	2	8	514308	514315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_004347	AATCT	2	10	514318	514327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1584	NC_004347	CTTT	2	8	514383	514390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1586	NC_004347	TCT	2	6	514487	514492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_004347	TGGA	2	8	516704	516711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_004347	CCAT	2	8	517593	517600	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_004347	TCGT	2	8	517606	517613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_004347	GCT	2	6	517617	517622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1599	NC_004347	AATCAG	2	12	518257	518268	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1601	NC_004347	TAT	2	6	518299	518304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_004347	GAT	2	6	518347	518352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_004347	AGC	2	6	518396	518401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_004347	TTTAC	2	10	518427	518436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_004347	CAA	2	6	518455	518460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_004347	TAG	2	6	518599	518604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_004347	ATC	2	6	518609	518614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1611	NC_004347	ATT	2	6	519984	519989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_004347	TTTA	2	8	519993	520000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_004347	CT	4	8	520036	520043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_004347	TCA	2	6	520075	520080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_004347	TGC	2	6	520128	520133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_004347	ATCTGA	2	12	520302	520313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1617	NC_004347	AT	3	6	520316	520321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_004347	ATT	2	6	521361	521366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_004347	ATT	2	6	521377	521382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_004347	T	6	6	521420	521425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_004347	CTGA	2	8	521528	521535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_004347	A	6	6	521545	521550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_004347	TGG	2	6	521560	521565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_004347	T	6	6	521566	521571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_004347	TGG	2	6	523597	523602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_004347	GGC	2	6	523617	523622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_004347	T	6	6	523723	523728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_004347	CTT	2	6	523772	523777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_004347	AAC	2	6	523798	523803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_004347	TCGT	2	8	523843	523850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_004347	GCA	2	6	523862	523867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_004347	CAT	2	6	523969	523974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_004347	ATG	2	6	523977	523982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_004347	AGA	2	6	524116	524121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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