MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004347	TTTG	2	8	314943	314950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004347	GAT	2	6	317397	317402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004347	GT	3	6	317429	317434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004347	TAA	2	6	320153	320158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004347	TTA	2	6	320201	320206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_004347	ACA	2	6	322424	322429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_004347	AT	3	6	322448	322453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004347	ATG	2	6	322495	322500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004347	AATAA	2	10	322520	322529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004347	AGTG	2	8	322544	322551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_004347	TTTGA	2	10	322587	322596	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004347	AGTAA	2	10	322623	322632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004347	CTA	2	6	322680	322685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_004347	ATT	2	6	322831	322836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004347	TTA	2	6	322842	322847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_004347	TG	3	6	322864	322869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004347	TTAA	2	8	322902	322909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004347	ATT	2	6	322915	322920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_004347	AAAT	2	8	322940	322947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_004347	ATC	2	6	322955	322960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_004347	A	6	6	323018	323023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004347	TAA	2	6	323033	323038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_004347	ATA	2	6	323039	323044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004347	CT	3	6	323057	323062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_004347	GAA	2	6	323202	323207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004347	T	6	6	325064	325069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_004347	TG	4	8	325148	325155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004347	TCA	2	6	327673	327678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004347	T	7	7	328356	328362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_004347	A	6	6	328377	328382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004347	TAG	2	6	328385	328390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_004347	A	6	6	328394	328399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_004347	TTCC	2	8	328987	328994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_004347	TGC	2	6	329091	329096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_004347	CAT	2	6	330542	330547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_004347	AGC	3	9	330549	330557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_004347	TGT	2	6	332170	332175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004347	T	7	7	332317	332323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_004347	GA	3	6	334510	334515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004347	AT	3	6	335638	335643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_004347	ATCT	2	8	336321	336328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_004347	TAATT	2	10	336330	336339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_004347	ATA	2	6	336345	336350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004347	T	6	6	336381	336386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004347	A	8	8	336454	336461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_004347	AAT	2	6	336550	336555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004347	TTA	2	6	336603	336608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_004347	TTAT	2	8	336632	336639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_004347	A	7	7	336653	336659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004347	AAC	2	6	336714	336719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_004347	A	6	6	337257	337262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_004347	T	7	7	337290	337296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004347	TTA	2	6	337304	337309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004347	TATT	2	8	337331	337338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004347	TTGA	2	8	338911	338918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004347	AAG	2	6	339309	339314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004347	TTA	2	6	339352	339357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_004347	ATT	2	6	339408	339413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_004347	CAC	2	6	339421	339426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_004347	TAT	2	6	340222	340227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004347	TGC	2	6	340284	340289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_004347	GGT	2	6	340317	340322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004347	ACTTT	2	10	346023	346032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1064	NC_004347	ATA	2	6	346079	346084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004347	AGC	2	6	346130	346135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_004347	T	6	6	346158	346163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004347	A	6	6	346204	346209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_004347	TA	3	6	346253	346258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_004347	GGC	2	6	347503	347508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_004347	GCC	2	6	347524	347529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_004347	CAT	2	6	350150	350155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_004347	CCTTC	2	10	351359	351368	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1073	NC_004347	AAC	2	6	351539	351544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_004347	ATTG	2	8	353311	353318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004347	A	6	6	353339	353344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_004347	ATT	2	6	353359	353364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_004347	CAA	2	6	353367	353372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_004347	ATTG	2	8	353419	353426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_004347	ATT	3	9	353433	353441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_004347	T	6	6	353440	353445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_004347	T	6	6	353479	353484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_004347	TAG	2	6	353559	353564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_004347	GAT	2	6	353567	353572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_004347	GGA	2	6	353605	353610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_004347	GGC	2	6	353669	353674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_004347	ATTGT	2	10	353739	353748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004347	CCT	2	6	355608	355613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_004347	CAG	2	6	355666	355671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_004347	TTG	2	6	357242	357247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_004347	TTGC	2	8	357312	357319	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_004347	GCT	2	6	360280	360285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_004347	GCA	2	6	360299	360304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_004347	TCA	2	6	361125	361130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_004347	GGCA	2	8	362234	362241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_004347	CA	3	6	362240	362245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_004347	AAT	2	6	364090	364095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004347	TGG	2	6	364104	364109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004347	GTA	2	6	364140	364145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004347	AG	3	6	364166	364171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004347	AAAT	2	8	364185	364192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004347	TGA	2	6	364223	364228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004347	TTAC	2	8	364235	364242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_004347	CATC	2	8	364329	364336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_004347	GTT	2	6	365743	365748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004347	A	6	6	365798	365803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004347	TAA	2	6	365814	365819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_004347	TA	3	6	365929	365934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004347	GTT	2	6	366094	366099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004347	TTA	2	6	366146	366151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_004347	CGG	2	6	366216	366221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_004347	TGC	2	6	366222	366227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_004347	TCG	2	6	366342	366347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_004347	CTAT	2	8	366350	366357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_004347	TTA	2	6	366370	366375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_004347	TGG	2	6	366402	366407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_004347	CTT	2	6	366437	366442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_004347	CTG	2	6	366445	366450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_004347	A	6	6	366467	366472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004347	CTG	2	6	366539	366544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004347	CT	3	6	366648	366653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_004347	CAT	2	6	366724	366729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_004347	TTG	2	6	366755	366760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004347	ATT	2	6	366761	366766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004347	AAG	2	6	366769	366774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004347	TA	3	6	366785	366790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_004347	CAGT	2	8	366805	366812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_004347	TGA	2	6	366818	366823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004347	ACC	2	6	366993	366998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_004347	GGTC	2	8	367005	367012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_004347	AT	3	6	367017	367022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_004347	GCG	2	6	367034	367039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_004347	AGG	2	6	367043	367048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004347	CTTG	2	8	367155	367162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_004347	TTCC	2	8	367253	367260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_004347	GGT	2	6	367261	367266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_004347	TCTG	2	8	367329	367336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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