MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004337	ACC	2	6	1505738	1505743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_004337	TCCA	2	8	1505755	1505762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_004337	CCA	2	6	1505796	1505801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_004337	C	6	6	1505856	1505861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6005	NC_004337	CAG	2	6	1505872	1505877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_004337	TGA	2	6	1505928	1505933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_004337	TCG	2	6	1505949	1505954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_004337	CAG	2	6	1505974	1505979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_004337	CA	4	8	1505983	1505990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_004337	A	6	6	1506008	1506013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_004337	TAA	2	6	1506034	1506039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_004337	GCC	2	6	1506084	1506089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_004337	GGC	2	6	1506107	1506112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_004337	CAG	3	9	1506125	1506133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_004337	TTG	2	6	1506155	1506160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_004337	AAT	2	6	1506230	1506235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_004337	CAA	2	6	1506265	1506270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_004337	CTG	2	6	1506325	1506330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_004337	CAG	2	6	1506370	1506375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_004337	CTTT	2	8	1506383	1506390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_004337	AGC	2	6	1506463	1506468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_004337	AGC	2	6	1506484	1506489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_004337	TGG	2	6	1506497	1506502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_004337	AGC	2	6	1506526	1506531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_004337	CAG	2	6	1506591	1506596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_004337	CAA	2	6	1506603	1506608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_004337	CCG	2	6	1506617	1506622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_004337	CCA	2	6	1506761	1506766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_004337	TGCG	2	8	1506839	1506846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_004337	CGG	2	6	1506860	1506865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_004337	CGC	2	6	1507013	1507018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_004337	ATC	2	6	1507068	1507073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_004337	CGC	2	6	1507114	1507119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_004337	T	6	6	1507126	1507131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_004337	CAG	2	6	1507184	1507189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_004337	CATC	2	8	1507192	1507199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_004337	CG	3	6	1507200	1507205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_004337	TCCTT	2	10	1507221	1507230	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6039	NC_004337	CTT	2	6	1507312	1507317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_004337	GCG	2	6	1507323	1507328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_004337	GCG	2	6	1507444	1507449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_004337	TGG	2	6	1507454	1507459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_004337	CGG	2	6	1507476	1507481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_004337	GCC	2	6	1507502	1507507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_004337	TG	3	6	1507563	1507568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_004337	TAA	2	6	1507613	1507618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_004337	GCC	2	6	1509115	1509120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_004337	GCA	2	6	1509134	1509139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_004337	CGC	2	6	1509225	1509230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_004337	CGC	2	6	1509264	1509269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_004337	ACC	2	6	1509372	1509377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_004337	CCT	2	6	1509395	1509400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_004337	CAT	2	6	1509552	1509557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_004337	TTC	2	6	1509610	1509615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_004337	GCC	2	6	1509636	1509641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_004337	CAG	2	6	1509655	1509660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_004337	TGC	2	6	1509669	1509674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_004337	CA	3	6	1509720	1509725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_004337	GC	4	8	1509742	1509749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_004337	CCAC	2	8	1509799	1509806	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6061	NC_004337	CCA	2	6	1509846	1509851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_004337	CGA	2	6	1509883	1509888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_004337	GCG	2	6	1509932	1509937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_004337	ATA	2	6	1512087	1512092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_004337	GGCA	2	8	1512141	1512148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_004337	TTG	2	6	1512168	1512173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_004337	GCT	2	6	1512219	1512224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_004337	TGT	2	6	1513101	1513106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_004337	GTT	2	6	1513125	1513130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_004337	ATG	2	6	1513132	1513137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_004337	A	6	6	1513151	1513156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_004337	GC	3	6	1513171	1513176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_004337	T	6	6	1513263	1513268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_004337	TGGTT	2	10	1513328	1513337	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_004337	CCG	2	6	1513364	1513369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_004337	CTGG	2	8	1513387	1513394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_004337	ATT	2	6	1513458	1513463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_004337	TGA	2	6	1513509	1513514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_004337	GAT	2	6	1513518	1513523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_004337	CAG	2	6	1513585	1513590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_004337	GAAC	2	8	1513671	1513678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_004337	A	6	6	1513741	1513746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_004337	TCT	2	6	1513775	1513780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_004337	GCG	2	6	1513810	1513815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_004337	CAGC	2	8	1513930	1513937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6086	NC_004337	CGG	2	6	1513964	1513969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6089	NC_004337	GAC	2	6	1514020	1514025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_004337	GTG	2	6	1514071	1514076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_004337	CCAG	2	8	1514077	1514084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_004337	TG	3	6	1514114	1514119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_004337	TGA	2	6	1514145	1514150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6095	NC_004337	GCG	2	6	1514243	1514248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_004337	CGGT	2	8	1514255	1514262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_004337	GTT	2	6	1514265	1514270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_004337	TGA	2	6	1514294	1514299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_004337	CAC	2	6	1514316	1514321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_004337	CGG	2	6	1514345	1514350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_004337	TCA	2	6	1514372	1514377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6103	NC_004337	TTG	2	6	1514423	1514428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_004337	TTG	2	6	1514488	1514493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_004337	TC	3	6	1514540	1514545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_004337	GCG	2	6	1514551	1514556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_004337	GTG	2	6	1514593	1514598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6109	NC_004337	GAC	2	6	1514637	1514642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_004337	GCT	2	6	1514662	1514667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_004337	TCA	2	6	1514692	1514697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_004337	GGT	2	6	1517193	1517198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_004337	CAT	2	6	1517247	1517252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6115	NC_004337	CCG	2	6	1517388	1517393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_004337	TGC	2	6	1517416	1517421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_004337	TGA	2	6	1517717	1517722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_004337	GGC	2	6	1517726	1517731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_004337	CGG	2	6	1517747	1517752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_004337	GAA	2	6	1517796	1517801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_004337	CCA	2	6	1517987	1517992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_004337	TCGC	2	8	1518001	1518008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_004337	GAT	2	6	1518128	1518133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_004337	ATG	2	6	1518140	1518145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_004337	TGC	2	6	1518150	1518155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6127	NC_004337	GGT	2	6	1518298	1518303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6129	NC_004337	CGG	2	6	1518336	1518341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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