MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004337	TGC	2	6	172334	172339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_004337	GACC	2	8	172359	172366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
503	NC_004337	GAA	2	6	172496	172501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004337	TCA	2	6	174045	174050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004337	TACGT	2	10	174076	174085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
506	NC_004337	GGA	2	6	174113	174118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004337	TGGC	3	12	174123	174134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_004337	CAT	2	6	174181	174186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_004337	GCG	2	6	174234	174239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_004337	GTC	2	6	174299	174304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_004337	ATG	2	6	174461	174466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004337	TTG	2	6	174491	174496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004337	GAA	2	6	174518	174523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_004337	TGA	2	6	174528	174533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004337	GATC	2	8	174591	174598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_004337	TCAA	2	8	174599	174606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_004337	GTG	2	6	174613	174618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004337	TTG	2	6	174623	174628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004337	ACA	2	6	174675	174680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004337	TAA	2	6	174711	174716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004337	TGG	2	6	174719	174724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004337	TGG	2	6	174746	174751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004337	AGA	2	6	174792	174797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004337	AAC	2	6	174815	174820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_004337	ACG	2	6	174925	174930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_004337	TGG	3	9	174932	174940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004337	GCT	2	6	174965	174970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004337	TGC	2	6	175085	175090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_004337	GGC	2	6	175101	175106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_004337	GTT	2	6	175149	175154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_004337	TGA	2	6	175227	175232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004337	TGC	2	6	175238	175243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_004337	GGC	2	6	175297	175302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_004337	GCCC	2	8	175807	175814	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
535	NC_004337	TTC	2	6	175843	175848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_004337	A	6	6	175875	175880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004337	GGAT	2	8	175911	175918	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_004337	A	6	6	175981	175986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004337	GAA	2	6	175994	175999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004337	ATT	2	6	176012	176017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004337	GCA	2	6	176038	176043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_004337	TGC	2	6	176047	176052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004337	A	6	6	179628	179633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004337	AT	4	8	180484	180491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004337	CAA	2	6	180611	180616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_004337	ACG	2	6	180629	180634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_004337	GC	3	6	180650	180655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_004337	AAC	2	6	180716	180721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_004337	AC	4	8	180720	180727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_004337	TA	3	6	180800	180805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004337	GGC	2	6	181586	181591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_004337	GAGC	2	8	181637	181644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_004337	GCG	2	6	181660	181665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_004337	GTA	2	6	181700	181705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004337	GCC	2	6	182666	182671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_004337	CTT	2	6	182681	182686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_004337	GAAA	2	8	182790	182797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004337	ATAA	2	8	183537	183544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004337	TTG	2	6	183599	183604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004337	GC	3	6	183626	183631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_004337	AAATA	2	10	183692	183701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004337	TAA	2	6	183705	183710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004337	TG	4	8	183766	183773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004337	GTCTG	2	10	183777	183786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
565	NC_004337	CGC	2	6	184392	184397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_004337	GGC	2	6	184422	184427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_004337	AG	3	6	185677	185682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004337	AGT	2	6	185739	185744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004337	T	8	8	185784	185791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004337	A	6	6	185838	185843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004337	CGT	2	6	186662	186667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_004337	GTT	2	6	186677	186682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004337	GCC	2	6	186689	186694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_004337	TGG	2	6	186718	186723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004337	AGTT	2	8	188844	188851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004337	GAA	2	6	188854	188859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004337	ATA	2	6	188863	188868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004337	GTAGTG	2	12	191324	191335	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004337	TTA	2	6	193005	193010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004337	T	6	6	200563	200568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_004337	AAGG	2	8	200597	200604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_004337	AGG	2	6	200612	200617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004337	CGC	2	6	203221	203226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_004337	CCT	2	6	205209	205214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_004337	AAAC	2	8	206939	206946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_004337	TGCGC	2	10	206961	206970	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
587	NC_004337	CGC	2	6	207041	207046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_004337	GGCT	2	8	207067	207074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_004337	A	6	6	207919	207924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004337	A	7	7	209726	209732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_004337	CTT	2	6	211835	211840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_004337	ATT	2	6	211843	211848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004337	TGT	2	6	211851	211856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004337	ATT	2	6	213545	213550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004337	TAT	2	6	213551	213556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004337	ATCA	2	8	213643	213650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
597	NC_004337	TTA	2	6	213710	213715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004337	CGG	2	6	214389	214394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_004337	CA	3	6	214408	214413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_004337	CGGTT	2	10	214420	214429	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
601	NC_004337	A	6	6	214436	214441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_004337	TG	3	6	214552	214557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004337	GGC	2	6	214706	214711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_004337	TGC	2	6	214752	214757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004337	ACT	2	6	214819	214824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_004337	TTG	2	6	214916	214921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004337	CGA	2	6	214944	214949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_004337	GCA	2	6	215018	215023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004337	GAA	2	6	215077	215082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004337	GGA	2	6	215113	215118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_004337	AGA	2	6	215160	215165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_004337	CAG	2	6	215186	215191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004337	G	6	6	215333	215338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004337	GGA	2	6	215377	215382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004337	GAA	2	6	215640	215645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004337	TGC	2	6	215716	215721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_004337	GTC	2	6	215728	215733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_004337	TTG	2	6	215789	215794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004337	CCGG	2	8	215803	215810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_004337	GGA	2	6	215841	215846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004337	TCA	2	6	215866	215871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_004337	AC	3	6	215892	215897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_004337	CGT	2	6	215960	215965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_004337	AC	3	6	216061	216066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_004337	GTAG	2	8	216102	216109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004337	CCT	2	6	216202	216207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_004337	AAG	2	6	216215	216220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004337	CA	3	6	216237	216242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_004337	TGA	2	6	216250	216255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_004337	GGT	2	6	216292	216297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_004337	GGT	2	6	216327	216332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004337	AGG	2	6	216437	216442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004337	CCA	2	6	216467	216472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_004337	TAAA	2	8	216486	216493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004337	A	6	6	216491	216496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004337	AAC	2	6	216578	216583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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638	NC_004337	TC	3	6	216600	216605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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