MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	ATGAAG	2	12	15989	16000	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004116	TAAGGA	2	12	17954	17965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004116	ACTAAT	2	12	21106	21117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_004116	TAAGGA	2	12	23785	23796	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004116	ACTAAT	2	12	26937	26948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_004116	ATTAAT	2	12	28565	28576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004116	ATCAAA	2	12	49786	49797	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_004116	TAAGGA	2	12	92762	92773	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004116	ACTAAT	2	12	95914	95925	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_004116	TTCGGG	2	12	97039	97050	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004116	TTAAAA	2	12	143377	143388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004116	TTAAAT	2	12	154788	154799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004116	TAAGGA	2	12	166791	166802	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004116	ACTAAT	2	12	169943	169954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004116	TAAACC	2	12	174518	174529	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004116	CTTGTT	2	12	179196	179207	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_004116	AAATAA	2	12	229041	229052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004116	TAAGGA	2	12	251918	251929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004116	ACTAAT	2	12	255070	255081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_004116	TTCGGG	2	12	255955	255966	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_004116	TAAGGA	2	12	350125	350136	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004116	ACTAAT	2	12	353277	353288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_004116	ATAGTT	2	12	366685	366696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004116	AAGTTT	2	12	400886	400897	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004116	TAAGGA	2	12	419269	419280	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004116	ACTAAT	2	12	422421	422432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_004116	GATTTT	2	12	451832	451843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004116	CTTTGA	2	12	464776	464787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004116	TTTATA	2	12	483827	483838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004116	ATAATG	2	12	519676	519687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004116	GAAGTA	2	12	534141	534152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004116	TATCGT	2	12	629449	629460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_004116	ATTACC	2	12	641304	641315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004116	CAAGCT	2	12	641815	641826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004116	TTTAAA	2	12	648097	648108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004116	TAAAAC	2	12	668584	668595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_004116	ATCTTA	2	12	680755	680766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_004116	AGGACT	2	12	787401	787412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004116	TTTTTA	2	12	826092	826103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004116	TTTAGT	2	12	826863	826874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004116	AAAACA	2	12	832044	832055	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_004116	AAAGAT	2	12	901984	901995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004116	TTGCTG	2	12	935468	935479	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004116	TAAAAA	2	12	941502	941513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004116	TTGCAT	2	12	941651	941662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_004116	ACAATA	2	12	963809	963820	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_004116	TTAAAA	2	12	965296	965307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004116	AAAAAT	2	12	990281	990292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004116	GTTTTG	2	12	1034210	1034221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004116	GCAATG	2	12	1034373	1034384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004116	TCATTT	2	12	1060925	1060936	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_004116	AATTAA	2	12	1096965	1096976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004116	ATTTTA	2	12	1121597	1121608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004116	CCCGAA	2	12	1154237	1154248	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_004116	TAACCT	2	12	1230154	1230165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004116	GATATT	2	12	1230266	1230277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004116	CTAGCT	2	12	1231074	1231085	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004116	AAAGCA	2	12	1231227	1231238	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004116	TTCCAT	2	12	1246082	1246093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004116	ACTGTT	2	12	1248126	1248137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_004116	CTGCTC	2	12	1248238	1248249	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004116	AGCATA	2	12	1248845	1248856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_004116	GTTTTT	2	12	1249942	1249953	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004116	TATCAT	2	12	1258250	1258261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_004116	AAATTA	2	12	1274973	1274984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004116	AAAGGA	2	12	1297980	1297991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004116	CCAAAA	2	12	1303377	1303388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004116	ATGTTT	2	12	1304824	1304835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004116	TTTTAT	2	12	1336071	1336082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004116	ATCATT	2	12	1362300	1362311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_004116	TTGCAA	2	12	1411898	1411909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_004116	TTTCTC	2	12	1470304	1470315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004116	TATCCA	2	12	1481839	1481850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004116	TTATCT	2	12	1482068	1482079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_004116	TCTCCT	2	12	1554723	1554734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004116	AAAAAT	2	12	1566718	1566729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004116	ATTTCA	2	12	1622188	1622199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_004116	TTTTAT	2	12	1684628	1684639	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004116	ATATTT	2	12	1696941	1696952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004116	ATAAAA	2	12	1696984	1696995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004116	ACTATT	2	12	1697449	1697460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_004116	AATATT	2	12	1697510	1697521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004116	TAATCA	2	12	1699202	1699213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004116	CTTTAT	2	12	1709425	1709436	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_004116	TTTCAT	2	12	1730140	1730151	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_004116	AAAAGT	2	12	1743852	1743863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004116	AAAAGT	2	12	1767042	1767053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004116	TTCAAT	2	12	1815851	1815862	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_004116	TTTTTG	2	12	1915870	1915881	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004116	AACTTG	2	12	1922315	1922326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_004116	GTTTTG	2	12	1986586	1986597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004116	GTTTTC	2	12	2007450	2007461	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_004116	TATTCT	2	12	2018595	2018606	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_004116	ATAGTT	2	12	2072533	2072544	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004116	TTCAAG	2	12	2072695	2072706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_004116	ACCATA	2	12	2074416	2074427	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004116	TAAAAA	2	12	2090731	2090742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004116	CAATTT	2	12	2095402	2095413	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_004116	TTTTTA	2	12	2099834	2099845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004116	TAAATT	2	12	2144052	2144063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004116	AATGTA	2	12	2144140	2144151	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004116	CTATAA	2	12	2157953	2157964	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.