MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 3758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004116	TTC	2	6	21	26	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004116	AAT	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004116	GAA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004116	CTA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004116	TAC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004116	ATG	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004116	AAT	2	6	3928	3933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004116	AAT	2	6	3965	3970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004116	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004116	GGT	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004116	TCT	2	6	4401	4406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004116	TCT	2	6	4422	4427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004116	ATA	2	6	4438	4443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004116	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004116	AAG	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004116	TTA	2	6	9876	9881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004116	ATC	2	6	10029	10034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004116	TCA	2	6	15913	15918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004116	AAG	2	6	16017	16022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004116	CAA	2	6	16063	16068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004116	ATA	2	6	16092	16097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004116	AAC	2	6	16211	16216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004116	GGC	2	6	16441	16446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004116	TGA	2	6	16497	16502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004116	CGA	2	6	16686	16691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004116	GCA	2	6	16760	16765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004116	CGC	2	6	16807	16812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_004116	TGT	2	6	16846	16851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004116	AGA	2	6	16855	16860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004116	CAG	2	6	16929	16934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004116	GGA	2	6	17054	17059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004116	GGA	2	6	17119	17124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004116	GAA	2	6	17383	17388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004116	GGT	2	6	17457	17462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004116	GTC	2	6	17471	17476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004116	CAT	2	6	17539	17544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004116	TAA	2	6	17574	17579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004116	GGA	2	6	17583	17588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004116	ATC	2	6	17607	17612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004116	CGC	2	6	17773	17778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_004116	CAC	2	6	17818	17823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_004116	GAT	2	6	17889	17894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004116	CCT	2	6	17945	17950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_004116	AGG	2	6	18047	18052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004116	TAA	2	6	18228	18233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004116	GAA	2	6	18281	18286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004116	ACG	2	6	18298	18303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004116	TAG	2	6	18469	18474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004116	AGG	2	6	18491	18496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004116	AGA	2	6	18556	18561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004116	TCG	2	6	18660	18665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004116	GGA	2	6	18673	18678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004116	ACA	2	6	18791	18796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004116	ATG	2	6	18858	18863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004116	TGT	2	6	18928	18933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004116	GGA	2	6	18991	18996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004116	ACC	2	6	19256	19261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_004116	AGC	2	6	19336	19341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004116	AAG	2	6	19473	19478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004116	GAG	2	6	19488	19493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004116	ACA	2	6	19644	19649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004116	GAG	2	6	19788	19793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004116	TAG	2	6	19801	19806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004116	GAT	2	6	20047	20052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004116	CGG	2	6	20138	20143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004116	GTT	2	6	20398	20403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004116	TAC	2	6	20408	20413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_004116	CCT	2	6	20496	20501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_004116	GGT	2	6	20632	20637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004116	TCG	2	6	20747	20752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004116	CGT	2	6	20827	20832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004116	AGT	2	6	21283	21288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004116	TAG	2	6	21645	21650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004116	CGT	2	6	21821	21826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004116	ATA	2	6	21926	21931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004116	CTC	2	6	21995	22000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_004116	GGC	2	6	22272	22277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004116	TGA	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004116	CGA	2	6	22517	22522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_004116	GCA	2	6	22591	22596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004116	CGC	2	6	22638	22643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_004116	TGT	2	6	22677	22682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004116	AGA	2	6	22686	22691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004116	CAG	2	6	22760	22765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004116	GGA	2	6	22885	22890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004116	GGA	2	6	22950	22955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004116	GAA	2	6	23214	23219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004116	GGT	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004116	GTC	2	6	23302	23307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004116	CAT	2	6	23370	23375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004116	TAA	2	6	23405	23410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004116	GGA	2	6	23414	23419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004116	ATC	2	6	23438	23443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004116	CGC	2	6	23604	23609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_004116	CAC	2	6	23649	23654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_004116	GAT	2	6	23720	23725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004116	CCT	2	6	23776	23781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_004116	AGG	2	6	23878	23883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004116	TAA	2	6	24059	24064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004116	GAA	2	6	24112	24117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004116	ACG	2	6	24129	24134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_004116	TAG	2	6	24300	24305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004116	AGG	2	6	24322	24327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004116	AGA	2	6	24387	24392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004116	TCG	2	6	24491	24496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004116	GGA	2	6	24504	24509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004116	ACA	2	6	24622	24627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004116	ATG	2	6	24689	24694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004116	TGT	2	6	24759	24764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004116	GGA	2	6	24822	24827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004116	ACC	2	6	25087	25092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_004116	AGC	2	6	25167	25172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_004116	AAG	2	6	25304	25309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004116	GAG	2	6	25319	25324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004116	ACA	2	6	25475	25480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004116	GAG	2	6	25619	25624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004116	TAG	2	6	25632	25637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004116	GAT	2	6	25878	25883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004116	CGG	2	6	25969	25974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004116	GTT	2	6	26229	26234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004116	TAC	2	6	26239	26244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004116	CCT	2	6	26327	26332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_004116	GGT	2	6	26463	26468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004116	TCG	2	6	26578	26583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004116	CGT	2	6	26658	26663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004116	AGT	2	6	27114	27119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004116	TAG	2	6	27476	27481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004116	CGT	2	6	27652	27657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004116	ATA	2	6	27757	27762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004116	CTC	2	6	27826	27831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_004116	CCG	2	6	28002	28007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_004116	GGA	2	6	28119	28124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004116	TCC	2	6	28202	28207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_004116	AGC	2	6	28229	28234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004116	TCG	2	6	28243	28248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004116	CGG	2	6	28342	28347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004116	TAT	2	6	28370	28375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004116	TGT	2	6	28426	28431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004116	GGT	2	6	28506	28511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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