MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004337	ACA	2	6	316363	316368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_004337	CAG	2	6	317295	317300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_004337	CAA	2	6	317326	317331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_004337	GGCA	2	8	317356	317363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_004337	GCTG	2	8	317406	317413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_004337	TC	3	6	317427	317432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_004337	GGA	2	6	317453	317458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004337	ATA	2	6	317628	317633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004337	CAC	2	6	317724	317729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_004337	TCA	2	6	317788	317793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_004337	GAT	2	6	317825	317830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004337	ATTT	2	8	320622	320629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004337	ATT	2	6	320630	320635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_004337	ATA	2	6	320665	320670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004337	CA	3	6	320671	320676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_004337	TA	3	6	320745	320750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004337	A	6	6	320785	320790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004337	TCC	2	6	320963	320968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_004337	TCT	2	6	322251	322256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_004337	CTGGT	2	10	322293	322302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_004337	CAA	2	6	322423	322428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_004337	GGT	2	6	322492	322497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_004337	TA	3	6	322516	322521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004337	ATA	2	6	322537	322542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_004337	TAA	2	6	322565	322570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004337	CA	3	6	322616	322621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_004337	AATT	2	8	323704	323711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004337	AT	3	6	323726	323731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_004337	TTTC	2	8	323787	323794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_004337	GAAA	2	8	323876	323883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004337	TTA	2	6	323913	323918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_004337	GGT	2	6	323946	323951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_004337	AAC	2	6	323973	323978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_004337	TGA	2	6	323987	323992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_004337	ATT	2	6	324019	324024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_004337	C	6	6	324060	324065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1037	NC_004337	TAT	2	6	324107	324112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004337	CAA	2	6	324198	324203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_004337	TATG	2	8	324329	324336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004337	TAAA	2	8	324359	324366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_004337	TAT	2	6	324432	324437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_004337	CAA	2	6	324440	324445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_004337	TTG	2	6	326408	326413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004337	AGGA	2	8	326761	326768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004337	GAAA	2	8	326908	326915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_004337	ATA	2	6	328102	328107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004337	AGCA	2	8	328169	328176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_004337	TGA	2	6	328202	328207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_004337	ATG	2	6	328228	328233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004337	AT	4	8	328239	328246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_004337	CA	3	6	328284	328289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_004337	AGA	2	6	328295	328300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004337	GT	3	6	328333	328338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004337	TCA	2	6	328351	328356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_004337	GCC	2	6	329614	329619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_004337	AT	3	6	329624	329629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004337	GCG	2	6	329641	329646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_004337	AACT	2	8	329764	329771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_004337	CTG	2	6	329821	329826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_004337	CAT	2	6	329848	329853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_004337	AC	3	6	329854	329859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_004337	TAC	2	6	329905	329910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_004337	TGAC	2	8	329938	329945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_004337	GTT	2	6	329973	329978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004337	AC	3	6	329988	329993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_004337	TAT	2	6	330214	330219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004337	C	7	7	330235	330241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1068	NC_004337	GTT	2	6	330263	330268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_004337	CAC	2	6	330316	330321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_004337	TTG	2	6	331238	331243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004337	TTCTGC	2	12	331631	331642	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_004337	TCG	2	6	331673	331678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_004337	CCAC	2	8	331693	331700	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_004337	TG	3	6	331857	331862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004337	ATAC	2	8	331873	331880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_004337	ATG	2	6	332019	332024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_004337	GTAA	2	8	332060	332067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_004337	CCAC	2	8	332074	332081	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1079	NC_004337	AAC	2	6	332250	332255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_004337	TCTT	2	8	332312	332319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_004337	GAT	2	6	332361	332366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_004337	CAG	2	6	332458	332463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_004337	TAT	2	6	335474	335479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_004337	T	6	6	335548	335553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_004337	GAA	2	6	336214	336219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_004337	TAA	2	6	336493	336498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004337	CTG	2	6	336567	336572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_004337	AAGT	2	8	336598	336605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_004337	CAG	2	6	336608	336613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_004337	ACG	2	6	336641	336646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_004337	CAGC	2	8	337359	337366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_004337	CT	3	6	337750	337755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_004337	ATA	3	9	337763	337771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_004337	TGC	2	6	337779	337784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_004337	T	6	6	337787	337792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004337	AT	3	6	337802	337807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004337	TCA	2	6	337815	337820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_004337	T	6	6	337856	337861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004337	GAT	2	6	337892	337897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004337	TGG	2	6	337901	337906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004337	CAT	2	6	340688	340693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_004337	CGC	2	6	340770	340775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_004337	ACC	2	6	341993	341998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_004337	ACC	2	6	342005	342010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_004337	CTG	2	6	342107	342112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_004337	T	6	6	346520	346525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_004337	CGA	2	6	346561	346566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_004337	TATT	2	8	346627	346634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004337	ACA	2	6	346635	346640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_004337	AGCC	2	8	348721	348728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_004337	T	6	6	348790	348795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004337	TGGT	2	8	348843	348850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004337	TA	3	6	348864	348869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_004337	CCT	2	6	348887	348892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_004337	ACTG	2	8	348941	348948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_004337	TTC	2	6	348975	348980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_004337	ATC	2	6	349034	349039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_004337	ACA	2	6	349069	349074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_004337	T	6	6	350464	350469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004337	AGG	2	6	351892	351897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004337	TCC	3	9	351936	351944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_004337	GAT	2	6	351960	351965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004337	TCA	2	6	352006	352011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_004337	TG	3	6	353855	353860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004337	CAT	2	6	353871	353876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_004337	GCG	2	6	353967	353972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_004337	TCA	2	6	354095	354100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_004337	GAAA	2	8	354169	354176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_004337	GTCA	2	8	354267	354274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_004337	GCCA	2	8	354295	354302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_004337	TTC	2	6	354322	354327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_004337	A	6	6	354407	354412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004337	G	6	6	354437	354442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004337	AGA	2	6	360007	360012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_004337	T	8	8	360019	360026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_004337	AT	3	6	360507	360512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_004337	CGC	2	6	360551	360556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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