MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_004337	CAG	2	6	789507	789512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_004337	AGA	2	6	789515	789520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_004337	CTC	2	6	789545	789550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_004337	GGA	2	6	789646	789651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_004337	T	6	6	789687	789692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_004337	GCG	2	6	789700	789705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_004337	TAA	2	6	789742	789747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_004337	TGT	2	6	791183	791188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_004337	GTG	2	6	791199	791204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_004337	AAT	2	6	791207	791212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_004337	TAAT	2	8	791224	791231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_004337	G	6	6	791276	791281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_004337	T	6	6	792076	792081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_004337	AT	3	6	792116	792121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_004337	A	6	6	792123	792128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_004337	ATT	2	6	792265	792270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_004337	TGA	2	6	792283	792288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_004337	A	6	6	792288	792293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_004337	TG	3	6	792312	792317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_004337	ATG	2	6	792318	792323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_004337	A	6	6	792331	792336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_004337	GATG	2	8	792362	792369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_004337	CAAAA	2	10	792398	792407	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_004337	CCT	2	6	792411	792416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_004337	TAA	2	6	793100	793105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_004337	AT	3	6	793122	793127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_004337	TTAT	2	8	793143	793150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_004337	AATA	2	8	793172	793179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_004337	AT	3	6	793197	793202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_004337	A	6	6	794239	794244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_004337	AAT	2	6	794306	794311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_004337	ATGA	2	8	794316	794323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_004337	AT	3	6	794466	794471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_004337	GGT	2	6	794505	794510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_004337	AAG	2	6	796778	796783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_004337	GCC	2	6	796793	796798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_004337	ACT	2	6	796809	796814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_004337	T	7	7	796863	796869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_004337	GCG	2	6	796911	796916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_004337	CCT	2	6	797063	797068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_004337	GAT	2	6	797097	797102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_004337	TACA	2	8	797108	797115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_004337	TATAT	2	10	797130	797139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_004337	T	6	6	797160	797165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_004337	TATG	2	8	797213	797220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_004337	A	6	6	798839	798844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_004337	T	6	6	799918	799923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_004337	GAG	2	6	799952	799957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_004337	TCT	2	6	799963	799968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_004337	GAC	2	6	801648	801653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_004337	TGA	2	6	801657	801662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_004337	AT	3	6	801717	801722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_004337	CGC	2	6	801761	801766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_004337	ACC	2	6	803123	803128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_004337	TGATG	2	10	803211	803220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_004337	AAG	2	6	803234	803239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_004337	AG	3	6	803266	803271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_004337	TAA	2	6	804127	804132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_004337	TGA	2	6	804184	804189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_004337	CGC	2	6	804212	804217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_004337	TGA	2	6	808393	808398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_004337	TGCC	2	8	808417	808424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_004337	CGC	2	6	808471	808476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_004337	TAT	2	6	810563	810568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_004337	ATT	2	6	817008	817013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004337	CTG	2	6	817038	817043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_004337	GCA	2	6	817078	817083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_004337	ATTTT	2	10	817175	817184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_004337	GCA	2	6	817190	817195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3072	NC_004337	CG	3	6	817247	817252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_004337	TATT	2	8	817352	817359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_004337	A	6	6	817360	817365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_004337	GTT	2	6	817490	817495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_004337	ATC	2	6	817497	817502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3082	NC_004337	A	6	6	817649	817654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_004337	TAT	2	6	817952	817957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_004337	TGG	2	6	818031	818036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_004337	ATC	2	6	818327	818332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3102	NC_004337	CAG	2	6	818536	818541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_004337	AAACTG	2	12	818624	818635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3104	NC_004337	TGA	2	6	818683	818688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_004337	AGA	2	6	818707	818712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_004337	ATT	2	6	818924	818929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_004337	GAT	2	6	818981	818986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_004337	ACC	2	6	819050	819055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_004337	GAAA	2	8	819061	819068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_004337	AAC	2	6	819153	819158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_004337	TGA	2	6	819187	819192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_004337	ATT	2	6	819308	819313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_004337	AG	3	6	819361	819366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_004337	GC	3	6	819377	819382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_004337	AATT	2	8	819384	819391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_004337	AGT	2	6	819480	819485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_004337	ATT	2	6	820823	820828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_004337	A	6	6	822198	822203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_004337	CAGGG	2	10	822224	822233	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3120	NC_004337	GAA	2	6	822320	822325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_004337	A	6	6	822350	822355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_004337	CAA	2	6	822375	822380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_004337	AGG	2	6	822391	822396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3125	NC_004337	TGA	2	6	823856	823861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_004337	AGA	2	6	823884	823889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_004337	TTAT	2	8	823950	823957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_004337	CGA	2	6	823968	823973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_004337	A	7	7	824720	824726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_004337	AGC	2	6	824737	824742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_004337	TG	4	8	824803	824810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_004337	TTA	2	6	824813	824818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_004337	T	7	7	824852	824858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_004337	ACA	2	6	826222	826227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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