MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004347	ATG	2	6	1917335	1917340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_004347	AAGT	2	8	1917432	1917439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_004347	TTGG	2	8	1917489	1917496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_004347	ATT	2	6	1922465	1922470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_004347	GAT	2	6	1924938	1924943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_004347	TTAA	2	8	1924974	1924981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_004347	ACATCC	2	12	1925002	1925013	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_004347	T	6	6	1925476	1925481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_004347	GCT	2	6	1926825	1926830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_004347	T	7	7	1926830	1926836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_004347	TGC	2	6	1927429	1927434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_004347	T	6	6	1928159	1928164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_004347	CTCGA	2	10	1928177	1928186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6014	NC_004347	ACA	2	6	1928199	1928204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_004347	ATA	2	6	1928258	1928263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_004347	GAG	2	6	1928470	1928475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_004347	CAT	2	6	1928493	1928498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_004347	TGG	2	6	1928513	1928518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_004347	TGA	2	6	1928534	1928539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_004347	TTA	2	6	1928547	1928552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_004347	AGG	2	6	1928591	1928596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_004347	T	6	6	1928656	1928661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_004347	GTAT	2	8	1928815	1928822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_004347	T	7	7	1928836	1928842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_004347	ATT	2	6	1928852	1928857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_004347	TCA	2	6	1929739	1929744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_004347	AATT	2	8	1929785	1929792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_004347	TG	3	6	1929823	1929828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_004347	CA	3	6	1930971	1930976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_004347	TGC	2	6	1931116	1931121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_004347	T	6	6	1931151	1931156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_004347	G	7	7	1931179	1931185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_004347	TTAGGA	2	12	1931212	1931223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_004347	GGA	2	6	1931239	1931244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_004347	T	6	6	1931256	1931261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_004347	GTTTGC	2	12	1931268	1931279	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6037	NC_004347	TTGG	2	8	1931306	1931313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_004347	CTG	2	6	1931380	1931385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_004347	GCTT	2	8	1931443	1931450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_004347	GTT	2	6	1931496	1931501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_004347	GTG	2	6	1931518	1931523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_004347	TTA	2	6	1931524	1931529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_004347	GCC	2	6	1931584	1931589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_004347	GCT	2	6	1931592	1931597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_004347	GAG	2	6	1931644	1931649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_004347	CCAT	2	8	1931684	1931691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_004347	TGT	2	6	1931774	1931779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_004347	TAT	3	9	1931932	1931940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_004347	GCT	3	9	1931991	1931999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_004347	AGCA	2	8	1932065	1932072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_004347	TTG	2	6	1932643	1932648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_004347	CTC	2	6	1932734	1932739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_004347	AATCT	2	10	1932773	1932782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6054	NC_004347	T	7	7	1932839	1932845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_004347	TCAATA	2	12	1932961	1932972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6056	NC_004347	CTTT	2	8	1935858	1935865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_004347	T	6	6	1935892	1935897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_004347	GAGC	2	8	1936000	1936007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_004347	TGA	2	6	1936496	1936501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_004347	AAAT	2	8	1938762	1938769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_004347	AGG	2	6	1938781	1938786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_004347	AAAT	2	8	1938820	1938827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_004347	TTG	2	6	1939223	1939228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_004347	GGC	2	6	1939229	1939234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_004347	TCAAG	2	10	1939458	1939467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_004347	A	7	7	1939483	1939489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_004347	CGA	2	6	1939552	1939557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_004347	CGA	2	6	1939589	1939594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_004347	A	7	7	1939633	1939639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_004347	CGA	2	6	1939702	1939707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_004347	CGA	2	6	1939739	1939744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_004347	A	7	7	1939783	1939789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_004347	CGA	2	6	1939852	1939857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_004347	TGT	2	6	1939866	1939871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_004347	A	8	8	1939933	1939940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_004347	CGA	2	6	1940003	1940008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_004347	CGA	2	6	1940026	1940031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_004347	TGC	2	6	1940039	1940044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_004347	CTG	2	6	1940067	1940072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_004347	GTT	2	6	1940142	1940147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_004347	CGA	2	6	1940164	1940169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_004347	CTTT	2	8	1940173	1940180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_004347	CGA	2	6	1940227	1940232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_004347	CGA	2	6	1940250	1940255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_004347	TGC	2	6	1940263	1940268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_004347	CGA	2	6	1940351	1940356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_004347	GTT	2	6	1940365	1940370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_004347	T	6	6	1940401	1940406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_004347	CGA	2	6	1940474	1940479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_004347	TGC	2	6	1940487	1940492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_004347	CGA	2	6	1940588	1940593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_004347	TGC	2	6	1940601	1940606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_004347	CGTC	2	8	1940616	1940623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_004347	AGG	2	6	1940667	1940672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_004347	A	7	7	1940679	1940685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_004347	ATT	2	6	1940730	1940735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_004347	TAA	2	6	1940801	1940806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_004347	AAT	2	6	1945170	1945175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_004347	A	6	6	1947051	1947056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_004347	T	8	8	1947076	1947083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_004347	TAA	2	6	1947103	1947108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_004347	T	6	6	1947129	1947134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_004347	ACAG	2	8	1947422	1947429	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_004347	GCA	2	6	1947436	1947441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_004347	TAC	2	6	1948021	1948026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_004347	AAC	2	6	1948070	1948075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_004347	TACCA	2	10	1949856	1949865	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6108	NC_004347	ATC	2	6	1949951	1949956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_004347	GAT	2	6	1950016	1950021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_004347	TAT	2	6	1950027	1950032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_004347	GCG	2	6	1950035	1950040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_004347	CCCA	2	8	1950101	1950108	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6113	NC_004347	CTC	2	6	1950124	1950129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_004347	ATG	2	6	1950159	1950164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_004347	ATG	2	6	1950249	1950254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_004347	T	6	6	1950257	1950262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_004347	ATG	2	6	1950429	1950434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_004347	T	6	6	1950437	1950442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_004347	ATG	2	6	1950519	1950524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_004347	TTTG	2	8	1950530	1950537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_004347	ATG	2	6	1950609	1950614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_004347	T	6	6	1950617	1950622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_004347	CTC	2	6	1950664	1950669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_004347	GAA	2	6	1950804	1950809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_004347	CTT	2	6	1950847	1950852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_004347	CAT	2	6	1950871	1950876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_004347	CT	3	6	1951004	1951009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_004347	CAAT	2	8	1951047	1951054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6130	NC_004347	TAT	2	6	1951099	1951104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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