MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004337	T	6	6	1178054	1178059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_004337	GA	3	6	1178072	1178077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_004337	CGC	2	6	1178110	1178115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_004337	ACG	2	6	1178156	1178161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_004337	T	6	6	1180459	1180464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_004337	T	7	7	1180541	1180547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_004337	CT	3	6	1180569	1180574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_004337	AGC	2	6	1180650	1180655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_004337	AAAT	2	8	1180739	1180746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_004337	ACGG	2	8	1181062	1181069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_004337	TGG	2	6	1181106	1181111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_004337	CAT	2	6	1181143	1181148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_004337	TG	3	6	1181157	1181162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_004337	A	6	6	1181278	1181283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_004337	TGG	2	6	1181368	1181373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_004337	AGC	2	6	1181394	1181399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_004337	GCC	2	6	1181414	1181419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_004337	ACCAC	2	10	1181509	1181518	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4519	NC_004337	T	7	7	1181538	1181544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_004337	T	6	6	1181910	1181915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_004337	ATT	2	6	1181920	1181925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_004337	GTT	2	6	1181934	1181939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_004337	GTT	2	6	1181944	1181949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_004337	ATT	2	6	1181990	1181995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_004337	GTG	2	6	1182003	1182008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_004337	CTTA	2	8	1182140	1182147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_004337	T	7	7	1182158	1182164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_004337	AAT	2	6	1182173	1182178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_004337	CAG	2	6	1182189	1182194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_004337	GCA	2	6	1182358	1182363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_004337	AGC	2	6	1182375	1182380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_004337	TGG	2	6	1182461	1182466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_004337	CTGAA	2	10	1182481	1182490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4534	NC_004337	CCA	2	6	1182523	1182528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_004337	GAA	2	6	1182548	1182553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_004337	CAG	2	6	1182557	1182562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_004337	AGC	2	6	1182574	1182579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_004337	CAC	2	6	1182701	1182706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_004337	GAA	2	6	1182786	1182791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_004337	A	6	6	1182819	1182824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_004337	T	6	6	1182833	1182838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_004337	AGA	2	6	1182856	1182861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_004337	A	6	6	1182966	1182971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_004337	ACG	2	6	1183005	1183010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_004337	GAA	2	6	1183031	1183036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_004337	TAC	2	6	1183167	1183172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_004337	TTG	2	6	1183174	1183179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_004337	TCA	2	6	1183231	1183236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_004337	GTG	2	6	1183269	1183274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_004337	GAC	2	6	1183311	1183316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_004337	G	6	6	1186401	1186406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_004337	GAT	2	6	1186440	1186445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_004337	AGA	2	6	1186770	1186775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_004337	CAG	2	6	1188415	1188420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_004337	AAAGC	2	10	1188716	1188725	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4556	NC_004337	CAG	2	6	1188771	1188776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_004337	AT	3	6	1188783	1188788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_004337	ACC	3	9	1188938	1188946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_004337	AC	3	6	1188976	1188981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_004337	T	6	6	1189059	1189064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_004337	ATC	2	6	1189139	1189144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_004337	TGG	2	6	1189170	1189175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_004337	ATC	2	6	1189193	1189198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_004337	CCA	2	6	1189226	1189231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_004337	A	8	8	1189253	1189260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_004337	GTT	2	6	1189376	1189381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_004337	ATT	2	6	1191652	1191657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_004337	TAAA	2	8	1191699	1191706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_004337	GGGGA	2	10	1191712	1191721	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_004337	A	6	6	1191731	1191736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_004337	TAA	2	6	1191754	1191759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_004337	ATA	2	6	1193844	1193849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_004337	TAA	2	6	1196143	1196148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_004337	GTA	2	6	1196179	1196184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_004337	A	6	6	1196212	1196217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_004337	GTG	2	6	1196263	1196268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_004337	GTT	2	6	1197601	1197606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_004337	TTAT	2	8	1197607	1197614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_004337	ATT	2	6	1197621	1197626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_004337	TGT	2	6	1197764	1197769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_004337	TCAGAT	2	12	1197771	1197782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4582	NC_004337	GCCA	2	8	1197858	1197865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_004337	AGA	2	6	1197895	1197900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_004337	TCC	2	6	1197950	1197955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_004337	CAGC	2	8	1197978	1197985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_004337	ATCAC	2	10	1198042	1198051	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4587	NC_004337	T	6	6	1198092	1198097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_004337	TGCG	2	8	1198135	1198142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4589	NC_004337	CAC	2	6	1198295	1198300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_004337	AGGA	2	8	1198318	1198325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_004337	ATGGAA	2	12	1198332	1198343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_004337	CAT	2	6	1198368	1198373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_004337	GCA	2	6	1198393	1198398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_004337	ATT	2	6	1200042	1200047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_004337	AAT	2	6	1200312	1200317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_004337	AAGGA	2	10	1200383	1200392	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_004337	ATT	2	6	1200393	1200398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_004337	GTT	2	6	1200432	1200437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_004337	TA	3	6	1200440	1200445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_004337	AAT	2	6	1200453	1200458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_004337	TAA	2	6	1200474	1200479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_004337	TTAT	2	8	1200570	1200577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_004337	TA	3	6	1200582	1200587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_004337	T	6	6	1200611	1200616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_004337	TTTTGT	2	12	1200621	1200632	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_004337	TGTT	2	8	1200683	1200690	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_004337	AATG	2	8	1200696	1200703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_004337	AAC	2	6	1200948	1200953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_004337	CCG	2	6	1203366	1203371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_004337	A	6	6	1203378	1203383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_004337	CGT	2	6	1203387	1203392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_004337	T	7	7	1204091	1204097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_004337	TAAG	2	8	1204120	1204127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_004337	CA	4	8	1204131	1204138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_004337	CGCT	2	8	1204178	1204185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_004337	ATT	2	6	1204186	1204191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_004337	TGA	2	6	1204218	1204223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_004337	T	6	6	1204235	1204240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_004337	AAT	2	6	1204252	1204257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_004337	ATTG	2	8	1204277	1204284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_004337	AAG	2	6	1204300	1204305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_004337	TGT	2	6	1204327	1204332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_004337	ATT	2	6	1204360	1204365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_004337	AGA	2	6	1204385	1204390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_004337	TCA	2	6	1204394	1204399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_004337	ATTTT	2	10	1204418	1204427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_004337	TAT	2	6	1204466	1204471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_004337	T	6	6	1204485	1204490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_004337	A	6	6	1204520	1204525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_004337	ATC	2	6	1204547	1204552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_004337	TCA	2	6	1204556	1204561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_004337	A	7	7	1205094	1205100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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