MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	TTAT	2	8	4057	4064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004116	TTGA	2	8	4447	4454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004116	TAGA	2	8	10013	10020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004116	GTTA	2	8	16078	16085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004116	ACGA	2	8	16307	16314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004116	GTTA	2	8	16600	16607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004116	GTGA	2	8	16813	16820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004116	TAAC	2	8	16896	16903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004116	AGCG	2	8	16984	16991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004116	TGGT	2	8	17649	17656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004116	AGCC	2	8	17866	17873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004116	GTAA	2	8	18321	18328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004116	GAAG	2	8	18403	18410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004116	GCGA	2	8	18477	18484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004116	ATTC	2	8	19343	19350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_004116	CTAA	2	8	19699	19706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004116	TAGG	2	8	20354	20361	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004116	ACGA	2	8	22139	22146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004116	GTTA	2	8	22431	22438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004116	GTGA	2	8	22644	22651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004116	TAAC	2	8	22727	22734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004116	AGCG	2	8	22815	22822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004116	TGGT	2	8	23480	23487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004116	AGCC	2	8	23697	23704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_004116	GTAA	2	8	24152	24159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004116	GAAG	2	8	24234	24241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004116	GCGA	2	8	24308	24315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_004116	ATTC	2	8	25174	25181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_004116	CTAA	2	8	25530	25537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004116	TAGG	2	8	26185	26192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004116	TATT	2	8	28009	28016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004116	GCGT	2	8	28178	28185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_004116	ATTA	2	8	30285	30292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004116	AATT	2	8	33438	33445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004116	TAAA	2	8	35679	35686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004116	GGAA	2	8	36469	36476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004116	TAGA	2	8	40513	40520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004116	TAGT	2	8	43254	43261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004116	ACTA	2	8	47415	47422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004116	AGAA	2	8	59310	59317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004116	AGTT	2	8	64004	64011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004116	TAAG	2	8	65099	65106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004116	GAAA	2	8	74732	74739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004116	TAAA	2	8	82797	82804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004116	ATTA	2	8	83093	83100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004116	ATTT	2	8	87307	87314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004116	AATC	2	8	90660	90667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_004116	ACGA	2	8	91116	91123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004116	GTTA	2	8	91408	91415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004116	GTGA	2	8	91621	91628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004116	TAAC	2	8	91704	91711	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004116	AGCG	2	8	91792	91799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004116	TGGT	2	8	92457	92464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004116	AGCC	2	8	92674	92681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_004116	GTAA	2	8	93129	93136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004116	GAAG	2	8	93211	93218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004116	GCGA	2	8	93285	93292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004116	ATTC	2	8	94151	94158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004116	CTAA	2	8	94507	94514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_004116	TAGG	2	8	95162	95169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004116	GCGT	2	8	96791	96798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004116	GATA	2	8	97650	97657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004116	GTAT	2	8	98840	98847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004116	TTCT	2	8	99054	99061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_004116	TAAA	2	8	107298	107305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004116	TCTA	2	8	115011	115018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004116	ATCA	2	8	115850	115857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_004116	AACT	2	8	115880	115887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004116	ACTT	2	8	119234	119241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004116	CAGA	2	8	121451	121458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_004116	AAAT	2	8	134028	134035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004116	AATA	2	8	134073	134080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004116	GAAA	2	8	138793	138800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004116	GAAG	2	8	138823	138830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004116	TTAT	2	8	142431	142438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004116	AAAT	2	8	142671	142678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004116	ATCA	2	8	142695	142702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_004116	ATGA	2	8	142777	142784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004116	CGAT	2	8	142839	142846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004116	TGAA	2	8	142892	142899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004116	ACAA	2	8	145991	145998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004116	AGGA	2	8	145999	146006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004116	AAAG	2	8	154803	154810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004116	TAAA	2	8	158971	158978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004116	AAAG	2	8	160845	160852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004116	ACGA	2	8	165145	165152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004116	GTTA	2	8	165437	165444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004116	GTGA	2	8	165650	165657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004116	TAAC	2	8	165733	165740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_004116	AGCG	2	8	165821	165828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_004116	TGGT	2	8	166486	166493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004116	AGCC	2	8	166703	166710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_004116	GTAA	2	8	167158	167165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004116	GAAG	2	8	167240	167247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004116	GCGA	2	8	167314	167321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004116	ATTC	2	8	168180	168187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_004116	CTAA	2	8	168536	168543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004116	TAGG	2	8	169191	169198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004116	CTAT	2	8	171253	171260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004116	GATT	2	8	171261	171268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004116	CCAA	2	8	174024	174031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004116	ACCT	2	8	174328	174335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_004116	AGAC	2	8	174832	174839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004116	TGTT	2	8	174928	174935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004116	TTTG	2	8	190046	190053	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004116	TTAA	2	8	196055	196062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004116	TGAC	2	8	196139	196146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004116	AAGG	2	8	202524	202531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004116	ATTT	2	8	209063	209070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004116	TTTC	2	8	213177	213184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_004116	ATTC	2	8	213215	213222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004116	TGAT	2	8	216404	216411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004116	ATTT	2	8	221988	221995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004116	AATG	2	8	222056	222063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004116	AGCC	2	8	228992	228999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_004116	TTTA	2	8	230199	230206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004116	ATTC	2	8	239488	239495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_004116	TTGA	2	8	239594	239601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004116	TTGT	2	8	239626	239633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004116	TTTA	2	8	240377	240384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004116	TTTA	2	8	240386	240393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004116	ATTG	2	8	240435	240442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004116	ACGA	2	8	250271	250278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_004116	GTTA	2	8	250564	250571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004116	GTGA	2	8	250777	250784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004116	TAAC	2	8	250860	250867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004116	AGCG	2	8	250948	250955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_004116	TGGT	2	8	251613	251620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004116	AGCC	2	8	251830	251837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_004116	GTAA	2	8	252285	252292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004116	GAAG	2	8	252367	252374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004116	GCGA	2	8	252441	252448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004116	ATTC	2	8	253307	253314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_004116	CTAA	2	8	253663	253670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004116	TAGG	2	8	254318	254325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004116	GCGT	2	8	255707	255714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004116	ATTA	2	8	256445	256452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004116	AATT	2	8	256548	256555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004116	CAAG	2	8	257131	257138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_004116	TATT	2	8	259501	259508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004116	TGTT	2	8	259601	259608	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004116	ATTT	2	8	259910	259917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004116	ATAA	2	8	259941	259948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004116	TAAA	2	8	260094	260101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004116	GAAG	2	8	261108	261115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004116	TAAA	2	8	261155	261162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004116	GTTT	2	8	261390	261397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004116	TTAT	2	8	261643	261650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004116	AAGG	2	8	262315	262322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004116	TCAT	2	8	263641	263648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_004116	TAAA	2	8	263704	263711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004116	AAAT	2	8	263873	263880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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