MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004337	ACT	2	6	1078266	1078271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_004337	T	6	6	1078305	1078310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_004337	T	6	6	1079371	1079376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_004337	CTG	2	6	1079441	1079446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_004337	TG	3	6	1079445	1079450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_004337	TAA	2	6	1079454	1079459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_004337	TTA	2	6	1079594	1079599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_004337	A	6	6	1079651	1079656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_004337	TAA	2	6	1079680	1079685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_004337	A	6	6	1079693	1079698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_004337	GTTTTT	2	12	1079731	1079742	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_004337	T	7	7	1079764	1079770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_004337	GCA	2	6	1079817	1079822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_004337	AAG	2	6	1079836	1079841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_004337	T	6	6	1079900	1079905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004337	A	7	7	1079954	1079960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_004337	CG	3	6	1079972	1079977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_004337	TTA	2	6	1079984	1079989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_004337	AAC	2	6	1080052	1080057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_004337	AATC	2	8	1080584	1080591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4022	NC_004337	GCA	2	6	1080634	1080639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_004337	GTT	2	6	1080670	1080675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_004337	CGG	4	12	1080684	1080695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_004337	GGT	2	6	1080703	1080708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4027	NC_004337	ACA	2	6	1081096	1081101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_004337	TGACT	2	10	1081949	1081958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4029	NC_004337	GGT	2	6	1081974	1081979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_004337	GGT	2	6	1082106	1082111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_004337	TGC	2	6	1082120	1082125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_004337	CTC	2	6	1082147	1082152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4034	NC_004337	TCA	2	6	1082195	1082200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_004337	CAT	2	6	1082210	1082215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_004337	T	8	8	1082246	1082253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4039	NC_004337	GA	3	6	1082631	1082636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4042	NC_004337	CTG	2	6	1083084	1083089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_004337	AAG	2	6	1083104	1083109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_004337	AGG	2	6	1083115	1083120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_004337	TTG	2	6	1086305	1086310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4048	NC_004337	GATCG	2	10	1086577	1086586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4049	NC_004337	CA	3	6	1086594	1086599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_004337	AAC	2	6	1090823	1090828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_004337	CAGT	2	8	1090864	1090871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_004337	ACTG	2	8	1090878	1090885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_004337	TCGA	2	8	1090936	1090943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_004337	A	7	7	1090969	1090975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_004337	TCAA	2	8	1094237	1094244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4088	NC_004337	GAA	2	6	1094299	1094304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_004337	TA	3	6	1094313	1094318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_004337	ATC	2	6	1094423	1094428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_004337	TTCTGC	2	12	1094456	1094467	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4095	NC_004337	TG	3	6	1094682	1094687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_004337	ATAC	2	8	1094698	1094705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4099	NC_004337	CCAC	2	8	1094899	1094906	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4100	NC_004337	T	6	6	1094990	1094995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_004337	AAC	2	6	1095075	1095080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_004337	TCTT	2	8	1095137	1095144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_004337	GAT	2	6	1095186	1095191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4105	NC_004337	GAT	2	6	1095761	1095766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4108	NC_004337	AAGG	2	8	1095899	1095906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_004337	ACCA	2	8	1099036	1099043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_004337	ACCAC	2	10	1099046	1099055	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4111	NC_004337	CATTA	2	10	1099081	1099090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4112	NC_004337	CAT	2	6	1099132	1099137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_004337	AT	3	6	1099318	1099323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_004337	CTG	2	6	1099749	1099754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4117	NC_004337	GTT	2	6	1099957	1099962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_004337	TTAC	2	8	1100145	1100152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_004337	TCA	2	6	1100187	1100192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_004337	GTAT	2	8	1100332	1100339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_004337	AC	3	6	1100349	1100354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_004337	GTGG	2	8	1100512	1100519	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_004337	CGA	2	6	1100534	1100539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4125	NC_004337	TTA	2	6	1100587	1100592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004337	GAT	2	6	1100609	1100614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_004337	CCA	2	6	1100813	1100818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_004337	TAG	2	6	1100826	1100831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_004337	TCCT	2	8	1100876	1100883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_004337	ACA	2	6	1101230	1101235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_004337	ATG	2	6	1103042	1103047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_004337	GCT	2	6	1103119	1103124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_004337	AAG	2	6	1103139	1103144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_004337	GGC	2	6	1103162	1103167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_004337	CGA	2	6	1103194	1103199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4137	NC_004337	AAG	2	6	1103286	1103291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_004337	AG	3	6	1103341	1103346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_004337	TGTA	2	8	1104373	1104380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4145	NC_004337	GAAT	2	8	1106853	1106860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_004337	AAT	2	6	1106991	1106996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_004337	ATG	2	6	1107219	1107224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_004337	GTCAT	2	10	1108448	1108457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4162	NC_004337	ATT	2	6	1108909	1108914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_004337	GGC	2	6	1126939	1126944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4258	NC_004337	CTG	2	6	1127452	1127457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4260	NC_004337	AGTG	2	8	1127523	1127530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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