MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003385	TTAT	2	8	676	683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003385	TAAG	2	8	2727	2734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003385	CGTT	2	8	6212	6219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003385	CGAG	2	8	6235	6242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003385	TACT	2	8	6259	6266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003385	GAAA	2	8	6867	6874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003385	ATTA	2	8	6925	6932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003385	TCGT	2	8	13039	13046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003385	GCAG	2	8	18176	18183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003385	TATT	2	8	22313	22320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003385	GCTC	2	8	23112	23119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003385	TCAT	2	8	23196	23203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003385	AGCC	2	8	23396	23403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_003385	GCTG	2	8	23478	23485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003385	AACC	2	8	23515	23522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_003385	GTAT	2	8	23672	23679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003385	TAAG	2	8	23754	23761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003385	TACT	2	8	26448	26455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003385	TTAC	2	8	31963	31970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003385	ACTT	2	8	37625	37632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003385	CTTA	2	8	53361	53368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003385	TACC	2	8	56955	56962	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003385	TACT	3	12	65928	65939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003385	TATT	2	8	69210	69217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003385	CACC	2	8	69219	69226	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_003385	ATTT	2	8	69271	69278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003385	AAAG	2	8	71036	71043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003385	GGTG	2	8	71685	71692	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003385	TAGG	2	8	72596	72603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003385	CAAA	2	8	72619	72626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003385	TATG	2	8	74037	74044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003385	TGCG	2	8	75205	75212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003385	GGTG	2	8	75245	75252	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003385	GGTG	2	8	75305	75312	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003385	TTAT	2	8	75590	75597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003385	GATT	2	8	75729	75736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003385	TAAA	2	8	77641	77648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003385	AGCC	2	8	85539	85546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003385	CGTG	2	8	86297	86304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003385	ACTT	2	8	86335	86342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003385	CGAA	2	8	86376	86383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_003385	GTGA	2	8	86384	86391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003385	CGAA	2	8	86401	86408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003385	CCCA	2	8	86742	86749	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_003385	AATC	2	8	86767	86774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003385	TTAT	2	8	87218	87225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003385	AACT	2	8	87247	87254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003385	TACC	2	8	87883	87890	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003385	CAAA	2	8	87918	87925	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003385	TACA	2	8	92730	92737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003385	AAGT	2	8	102153	102160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003385	ACGG	2	8	102257	102264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003385	GTTT	2	8	104410	104417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003385	AAAT	2	8	105949	105956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003385	ACGC	2	8	106299	106306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.